More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1080 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_1080  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  473  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0694  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  72.93 
 
 
229 aa  358  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0637  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  72.49 
 
 
229 aa  357  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872179  normal  0.213307 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0539  HAD family hydrolase  69.33 
 
 
231 aa  338  5e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0493  phosphoglycolate phosphatase  62.22 
 
 
228 aa  307  7e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0489  HAD superfamily hydrolase  62.22 
 
 
228 aa  307  7e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  61.33 
 
 
230 aa  306  2e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0762  HAD family hydrolase  52.04 
 
 
229 aa  248  7e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  44.49 
 
 
230 aa  222  3e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  40.72 
 
 
232 aa  175  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4948  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.4 
 
 
223 aa  165  6e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0996  HAD family hydrolase  41.67 
 
 
219 aa  163  2e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0106068 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  43.72 
 
 
217 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  40.76 
 
 
217 aa  161  8e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0467  HAD family hydrolase  41.1 
 
 
219 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  39.81 
 
 
223 aa  156  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0418  HAD family hydrolase  39.63 
 
 
228 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  39.09 
 
 
242 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  38.71 
 
 
252 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  37.5 
 
 
218 aa  148  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.71 
 
 
228 aa  148  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.157588 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  40.86 
 
 
222 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0453  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.36 
 
 
219 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6015  HAD family hydrolase  37.16 
 
 
228 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0642  HAD family hydrolase  38.01 
 
 
255 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.911495  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  37.16 
 
 
244 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2687  HAD family hydrolase  37.16 
 
 
244 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2716  HAD family hydrolase  37.16 
 
 
228 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4176  HAD family hydrolase  38.89 
 
 
218 aa  141  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.21 
 
 
228 aa  139  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2179  HAD family hydrolase  40.11 
 
 
223 aa  139  4e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.21 
 
 
228 aa  139  4e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2605  HAD family hydrolase  36.7 
 
 
240 aa  139  5e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  36.7 
 
 
240 aa  138  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0896  HAD-superfamily hydrolase  37.16 
 
 
228 aa  138  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2363  HAD-superfamily hydrolase  37.16 
 
 
228 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0716  haloacid dehalogenase, IA family protein  37.16 
 
 
228 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2715  HAD-superfamily hydrolase  37.16 
 
 
228 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0730  haloacid dehalogenase, IA family protein  37.16 
 
 
228 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2443  HAD-superfamily hydrolase  37.16 
 
 
228 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151709  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5978  HAD family hydrolase  36.84 
 
 
230 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3293  HAD family hydrolase  37.21 
 
 
245 aa  137  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0231  HAD-superfamily hydrolase  37.16 
 
 
228 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  36.99 
 
 
216 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0734377  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.04 
 
 
231 aa  135  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513371  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0596  HAD-superfamily hydrolase  36.24 
 
 
240 aa  133  2e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0610  HAD family hydrolase  35.32 
 
 
260 aa  133  2e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  38.5 
 
 
248 aa  134  2e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0637  HAD family hydrolase  38.03 
 
 
230 aa  130  1e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.57 
 
 
226 aa  130  2e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  36.11 
 
 
224 aa  130  2e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4120  HAD family hydrolase  31.98 
 
 
237 aa  130  2e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  35.48 
 
 
225 aa  130  2e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  36.11 
 
 
231 aa  129  5e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.71 
 
 
214 aa  128  9e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  33.49 
 
 
228 aa  126  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  36.02 
 
 
223 aa  125  4e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  36.02 
 
 
223 aa  125  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6257  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.09 
 
 
240 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.766914 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.59 
 
 
229 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2077  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.84 
 
 
231 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0155497  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.4 
 
 
232 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0336  HAD-superfamily hydrolase  36.7 
 
 
232 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438572  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2468  HAD-superfamily hydrolase  36.7 
 
 
232 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0634  HAD-superfamily hydrolase  36.7 
 
 
232 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.535941  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0082  HAD family hydrolase  36.7 
 
 
232 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0196618  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3578  hypothetical protein  38.68 
 
 
227 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  32.88 
 
 
246 aa  123  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3573  hypothetical protein  36.51 
 
 
224 aa  122  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141866  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1038  HAD-superfamily hydrolase  36.24 
 
 
232 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1330  HAD family hydrolase  36.7 
 
 
230 aa  122  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0879  HAD family hydrolase  36.24 
 
 
232 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  32.62 
 
 
224 aa  122  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0698  HAD-superfamily hydrolase  36.41 
 
 
232 aa  121  1e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  36.04 
 
 
229 aa  121  1e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  35.56 
 
 
214 aa  120  1e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  33.96 
 
 
223 aa  120  1e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0875  HAD family hydrolase  33.77 
 
 
232 aa  120  2e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0330  HAD family hydrolase  37.33 
 
 
225 aa  120  2e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0268  HAD family hydrolase  31.7 
 
 
225 aa  119  4e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3243  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.4 
 
 
237 aa  119  4e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0124526  normal  0.9958 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  33.63 
 
 
227 aa  118  8e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1899  HAD family hydrolase  35.18 
 
 
233 aa  117  1e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629061  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5788  HAD family hydrolase  35.45 
 
 
227 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.438539 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  35.62 
 
 
235 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3747  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.09 
 
 
229 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.422409  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4216  6-phosphogluconate phosphatase  32 
 
 
223 aa  115  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3773  HAD family hydrolase  38.74 
 
 
220 aa  115  7e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0723  HAD family hydrolase  34.07 
 
 
240 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272248  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2473  HAD family hydrolase  34.43 
 
 
230 aa  110  1e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0237734  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4727  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.14 
 
 
230 aa  110  1e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3445  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.65 
 
 
229 aa  111  1e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2303  HAD family hydrolase  32.58 
 
 
230 aa  110  2e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432343  normal  0.0684019 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0442  HAD family hydrolase  33.94 
 
 
218 aa  109  4e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11460  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.16 
 
 
233 aa  108  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0237278  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3929  6-phosphogluconate phosphatase  30.3 
 
 
221 aa  108  7e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4224  6-phosphogluconate phosphatase  30.3 
 
 
221 aa  108  7e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4279  6-phosphogluconate phosphatase  30.3 
 
 
221 aa  108  7e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03543  hypothetical protein  30.3 
 
 
221 aa  108  7e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03599  predicted hydrolase  30.3 
 
 
221 aa  108  7e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>