More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1075 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  76.16 
 
 		 471 aa  700    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1075  threonine synthase  100 
 
 		 435 aa  895    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.515489  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  75 
 
 		 474 aa  690    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  76.39 
 
 		 465 aa  688    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  67.67 
 
 		 468 aa  617  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  67.21 
 
 		 463 aa  608  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  67.21 
 
 		 463 aa  608  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  65.36 
 
 		 465 aa  596  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  60.55 
 
 		 467 aa  540  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  60.92 
 
 		 470 aa  537  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  61.89 
 
 		 470 aa  535  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  60.92 
 
 		 470 aa  536  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  61.06 
 
 		 476 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  60.92 
 
 		 470 aa  534  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  60.92 
 
 		 472 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  60.23 
 
 		 470 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  60.83 
 
 		 471 aa  528  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  60.46 
 
 		 471 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  60.69 
 
 		 472 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  60.6 
 
 		 471 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  60.69 
 
 		 472 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  58.99 
 
 		 472 aa  514  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  58.53 
 
 		 472 aa  511  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  58.08 
 
 		 461 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  58.31 
 
 		 461 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  56.51 
 
 		 473 aa  496  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  57.61 
 
 		 461 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  55.28 
 
 		 471 aa  486  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  53.95 
 
 		 463 aa  476  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  55.04 
 
 		 463 aa  475  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  54.17 
 
 		 462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  52.86 
 
 		 469 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  53.09 
 
 		 469 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  52.86 
 
 		 469 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  53.09 
 
 		 469 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  51.95 
 
 		 469 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  52.07 
 
 		 470 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  51.03 
 
 		 469 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  52.86 
 
 		 469 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  52.98 
 
 		 465 aa  457  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  51.83 
 
 		 469 aa  453  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  52.06 
 
 		 469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  53.09 
 
 		 469 aa  448  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  52.45 
 
 		 465 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  51.61 
 
 		 469 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  51.52 
 
 		 461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  52.41 
 
 		 465 aa  444  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  52.46 
 
 		 462 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  51.05 
 
 		 465 aa  437  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  49.66 
 
 		 466 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  50 
 
 		 462 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1413  threonine synthase  50.11 
 
 		 466 aa  418  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  48.03 
 
 		 461 aa  408  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  46.87 
 
 		 460 aa  407  1.0000000000000001e-112  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0921  threonine synthase  49.89 
 
 		 473 aa  405  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.400205  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1787  threonine synthase  50.7 
 
 		 467 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  47.43 
 
 		 461 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  46.65 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  49.76 
 
 		 459 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  48.01 
 
 		 460 aa  393  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  45.73 
 
 		 460 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  44.65 
 
 		 463 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  47.22 
 
 		 458 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  46.3 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49056  predicted protein  44.11 
 
 		 504 aa  355  8.999999999999999e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3635  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  40.87 
 
 		 511 aa  337  1.9999999999999998e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  41.06 
 
 		 453 aa  335  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0844  threonine synthase  40.67 
 
 		 480 aa  333  3e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1542  threonine synthase  40.92 
 
 		 470 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2230  threonine synthase  41.59 
 
 		 475 aa  323  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0456531  hitchhiker  0.000150597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2024  threonine synthase  41.32 
 
 		 472 aa  323  3e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2558  threonine synthase  41.26 
 
 		 476 aa  323  5e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3205  threonine synthase  41.26 
 
 		 476 aa  323  5e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.87945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1965  threonine synthase  40.67 
 
 		 481 aa  318  9e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000623225  normal  0.345947 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03031  threonine synthase (Eurofung)  40.82 
 
 		 517 aa  316  4e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0991235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2191  threonine synthase  41.1 
 
 		 476 aa  316  4e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2379  threonine synthase  39.95 
 
 		 476 aa  315  7e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499285 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5218  threonine synthase  41.12 
 
 		 475 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1239  threonine synthase  40.9 
 
 		 481 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928598 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2382  threonine synthase  39.37 
 
 		 475 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1550  threonine synthase  40 
 
 		 477 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0932  threonine synthase  39.69 
 
 		 482 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0905  threonine synthase  39.78 
 
 		 475 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1049  threonine synthase  39.78 
 
 		 475 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0439  threonine synthase  38.58 
 
 		 480 aa  311  1e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1992  threonine synthase  39.69 
 
 		 482 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.59038  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2199  threonine synthase  39.38 
 
 		 483 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000410505  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1832  threonine synthase  41.04 
 
 		 471 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2231  threonine synthase  39.82 
 
 		 483 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2269  threonine synthase  39.6 
 
 		 483 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.080234  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0023  threonine synthase  39.6 
 
 		 483 aa  309  8e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1874  threonine synthase  39.6 
 
 		 483 aa  309  8e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1384  threonine synthase  39.6 
 
 		 483 aa  309  8e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2395  threonine synthase  39.6 
 
 		 483 aa  309  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1763  threonine synthase  39.6 
 
 		 483 aa  309  8e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.158411 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1146  threonine synthase  39.6 
 
 		 483 aa  309  8e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0318378  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1913  threonine synthase  39.1 
 
 		 475 aa  308  9e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.142116  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01150  threonine synthase, putative  38.84 
 
 		 547 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.779366  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1420  threonine synthase  39.47 
 
 		 483 aa  307  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226673  normal  0.0367452 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2380  threonine synthase  38.98 
 
 		 483 aa  306  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.782631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>