More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1009 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  100 
 
 		 318 aa  647    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  73.65 
 
 		 322 aa  484  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  64.44 
 
 		 318 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  63.49 
 
 		 318 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  56.21 
 
 		 324 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  59.81 
 
 		 334 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  54.35 
 
 		 324 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  54.74 
 
 		 369 aa  359  3e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  54.6 
 
 		 345 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  57.46 
 
 		 334 aa  351  8.999999999999999e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  54.78 
 
 		 333 aa  350  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  52.3 
 
 		 316 aa  322  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  47.45 
 
 		 316 aa  315  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  49.51 
 
 		 310 aa  315  6e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  49.68 
 
 		 319 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  47.62 
 
 		 316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  47.6 
 
 		 320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  49.68 
 
 		 317 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  47.28 
 
 		 320 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  47.28 
 
 		 320 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  49.68 
 
 		 317 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  49.68 
 
 		 317 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  49.68 
 
 		 317 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  49.68 
 
 		 317 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  48.56 
 
 		 320 aa  311  9e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  49.36 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  47.95 
 
 		 319 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  49.36 
 
 		 317 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  47.8 
 
 		 319 aa  309  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  49.68 
 
 		 318 aa  308  5.9999999999999995e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  47.48 
 
 		 319 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  45.74 
 
 		 322 aa  308  6.999999999999999e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  46.82 
 
 		 316 aa  308  9e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  46.98 
 
 		 316 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  49.5 
 
 		 306 aa  305  7e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  48.38 
 
 		 318 aa  305  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  48.38 
 
 		 330 aa  305  7e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1967  agmatinase  46.52 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0638038  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  48.05 
 
 		 329 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  48.05 
 
 		 354 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  48.05 
 
 		 354 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  47.73 
 
 		 329 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  48.05 
 
 		 318 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  48.05 
 
 		 342 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  47.73 
 
 		 318 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  47.73 
 
 		 318 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  46.15 
 
 		 315 aa  297  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  45.95 
 
 		 315 aa  297  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  47.42 
 
 		 315 aa  292  5e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  45.45 
 
 		 318 aa  289  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  48.37 
 
 		 324 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  46.23 
 
 		 321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  44.3 
 
 		 315 aa  265  8e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  45.25 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  44.44 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  46.77 
 
 		 317 aa  261  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  43 
 
 		 315 aa  259  4e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  45.25 
 
 		 313 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  45.25 
 
 		 313 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  45.25 
 
 		 313 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  42.62 
 
 		 329 aa  257  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  42.95 
 
 		 320 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  43.31 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2025  agmatinase  49.3 
 
 		 353 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.298316  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5122  agmatinase  49.3 
 
 		 356 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  42.99 
 
 		 320 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4872  agmatinase  46.86 
 
 		 351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739258  normal  0.617113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  43.95 
 
 		 322 aa  252  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  43.83 
 
 		 327 aa  252  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  44.92 
 
 		 326 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  44.92 
 
 		 326 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  44.92 
 
 		 326 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  43.71 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  42.95 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  45.25 
 
 		 315 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  43.75 
 
 		 321 aa  250  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  41.29 
 
 		 354 aa  249  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  41.29 
 
 		 378 aa  250  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4643  agmatinase  44.74 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  46.2 
 
 		 352 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  40.39 
 
 		 324 aa  248  9e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  42.02 
 
 		 316 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  47.9 
 
 		 351 aa  246  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  44.08 
 
 		 337 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  43.73 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6439  agmatinase  44.74 
 
 		 351 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0137522 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  42.35 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  42.63 
 
 		 324 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  40.85 
 
 		 319 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  40.85 
 
 		 319 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  40.85 
 
 		 319 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  45.54 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  41.82 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3988  agmatinase  43.33 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0861741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  44.59 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  44.59 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  44.59 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  41.33 
 
 		 311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  38.83 
 
 		 338 aa  226  6e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  40 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>