126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1006 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1006  ABC transporter membrane spanning protein  100 
 
 		 206 aa  398  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0502  cobalt transport protein  50.25 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0623  cobalt transport protein  49.25 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303566  normal  0.0342119 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0582  cobalt transport protein  50 
 
 		 202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3687  cobalt transport protein  34.67 
 
 		 210 aa  90.5  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1067  cobalt transport protein  33.51 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  36.87 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2312  putative cobalt transport system permease protein  31.96 
 
 		 198 aa  84.7  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2320  cobalt transport protein  35.38 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1853  cobalt transport protein  30.65 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00024219 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1539  cobalt transport protein  35.38 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1527  cobalt transport protein  38.58 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3226  cobalt transport protein  31.94 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3687  cobalt transport protein  33.5 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3288  cobalt transport protein  31.05 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.972587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  23.32 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2004  cobalt transport protein  33.85 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.288516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2111  cobalt transport protein  30.77 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0552533  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1730  cobalt transport protein  30.81 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4600  cobalt transport protein  30.26 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.610496  normal  0.640124 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2319  hypothetical protein  35.95 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  32.44 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0506  cobalt transport protein  34.48 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5032  cobalt transport protein  35.68 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.298232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2174  ABC transporter inner membrane protein  32.46 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4656  cobalt transport protein  33.85 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.365501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  25.11 
 
 		 267 aa  67  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  26.38 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  28.37 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  27.75 
 
 		 264 aa  64.7  0.0000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  25.96 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  25.96 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  25.96 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  25.96 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  25.96 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  32.62 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  25.96 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  25.96 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  28.19 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  25.96 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0846  cobalt transport protein  33.09 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  24.89 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3462  cobalt transport protein  29.69 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  32 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  32 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  27.27 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  28.19 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  30.16 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  29.13 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  30.5 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  28.79 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12580  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  33.57 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  24.89 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5458  cobalt transport protein  36.79 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00259272  normal  0.0904003 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  25.11 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  29.29 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  29.55 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  26.14 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  30 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1332  cobalt transport protein  34.95 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256618  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  24.78 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  26.71 
 
 		 266 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  32.64 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  29.79 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  26.71 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  31.54 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  31.54 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2425  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  26.52 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  27.27 
 
 		 287 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  30.46 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  31.72 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  28.46 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2462  cobalt transport protein  26.52 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2642  cobalt transport protein  26.52 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.357292  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2659  cobalt transport protein  26.52 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000035997 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2300  cobalt ABC transporter permease protein  32.71 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000489641  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25.11 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07520  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  25.94 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.508014 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  30.08 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  27.14 
 
 		 275 aa  54.3  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  29.84 
 
 		 438 aa  54.3  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01760  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  31.4 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.975631 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1157  cobalt transport protein  27.78 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.930884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3351  cobalt transport protein  26.67 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  26.87 
 
 		 810 aa  53.9  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  25.88 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  34.96 
 
 		 266 aa  52.8  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.33 
 
 		 276 aa  53.1  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  24.31 
 
 		 276 aa  52.4  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  26.92 
 
 		 332 aa  52.8  0.000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5279  cobalt transport protein  28.08 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5368  cobalt transport protein  28.08 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5658  cobalt transport protein  28.08 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  26.09 
 
 		 265 aa  52.4  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20540  Cobalt transport protein  27.36 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  26.52 
 
 		 273 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  31.18 
 
 		 293 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3075  cobalt transport protein  37.38 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2707  cobalt transport protein  27.08 
 
 		 277 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2764  cobalt transport protein  27.08 
 
 		 277 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>