219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0927 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2327  K potassium transporter  56.64 
 
 		 658 aa  678    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0551  K potassium transporter  77.95 
 
 		 632 aa  1013    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2565  K potassium transporter  64.11 
 
 		 633 aa  754    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2222  K potassium transporter  56.69 
 
 		 629 aa  671    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.569984  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  54.93 
 
 		 634 aa  659    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  53.4 
 
 		 651 aa  660    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  54.46 
 
 		 637 aa  638    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0308  K potassium transporter  54.6 
 
 		 637 aa  644    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1238  K+ potassium transporter  57.46 
 
 		 651 aa  669    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.261795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  54.73 
 
 		 633 aa  681    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1877  K potassium transporter  57.98 
 
 		 668 aa  684    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.119842  normal  0.0678898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5357  K potassium transporter  58.14 
 
 		 656 aa  695    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00124872  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0927  potassium uptake protein  100 
 
 		 634 aa  1268    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137865  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  55.19 
 
 		 637 aa  648    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  55.63 
 
 		 630 aa  704    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  55.59 
 
 		 634 aa  676    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1497  K+ potassium transporter  57.33 
 
 		 666 aa  669    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1262  K potassium transporter  57.42 
 
 		 643 aa  689    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0285347 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1596  K potassium transporter  57.98 
 
 		 668 aa  684    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923122  normal  0.0938769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  53.87 
 
 		 636 aa  644    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3932  K potassium transporter  58.63 
 
 		 672 aa  704    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0963001  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5050  K potassium transporter  57.82 
 
 		 657 aa  682    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4765  K potassium transporter  54.59 
 
 		 652 aa  669    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.266428 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  56.15 
 
 		 633 aa  688    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0508  K potassium transporter  78.64 
 
 		 632 aa  1004    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3512  Kup family low affinity potassium transporter  56.54 
 
 		 632 aa  700    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3513  Kup family low affinity potassium transporter  55.83 
 
 		 640 aa  677    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  53.24 
 
 		 651 aa  658    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2252  K potassium transporter  63.95 
 
 		 633 aa  768    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6041  K potassium transporter  68.37 
 
 		 633 aa  869    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420233  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6370  K potassium transporter  66.93 
 
 		 633 aa  855    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0444  K potassium transporter  73.34 
 
 		 630 aa  962    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0753432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1643  K potassium transporter  58.63 
 
 		 670 aa  693    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  55.02 
 
 		 651 aa  677    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  56.38 
 
 		 633 aa  686    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3926  K potassium transporter  51.62 
 
 		 641 aa  615  1e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147688 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0101  K+ potassium transporter  51.25 
 
 		 648 aa  607  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1122  K potassium transporter  54.34 
 
 		 569 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  48.2 
 
 		 630 aa  579  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  47.08 
 
 		 632 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1512  K+ potassium transporter  50.08 
 
 		 634 aa  571  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  46.41 
 
 		 626 aa  566  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  46.61 
 
 		 628 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0629  K potassium transporter  44.39 
 
 		 664 aa  566  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0514546 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0976  potassium uptake protein, Kup system  47.52 
 
 		 626 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  46.77 
 
 		 631 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  46.19 
 
 		 636 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  46.46 
 
 		 631 aa  561  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  47.03 
 
 		 627 aa  558  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  48.16 
 
 		 631 aa  557  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1331  potassium uptake protein  47.27 
 
 		 630 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00641911  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  44.81 
 
 		 621 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2341  kup system potassium uptake protein  47.43 
 
 		 660 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357755  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  46.45 
 
 		 622 aa  555  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  46.55 
 
 		 656 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1820  potassium uptake protein  47.27 
 
 		 630 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0076  potassium uptake protein  47.27 
 
 		 630 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2175  potassium uptake protein  47.43 
 
 		 630 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2213  potassium uptake protein  47.43 
 
 		 630 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1092  potassium uptake protein  47.27 
 
 		 622 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0884975  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  46.3 
 
 		 628 aa  558  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2247  potassium uptake protein  46.95 
 
 		 660 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438776  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2539  K+ potassium transporter  46.57 
 
 		 625 aa  555  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  45.54 
 
 		 628 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  45.16 
 
 		 622 aa  548  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1512  K+ potassium transporter  46.96 
 
 		 653 aa  550  1e-155  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312861  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  46.7 
 
 		 620 aa  551  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  45.16 
 
 		 622 aa  550  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4723  K potassium transporter  46.09 
 
 		 640 aa  548  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0485791 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  46.08 
 
 		 624 aa  547  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6716  K potassium transporter  45.26 
 
 		 641 aa  547  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4252  K+ potassium transporter  47.81 
 
 		 641 aa  546  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1737  K+ potassium transporter  45.83 
 
 		 637 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01558  potassium uptake protein  47.01 
 
 		 614 aa  546  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  44.8 
 
 		 622 aa  548  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  46.13 
 
 		 622 aa  548  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  46.76 
 
 		 628 aa  548  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4117  potassium transport protein Kup  44.55 
 
 		 622 aa  545  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0495643 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1710  K potassium transporter  45.98 
 
 		 637 aa  548  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00353606  normal  0.989137 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1052  potassium uptake transmembrane protein  46.67 
 
 		 613 aa  542  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4015  K potassium transporter  47.98 
 
 		 632 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.035438 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1823  K potassium transporter  45.31 
 
 		 638 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0350815  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4387  K potassium transporter  45.81 
 
 		 631 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.635262 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4277  K potassium transporter  45.81 
 
 		 631 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  44.72 
 
 		 620 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6280  K+ potassium transporter  45.31 
 
 		 688 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1799  K+ potassium transporter  45.31 
 
 		 638 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  45.53 
 
 		 620 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  45.44 
 
 		 647 aa  543  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  47.16 
 
 		 639 aa  543  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  45.15 
 
 		 620 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1475  K potassium transporter  45.66 
 
 		 638 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765149  normal  0.163846 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  46.2 
 
 		 633 aa  537  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4902  potassium transport protein Kup  44.93 
 
 		 622 aa  537  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  hitchhiker  0.000280995 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  44.83 
 
 		 628 aa  536  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5100  K+ transporter  45.05 
 
 		 638 aa  538  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  43.46 
 
 		 622 aa  536  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1926  K potassium transporter  46.48 
 
 		 633 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0406918  normal  0.0407314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  44.66 
 
 		 639 aa  537  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4263  potassium transport protein Kup  42.68 
 
 		 622 aa  533  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.704108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>