More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0904 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0210  glutathione-regulated potassium-efflux system protein, putative  59.2 
 
 
635 aa  700    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909712  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0528  potassium efflux system protein  68.09 
 
 
604 aa  807    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0190  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  59.2 
 
 
614 aa  699    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0484  potassium efflux system protein  68.47 
 
 
604 aa  804    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3041  potassium efflux system protein  59.23 
 
 
615 aa  692    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.639601  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0433  potassium efflux system protein  59.59 
 
 
599 aa  647    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0904  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  100 
 
 
608 aa  1201    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0420  potassium efflux system protein  68.2 
 
 
621 aa  795    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.597186 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1668  potassium efflux system protein  49.34 
 
 
610 aa  523  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.228254 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4163  potassium efflux system protein  48.05 
 
 
597 aa  508  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0112  Kef-type K+ transport  50.18 
 
 
606 aa  499  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.187349  hitchhiker  0.00403769 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3951  potassium efflux system protein  44.92 
 
 
657 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.959395 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0186  potassium efflux system protein  47.03 
 
 
588 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2620  potassium efflux system protein  46.32 
 
 
632 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2815  potassium efflux system protein  44.9 
 
 
632 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2592  potassium efflux system protein  44.9 
 
 
632 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0129  potassium efflux system protein  46.68 
 
 
588 aa  457  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.329444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5810  potassium efflux system protein  47.96 
 
 
610 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.408989  normal  0.239098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7264  potassium efflux system protein  47.59 
 
 
630 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5903  potassium efflux system protein  46.05 
 
 
588 aa  452  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455929 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1212  potassium efflux system protein  43.72 
 
 
603 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212928  normal  0.488565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6023  potassium efflux system protein  47.6 
 
 
632 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158915  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2377  potassium efflux system protein  46.34 
 
 
589 aa  440  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58479  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4650  potassium efflux system protein  47.35 
 
 
614 aa  428  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143999  normal  0.284453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3311  glutathione-regulated potassium-proton antiporter  46.32 
 
 
581 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.254489  normal  0.328099 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0266  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  43.09 
 
 
602 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40601  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3930  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  43.09 
 
 
602 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423778  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0377  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  43.58 
 
 
602 aa  421  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3687  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  43.09 
 
 
602 aa  420  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2368  potassium efflux system protein  45.18 
 
 
593 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464067 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0301  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.91 
 
 
604 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.768293  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3825  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.62 
 
 
601 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.450061  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3654  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.43 
 
 
601 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0814431  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3653  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.43 
 
 
601 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155191  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.24 
 
 
601 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.538189  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3762  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.24 
 
 
601 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.581986  normal  0.282948 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1497  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  42.75 
 
 
601 aa  411  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.363259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03201  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  42.91 
 
 
601 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0148329  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0362  potassium efflux system protein  42.73 
 
 
601 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03153  hypothetical protein  42.91 
 
 
601 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156081  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0362  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.91 
 
 
601 aa  404  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507118  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3768  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  41.68 
 
 
601 aa  405  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3632  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.91 
 
 
601 aa  403  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0050352  hitchhiker  0.00031102 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3547  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.91 
 
 
601 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000433295  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3725  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.91 
 
 
601 aa  402  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3820  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.91 
 
 
601 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000303842  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2184  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  40.57 
 
 
600 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000842132  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4560  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.53 
 
 
602 aa  395  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.460103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  41.55 
 
 
620 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2542  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  39.52 
 
 
605 aa  386  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.72276  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1666  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  39.07 
 
 
627 aa  388  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0944  potassium efflux system protein  44.92 
 
 
610 aa  385  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.728384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  41.55 
 
 
620 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0872  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  42.81 
 
 
635 aa  385  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37465  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3845  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.59 
 
 
603 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0003  sodium/hydrogen exchanger  42.76 
 
 
595 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.808331  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.46 
 
 
617 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4025  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  42.41 
 
 
603 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  40.83 
 
 
620 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  41.37 
 
 
620 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.86 
 
 
620 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.83 
 
 
620 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  41.37 
 
 
620 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  38.99 
 
 
620 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  41.46 
 
 
621 aa  382  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  41.01 
 
 
620 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.709743 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  40.83 
 
 
620 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  40.83 
 
 
620 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0300  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  40.26 
 
 
596 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.83 
 
 
620 aa  377  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.68 
 
 
620 aa  378  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.83 
 
 
620 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  39.54 
 
 
628 aa  373  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1020  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  38.89 
 
 
589 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  39.4 
 
 
628 aa  374  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1761  potassium efflux system protein  39.46 
 
 
616 aa  375  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00639423 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00068  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  39.27 
 
 
598 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1296  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  42.5 
 
 
605 aa  368  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00893714 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002286  glutathione-regulated potassium-efflux system protein kefC  39.93 
 
 
598 aa  364  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02890  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  38.31 
 
 
605 aa  364  3e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3376  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  37.41 
 
 
604 aa  362  9e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0554  potassium efflux system protein  37.62 
 
 
624 aa  362  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00935447  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3213  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.3 
 
 
602 aa  361  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3916  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  42.53 
 
 
623 aa  360  6e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.255576 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3379  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  38.23 
 
 
646 aa  359  7e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1237  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  42.23 
 
 
608 aa  359  9e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1166  potassium efflux system protein  36.76 
 
 
585 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4400  potassium efflux system protein  43.14 
 
 
616 aa  358  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199549  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3032  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.38 
 
 
646 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2691  sodium/hydrogen exchanger  42.48 
 
 
581 aa  356  6.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3407  potassium efflux system protein  35.45 
 
 
624 aa  355  8.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229701  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4259  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  38.94 
 
 
607 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1803  sodium/hydrogen exchanger  39.8 
 
 
632 aa  353  4e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436303  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001379  glutathione-regulated potassium-efflux system protein kefC  37.48 
 
 
652 aa  353  5.9999999999999994e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000096581  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4703  potassium efflux system protein  41.59 
 
 
638 aa  352  8.999999999999999e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829451  normal  0.614792 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2361  potassium efflux system protein  38.75 
 
 
618 aa  351  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2868  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  40.14 
 
 
623 aa  351  3e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1225  potassium efflux system protein  37.88 
 
 
642 aa  348  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.403013  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3904  potassium efflux system protein  38.97 
 
 
595 aa  347  5e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.738179  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3068  potassium efflux system protein  33.07 
 
 
631 aa  345  1e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>