81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0860 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  100 
 
 		 183 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  39.63 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  41.01 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  41.01 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  39.63 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  42.86 
 
 		 371 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  40.51 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  38.82 
 
 		 228 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  37.27 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  39.86 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  39.86 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250589 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  37.09 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  44.7 
 
 		 205 aa  104  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  41.67 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  42.75 
 
 		 187 aa  101  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  34.42 
 
 		 248 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  34.71 
 
 		 189 aa  100  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  38.3 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  38.57 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  41.3 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  41.3 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  35.42 
 
 		 240 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  36.05 
 
 		 215 aa  97.1  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  32.1 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  31.82 
 
 		 177 aa  95.9  3e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  34.57 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  34.5 
 
 		 165 aa  95.9  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  40.51 
 
 		 243 aa  94.7  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  35.92 
 
 		 235 aa  94.4  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  40.43 
 
 		 185 aa  94.4  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  36.69 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  33.78 
 
 		 220 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  34.51 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  41.91 
 
 		 144 aa  93.2  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  36.63 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  33.89 
 
 		 233 aa  91.7  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  32.88 
 
 		 240 aa  91.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  40.51 
 
 		 165 aa  91.3  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  40.51 
 
 		 165 aa  91.3  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  32.37 
 
 		 177 aa  91.3  7e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  33.95 
 
 		 579 aa  88.2  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  34.97 
 
 		 248 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  37.98 
 
 		 159 aa  87.8  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  39.55 
 
 		 156 aa  87.4  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  39.55 
 
 		 156 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  39.55 
 
 		 157 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  34.93 
 
 		 233 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000525183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  32.68 
 
 		 165 aa  85.1  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  31.13 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  34.44 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100699 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  32.05 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  38.81 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  36.5 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  43.01 
 
 		 139 aa  73.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  35.29 
 
 		 526 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  35.29 
 
 		 526 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  35.29 
 
 		 526 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  33.97 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0462  prohead peptidase  30.6 
 
 		 248 aa  71.6  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  32.64 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  31.96 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  30.72 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  26.17 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12667  phiRv2 prophage protease  33.78 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.81998e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3425  prohead protease  31.28 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3508  prophage LambdaBa01, prohead protease  31.28 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.677368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3785  prophage lambdaba01, prohead protease  31.28 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3429  HK97 family phage prohead protease  31.71 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  25.17 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4980  prophage LambdaBa03, prohead protease  28.93 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5359  prophage LambdaBa03, prohead protease  28.93 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5838  hypothetical protein  30.52 
 
 		 194 aa  51.2  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  30.56 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  30.56 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0672  HK97 family phage major capsid protein  25.95 
 
 		 506 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2636  HK97 family phage prohead protease  39.02 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00090927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2594  HK97 family phage prohead protease  31.79 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  32.35 
 
 		 198 aa  45.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  31.3 
 
 		 646 aa  45.1  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  25.55 
 
 		 562 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5151  HK97 family phage prohead protease  31.39 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>