More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0789 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  100 
 
 
362 aa  730    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  76.8 
 
 
362 aa  574  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  75.97 
 
 
362 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  75.07 
 
 
362 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  69.36 
 
 
362 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  64.8 
 
 
366 aa  482  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4342  ABC transporter related  63.74 
 
 
366 aa  473  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.949394 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  63.99 
 
 
373 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1150  ABC transporter related  66.85 
 
 
372 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292125  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1516  ABC transporter related  66.57 
 
 
369 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00369229  normal  0.0599486 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2870  ABC alpha-glucoside transporter, ATPase subunit AglK  66.02 
 
 
369 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0548699  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3645  hypothetical protein  65.37 
 
 
374 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.563408  normal  0.0436872 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3303  ABC transporter related  64.12 
 
 
365 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.700812  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1648  maltose/maltodextrin import ATP-binding protein  62.57 
 
 
373 aa  436  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.43035  hitchhiker  0.00000048484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1950  ABC transporter related  61.34 
 
 
377 aa  431  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.303388  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  59.05 
 
 
333 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.22 
 
 
333 aa  412  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.94 
 
 
333 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  55.74 
 
 
379 aa  409  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.58 
 
 
370 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  58.84 
 
 
342 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  55.1 
 
 
371 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  57.69 
 
 
369 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  57.97 
 
 
369 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  58.77 
 
 
358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  58.24 
 
 
369 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  56.32 
 
 
391 aa  405  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  57.42 
 
 
370 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.42 
 
 
370 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  57.37 
 
 
388 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  57.42 
 
 
370 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  57.69 
 
 
369 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  58.45 
 
 
358 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  57.42 
 
 
370 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  57.42 
 
 
370 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  56.2 
 
 
369 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 
370 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  55.77 
 
 
369 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  56.28 
 
 
369 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  57.02 
 
 
369 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  58.26 
 
 
359 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  56.32 
 
 
369 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  57.42 
 
 
368 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3324  ABC transporter-related protein  54.84 
 
 
378 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  57.42 
 
 
368 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  59.38 
 
 
333 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  56.63 
 
 
341 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  55.83 
 
 
361 aa  395  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2353  ABC transporter related  54.67 
 
 
383 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175243  normal  0.108483 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  56.56 
 
 
361 aa  393  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  56.27 
 
 
395 aa  391  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4881  ABC transporter related  57.1 
 
 
384 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3284  ABC transporter related  57.1 
 
 
384 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.875863 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0292  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.95 
 
 
373 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.237925  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  55.77 
 
 
359 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6323  ABC transporter related  56.17 
 
 
384 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6023  ABC transporter related  56.95 
 
 
384 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.963161 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0231  ABC transporter related  55.4 
 
 
363 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.280397  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  55.74 
 
 
361 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  56.94 
 
 
357 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  55.74 
 
 
364 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  57.58 
 
 
357 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.68 
 
 
367 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001327  maltose/maltodextrin transport ATP-binding protein MalK  53.99 
 
 
372 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.704873  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3198  ABC transporter related  55.68 
 
 
382 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.32 
 
 
369 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05213  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.72 
 
 
372 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  55.4 
 
 
361 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5203  ABC transporter related  54.84 
 
 
385 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300266  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5656  ABC transporter related  54.84 
 
 
385 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115239  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  54.4 
 
 
360 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4579  ABC transporter related  54.84 
 
 
385 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000381614 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  55.07 
 
 
360 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1185  maltose/maltodextrin import ATP-binding protein malK  52.83 
 
 
414 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20306  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0240  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.44 
 
 
369 aa  378  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  55.74 
 
 
368 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4584  ABC transporter related  53.49 
 
 
384 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493214  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  55.52 
 
 
359 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.72 
 
 
369 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.72 
 
 
369 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  57.26 
 
 
336 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  54.34 
 
 
342 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.87 
 
 
351 aa  375  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4470  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.12 
 
 
369 aa  378  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258149  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.72 
 
 
369 aa  376  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  55.99 
 
 
333 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4930  ABC transporter related  54.32 
 
 
382 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5485  ABC transporter related  54.32 
 
 
382 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011502 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3960  ABC transporter related protein  52.6 
 
 
371 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4587  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.6 
 
 
371 aa  373  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3244  ABC transporter-related protein  52.65 
 
 
390 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  52.63 
 
 
368 aa  373  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  53.89 
 
 
369 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4487  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.89 
 
 
369 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4275  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.6 
 
 
371 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5516  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.6 
 
 
371 aa  373  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.301255  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4422  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.89 
 
 
369 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00031053 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4624  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.89 
 
 
369 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102994 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3994  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.6 
 
 
371 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.153747  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.61 
 
 
365 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>