More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0749 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  100 
 
 
320 aa  629  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  97.81 
 
 
320 aa  582  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  91.56 
 
 
320 aa  554  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  89.69 
 
 
320 aa  539  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  64.38 
 
 
320 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  58.26 
 
 
321 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  52.94 
 
 
303 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  45.06 
 
 
395 aa  306  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  51.85 
 
 
302 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  51.85 
 
 
303 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  54.21 
 
 
301 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  53.58 
 
 
301 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  51.56 
 
 
302 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  52.34 
 
 
302 aa  292  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  50.62 
 
 
302 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  49.7 
 
 
311 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  43.25 
 
 
321 aa  259  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0331  flagellin domain protein  42.19 
 
 
320 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0363  flagellin domain protein  41.88 
 
 
320 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0920574  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1104  flagellin  49.54 
 
 
311 aa  255  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.830976  normal  0.575801 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2814  flagellin domain protein  45.37 
 
 
332 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2555  flagellin domain protein  45.37 
 
 
332 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3219  flagella associated protein  43.1 
 
 
319 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  64.17 
 
 
395 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  45.79 
 
 
293 aa  222  6e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  59.36 
 
 
395 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  44.55 
 
 
289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  42.52 
 
 
327 aa  205  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  39.56 
 
 
292 aa  201  9e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  37.69 
 
 
328 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  47.13 
 
 
592 aa  170  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  49.1 
 
 
439 aa  166  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1147  flagellin family protein  39.94 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0349  flagellin domain-containing protein  33.52 
 
 
364 aa  159  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5137  flagellin domain-containing protein  42.54 
 
 
461 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  43.96 
 
 
585 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  43.86 
 
 
590 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5136  flagellin domain-containing protein  43.2 
 
 
461 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0578954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3937  flagellin domain-containing protein  43.89 
 
 
494 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0911529  decreased coverage  0.00880768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  31.56 
 
 
282 aa  146  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  33.85 
 
 
282 aa  142  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  30.94 
 
 
281 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  29.5 
 
 
292 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  31.19 
 
 
274 aa  139  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  33.12 
 
 
279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  31.25 
 
 
275 aa  136  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  30.65 
 
 
274 aa  135  9e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  30.98 
 
 
273 aa  132  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  30.43 
 
 
277 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  30.72 
 
 
281 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  30.98 
 
 
273 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0242  flagellin domain protein  39.64 
 
 
582 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  30 
 
 
277 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3878  flagellin  32.3 
 
 
281 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466019  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4162  flagellin domain-containing protein  32.3 
 
 
281 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00770352  normal  0.325059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  31.29 
 
 
273 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1620  flagellin domain-containing protein  31.87 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1052  flagellin family protein  48.89 
 
 
269 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  55.79 
 
 
389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  29.94 
 
 
282 aa  115  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4203  flagellin-like  37.58 
 
 
522 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.618409  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3361  flagellin  38.69 
 
 
516 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2876  flagellin-like  29.23 
 
 
282 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1682  flagellin domain-containing protein  38.06 
 
 
389 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3439  flagellin domain protein  28.99 
 
 
327 aa  97.1  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  37.32 
 
 
380 aa  94.4  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  27.3 
 
 
272 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  27.61 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  28 
 
 
294 aa  77  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  25.91 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  24.39 
 
 
287 aa  68.9  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  25.69 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  24.55 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2534  flagellin-like  25.08 
 
 
298 aa  67  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  24.84 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  24.84 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  34.74 
 
 
432 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  31.91 
 
 
692 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2361  flagellin-like  25.22 
 
 
327 aa  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  35.11 
 
 
405 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  23.85 
 
 
271 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000344656  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  32.2 
 
 
693 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  31.18 
 
 
620 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  32.2 
 
 
630 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  36.17 
 
 
397 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0196  flagellin domain-containing protein  23.68 
 
 
299 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  26.46 
 
 
405 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  24.06 
 
 
271 aa  63.5  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0514  flagellin domain-containing protein  24.16 
 
 
386 aa  63.9  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  35.11 
 
 
399 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  35.11 
 
 
399 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  26.46 
 
 
405 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0108  flagellin domain-containing protein  27.48 
 
 
294 aa  62.8  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  24.84 
 
 
280 aa  62.8  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04961  hypothetical protein  24.54 
 
 
289 aa  62.8  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  27.55 
 
 
288 aa  62.8  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  35.11 
 
 
399 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  23.75 
 
 
271 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  23.75 
 
 
271 aa  62  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  32.98 
 
 
405 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>