More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0718 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  49.65 
 
 		 707 aa  692    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  56.01 
 
 		 713 aa  828    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  47.25 
 
 		 795 aa  635    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  47.45 
 
 		 721 aa  637    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  56.42 
 
 		 713 aa  833    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  54.46 
 
 		 709 aa  696    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  100 
 
 		 724 aa  1472    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  55.7 
 
 		 713 aa  801    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  46.43 
 
 		 795 aa  636    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  49.03 
 
 		 708 aa  632  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  45.8 
 
 		 796 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  49.55 
 
 		 719 aa  631  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  46.32 
 
 		 796 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  44.84 
 
 		 796 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  47.99 
 
 		 810 aa  625  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  44.7 
 
 		 796 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  45.52 
 
 		 809 aa  623  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  44.04 
 
 		 714 aa  593  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  44.04 
 
 		 714 aa  593  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  45 
 
 		 677 aa  591  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  44.83 
 
 		 858 aa  585  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  42.76 
 
 		 863 aa  585  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  44.69 
 
 		 855 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  44.69 
 
 		 855 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  44.2 
 
 		 881 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  44.2 
 
 		 881 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  44.35 
 
 		 882 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  44.2 
 
 		 679 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  44.2 
 
 		 881 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  44.2 
 
 		 921 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  44.2 
 
 		 742 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  44.2 
 
 		 921 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  46.51 
 
 		 781 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  46.13 
 
 		 766 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  45.93 
 
 		 778 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  42.94 
 
 		 827 aa  565  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  43.54 
 
 		 726 aa  551  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  42.6 
 
 		 821 aa  545  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  40.06 
 
 		 706 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  40.25 
 
 		 705 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  42.01 
 
 		 725 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5130  TonB-dependent siderophore receptor  42.15 
 
 		 725 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5026  TonB-dependent siderophore receptor  41.23 
 
 		 722 aa  492  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5246  TonB-dependent siderophore receptor  41.42 
 
 		 722 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3121  TonB-dependent siderophore receptor  41.42 
 
 		 722 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0414  TonB-dependent siderophore receptor  40.7 
 
 		 731 aa  478  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0673732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2239  TonB-dependent receptor plug  44.63 
 
 		 582 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  36.59 
 
 		 793 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  36.84 
 
 		 706 aa  397  1e-109  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  32.82 
 
 		 708 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  32.49 
 
 		 701 aa  291  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  32.58 
 
 		 703 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  31.69 
 
 		 710 aa  286  8e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  33.01 
 
 		 722 aa  283  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  32.7 
 
 		 757 aa  282  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  30.93 
 
 		 703 aa  279  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  30.68 
 
 		 712 aa  276  8e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.27 
 
 		 711 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  31.89 
 
 		 710 aa  272  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.66 
 
 		 703 aa  270  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  32.66 
 
 		 689 aa  269  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  30.14 
 
 		 708 aa  267  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  31.2 
 
 		 709 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  31.92 
 
 		 696 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  31.68 
 
 		 696 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  31.01 
 
 		 701 aa  264  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  32.05 
 
 		 708 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  32.91 
 
 		 722 aa  263  8.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  31.3 
 
 		 692 aa  259  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  30.49 
 
 		 711 aa  256  9e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  31.52 
 
 		 702 aa  253  7e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  31.52 
 
 		 702 aa  253  7e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  30.74 
 
 		 706 aa  251  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  30.79 
 
 		 734 aa  251  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  30.74 
 
 		 706 aa  251  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  30.15 
 
 		 710 aa  251  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  29.39 
 
 		 709 aa  250  8e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  31.36 
 
 		 738 aa  249  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  31.62 
 
 		 703 aa  248  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  31.17 
 
 		 732 aa  249  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  30.71 
 
 		 714 aa  248  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 743 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  29.34 
 
 		 701 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  29.11 
 
 		 815 aa  241  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  30.88 
 
 		 695 aa  240  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  31.19 
 
 		 723 aa  239  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  28.8 
 
 		 701 aa  236  9e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  30.7 
 
 		 689 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  29.53 
 
 		 689 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  30.09 
 
 		 850 aa  232  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  28.63 
 
 		 701 aa  233  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  31.25 
 
 		 718 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 		 724 aa  231  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 715 aa  230  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  29.54 
 
 		 736 aa  230  6e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 		 723 aa  230  7e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  31.08 
 
 		 724 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  29.4 
 
 		 716 aa  228  4e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 		 738 aa  227  7e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 		 742 aa  224  6e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>