97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0631 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0631  glycosyltransferase protein  100 
 
 
446 aa  929    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0053  hypothetical protein  23.15 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000565511  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
370 aa  64.7  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0753  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 
400 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  27.21 
 
 
308 aa  60.1  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2388  glycosyl transferase family protein  24.75 
 
 
1007 aa  60.1  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257411  hitchhiker  0.0000141924 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  30.97 
 
 
334 aa  59.7  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1122  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
364 aa  57  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
623 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 
376 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3187  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 
320 aa  54.3  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.225557  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
703 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 
303 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3064  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 
438 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3218  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
246 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0390  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
341 aa  53.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
324 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1106  glycosyl transferase  27.5 
 
 
215 aa  53.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.648038  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
338 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1684  glycosyl transferase family protein  23.48 
 
 
285 aa  51.6  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 
338 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
373 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
296 aa  51.2  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.96 
 
 
853 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
348 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  33.93 
 
 
386 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1225  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
325 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.086814 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
348 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  33.68 
 
 
309 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.6 
 
 
851 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  26.6 
 
 
851 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1126  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 
390 aa  49.3  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.463481  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.6 
 
 
851 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 
358 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  33.68 
 
 
309 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.6 
 
 
851 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  24.35 
 
 
1171 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  33.68 
 
 
309 aa  48.9  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.6 
 
 
851 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1154  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 
217 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1120  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 
324 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0838715 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.88 
 
 
853 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 
319 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0706  glycosyl transferase group 2 family protein  32.14 
 
 
334 aa  47.4  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02586  glycosyl transferase  23.44 
 
 
292 aa  47.4  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00173399  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3120  family 2 glycosyl transferase  25.86 
 
 
329 aa  47.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
268 aa  47.4  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
373 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0124  glycosyl transferase family 2  29 
 
 
345 aa  47  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000042136  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 
287 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3317  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  29.73 
 
 
314 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172735  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1391  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 
209 aa  46.2  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.961124  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.51 
 
 
853 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1257  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
322 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
321 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  28.8 
 
 
333 aa  46.2  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
350 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4932  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 
274 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 
307 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 
253 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1101  glycosyltransferase  30.3 
 
 
313 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.25 
 
 
334 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  27.45 
 
 
386 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  24.35 
 
 
322 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1259  glycosyltransferase  32.98 
 
 
308 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1326  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.3 
 
 
313 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1200  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 
319 aa  44.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0281003  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
289 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05920  glycosyl transferase  26.05 
 
 
325 aa  45.1  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.829224  hitchhiker  0.0000012927 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  21.46 
 
 
321 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2551  glycosyl transferase family protein  24.51 
 
 
476 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1219  group 2 family glycosyl transferase  30.3 
 
 
311 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1364  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.3 
 
 
311 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.857643  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3267  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 
364 aa  44.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0803351  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1107  glycosyltransferase  30.3 
 
 
311 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.174738  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
316 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4082  glycosyltransferase  31.91 
 
 
308 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1288  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.3 
 
 
311 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.679665 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1127  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.3 
 
 
311 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2269  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.83 
 
 
320 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000162066 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 
326 aa  43.9  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
365 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  24.63 
 
 
382 aa  43.9  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  26.96 
 
 
353 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  31 
 
 
302 aa  43.9  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  24.32 
 
 
333 aa  43.9  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  25.53 
 
 
750 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3992  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 
353 aa  43.9  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  24.07 
 
 
354 aa  43.5  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0928  glycosyl transferase family protein  25.69 
 
 
311 aa  43.5  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1450  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.27 
 
 
134 aa  43.5  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.069354  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2267  rhamnosyl transferase  20.86 
 
 
347 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000303099 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1112  glycosyl transferase family 8  27.05 
 
 
1014 aa  43.5  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0011  putative glycosyltransferase  27.55 
 
 
320 aa  43.1  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.171814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1114  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
308 aa  43.5  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1967  glycosyl transferase family protein  21.67 
 
 
300 aa  43.1  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 
270 aa  43.1  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>