More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0626 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0626  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  100 
 
 
256 aa  532  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27780  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  71.09 
 
 
256 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.955107  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4734  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  70.43 
 
 
257 aa  387  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0712146 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3657  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  70.43 
 
 
257 aa  387  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.988629  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1510  nucleotidyl transferase  70.31 
 
 
257 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3719  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  69.14 
 
 
257 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1690  nucleotidyl transferase  67.19 
 
 
257 aa  382  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4009  nucleotidyl transferase  67.58 
 
 
257 aa  381  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.665213  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2325  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  67.58 
 
 
257 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0208327 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2217  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  67.58 
 
 
257 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.292238  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2274  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  67.58 
 
 
257 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000514044 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2318  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  67.58 
 
 
257 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0331  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  66.93 
 
 
257 aa  375  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0192457  normal  0.967948 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2432  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  67.58 
 
 
257 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  hitchhiker  0.0000565572 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0773  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  67.19 
 
 
257 aa  374  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0780708 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2875  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  66.54 
 
 
257 aa  368  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2897  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  65.62 
 
 
257 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0048479  normal  0.178128 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0591  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  66.41 
 
 
256 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.157461  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3051  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  65.62 
 
 
257 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3191  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  65.62 
 
 
257 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1259  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  65.23 
 
 
256 aa  364  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4420  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  66.02 
 
 
256 aa  363  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0710  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  64.84 
 
 
257 aa  363  2e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1479  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  64.45 
 
 
256 aa  361  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.279848  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0770  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  64.45 
 
 
255 aa  360  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0114223 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0846  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  64.45 
 
 
255 aa  359  3e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.191137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3790  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  64.59 
 
 
256 aa  358  5e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2292  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  64.06 
 
 
257 aa  357  9e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889535  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0805  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  64.06 
 
 
255 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.219031  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2767  nucleotidyl transferase  65.62 
 
 
258 aa  357  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3063  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  63.67 
 
 
255 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01391  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  62.89 
 
 
255 aa  353  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1881  alpha-D-glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  64.82 
 
 
252 aa  352  4e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1873  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  62.89 
 
 
256 aa  352  5e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4218  nucleotidyl transferase  64.45 
 
 
260 aa  351  8e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2148  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  62.79 
 
 
257 aa  350  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111552  hitchhiker  0.000564894 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3353  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  63.14 
 
 
259 aa  349  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.608703 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0855  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  63.81 
 
 
256 aa  345  5e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5185  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  62.02 
 
 
257 aa  342  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1106  nucleotidyl transferase  60.85 
 
 
257 aa  341  5.999999999999999e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1984  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase (O-antigen-related)  62.65 
 
 
258 aa  339  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0062  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  62.26 
 
 
257 aa  338  2.9999999999999998e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.191265  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0568  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  62.65 
 
 
258 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3134  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  60.47 
 
 
257 aa  338  5.9999999999999996e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.54444  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0662  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  62.26 
 
 
268 aa  338  7e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1961  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  62.26 
 
 
268 aa  337  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3399  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  60.16 
 
 
255 aa  333  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4603  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  58.37 
 
 
256 aa  333  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.803546  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3373  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  59.77 
 
 
255 aa  332  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0385  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  58.59 
 
 
257 aa  332  3e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107114  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4511  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  58.59 
 
 
257 aa  332  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0533588  normal  0.0166086 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3395  nucleotidyltransferase family protein  59.77 
 
 
255 aa  330  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.489664  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07601  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  59.3 
 
 
257 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2712  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  61.18 
 
 
268 aa  329  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3069  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  59.38 
 
 
255 aa  328  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0782  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  59.69 
 
 
257 aa  324  9e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4219  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  58.2 
 
 
257 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383118  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2192  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  57.42 
 
 
256 aa  322  3e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00604297  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14071  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  59.77 
 
 
257 aa  322  4e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3402  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  60.08 
 
 
257 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0778  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  58.2 
 
 
255 aa  319  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2947  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  57.2 
 
 
257 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142032  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1538  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  57.2 
 
 
257 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0189  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  57.2 
 
 
257 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.544209 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4187  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  59.3 
 
 
258 aa  308  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0216  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  57.81 
 
 
259 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.800339  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2657  nucleotidyl transferase  54.86 
 
 
256 aa  307  9e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1959  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  54.26 
 
 
258 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0146821  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4970  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  55.04 
 
 
279 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1423  hypothetical protein  56.76 
 
 
259 aa  301  9e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0459324  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0131  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  53.61 
 
 
264 aa  296  2e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1250  nucleotidyl transferase  54.83 
 
 
257 aa  293  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.396561  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10400  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  54.65 
 
 
257 aa  292  3e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1256  nucleotidyl transferase  52.16 
 
 
257 aa  292  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2562  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  54.23 
 
 
259 aa  291  9e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4297  nucleotidyl transferase  53.46 
 
 
261 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0172202  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1132  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  53.67 
 
 
258 aa  289  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1563  nucleotidyl transferase  51.95 
 
 
257 aa  287  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.436839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3094  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  53.12 
 
 
256 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2384  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  53.52 
 
 
256 aa  283  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1605  nucleotidyl transferase  52.92 
 
 
257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.473509  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2156  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  52.73 
 
 
284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103294  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6560  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  51.95 
 
 
257 aa  281  9e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3350  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  50.19 
 
 
257 aa  279  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2837  nucleotidyl transferase  54.83 
 
 
258 aa  279  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.913671  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3335  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  49.23 
 
 
276 aa  269  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2782  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  49.23 
 
 
276 aa  269  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.600375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4540  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  51.75 
 
 
257 aa  268  5.9999999999999995e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0266961  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12931  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  49.61 
 
 
253 aa  258  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.126471  hitchhiker  0.00767012 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2945  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  49.61 
 
 
268 aa  258  8e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.162368  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1897  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  46.9 
 
 
265 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2260  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  46.72 
 
 
258 aa  247  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.478249  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1908  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  46.88 
 
 
260 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0877  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  45.49 
 
 
254 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0569  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  45 
 
 
274 aa  237  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.706557  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2889  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  45.31 
 
 
259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3694  glucose-1-phosphate cytidylyl-transferase  45.53 
 
 
263 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3930  nucleotidyl transferase  44.62 
 
 
284 aa  228  8e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0800  nucleotidyl transferase  42.31 
 
 
280 aa  222  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0266533 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3402  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  42.31 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000563603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>