More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0570 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  60.4 
 
 		 739 aa  866    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  50.71 
 
 		 731 aa  664    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  51.54 
 
 		 725 aa  687    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  50.71 
 
 		 720 aa  691    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  53.21 
 
 		 720 aa  692    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  54.28 
 
 		 712 aa  699    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  60.17 
 
 		 741 aa  870    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  64.91 
 
 		 726 aa  915    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  52.45 
 
 		 753 aa  667    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  53.35 
 
 		 720 aa  691    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  68.73 
 
 		 721 aa  1013    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  51.27 
 
 		 726 aa  696    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  50.56 
 
 		 728 aa  648    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  48.93 
 
 		 706 aa  645    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  67.33 
 
 		 720 aa  976    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 717 aa  1445    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  51.53 
 
 		 731 aa  707    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  51.84 
 
 		 705 aa  674    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  51.47 
 
 		 743 aa  683    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  51.9 
 
 		 750 aa  693    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  50.42 
 
 		 728 aa  654    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  54.26 
 
 		 739 aa  618  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  47.29 
 
 		 724 aa  593  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  47.29 
 
 		 724 aa  593  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  45.36 
 
 		 700 aa  592  1e-167  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  42.84 
 
 		 699 aa  560  1e-158  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  42.37 
 
 		 892 aa  547  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  43.04 
 
 		 712 aa  539  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  48.08 
 
 		 865 aa  539  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  43.04 
 
 		 712 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  42.9 
 
 		 712 aa  533  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  40.54 
 
 		 719 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  46.37 
 
 		 971 aa  514  1e-144  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06455  RTX toxin transporter  48.87 
 
 		 714 aa  509  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  45.42 
 
 		 1024 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  45.77 
 
 		 1008 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  43.2 
 
 		 1003 aa  505  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  45.77 
 
 		 1008 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  43.9 
 
 		 1000 aa  505  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  39.94 
 
 		 980 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  42.32 
 
 		 1001 aa  497  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  42.12 
 
 		 976 aa  493  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  45.44 
 
 		 975 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1891  toxin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  47.54 
 
 		 715 aa  478  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2004  type I secretion system ATPase  47.37 
 
 		 715 aa  475  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  41.87 
 
 		 930 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  41.62 
 
 		 1016 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  38.75 
 
 		 1013 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06452  ABC-type RTX toxin transporter ATPase and permease components  46.23 
 
 		 523 aa  468  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  42.11 
 
 		 1012 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  42.26 
 
 		 986 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  41.96 
 
 		 999 aa  456  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  38.96 
 
 		 1038 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  38.96 
 
 		 1038 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  37.48 
 
 		 714 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3048  ABC transporter related  38.33 
 
 		 740 aa  450  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  37.2 
 
 		 714 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  39.15 
 
 		 1019 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  38.81 
 
 		 968 aa  439  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  40.78 
 
 		 908 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.97 
 
 		 1006 aa  432  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  37.06 
 
 		 906 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  36.92 
 
 		 906 aa  419  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2547  ABC transporter related  41.24 
 
 		 740 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293981  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  41.89 
 
 		 908 aa  409  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  36.97 
 
 		 982 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  38.07 
 
 		 1013 aa  399  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  36.73 
 
 		 1011 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  40.07 
 
 		 724 aa  399  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4070  ABC transporter related  37.56 
 
 		 724 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00000105324  normal  0.180346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  37.54 
 
 		 1042 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2722  ABC transporter related  40.18 
 
 		 730 aa  392  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3863  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.22 
 
 		 736 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779093  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  32.26 
 
 		 1040 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  33.71 
 
 		 1018 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.43 
 
 		 1018 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.05 
 
 		 1018 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2883  ABC transporter related  37.35 
 
 		 741 aa  359  9.999999999999999e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0605721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1051  ABC transporter related  32.08 
 
 		 744 aa  357  5e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3567  ABC transporter related  34.43 
 
 		 767 aa  353  7e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1440  ABC transporter related  33.49 
 
 		 770 aa  352  8.999999999999999e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338764  normal  0.147226 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0535  ABC transporter, transmembrane region  31.25 
 
 		 744 aa  349  8e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.622763 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  30.93 
 
 		 717 aa  343  4e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1898  ABC transporter related  33.57 
 
 		 742 aa  341  2e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1058  RtxB protein  46.28 
 
 		 368 aa  336  9e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  34.06 
 
 		 737 aa  325  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  34.55 
 
 		 721 aa  325  2e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  32.55 
 
 		 734 aa  324  3e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  31.36 
 
 		 721 aa  324  4e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  31.15 
 
 		 734 aa  323  6e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  31.54 
 
 		 759 aa  322  9.999999999999999e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  30.85 
 
 		 734 aa  320  9e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  30.07 
 
 		 727 aa  317  4e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  32.58 
 
 		 718 aa  317  5e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  32.25 
 
 		 731 aa  316  9e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  31.89 
 
 		 739 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  31.62 
 
 		 718 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  30.57 
 
 		 718 aa  312  1e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  31.96 
 
 		 733 aa  312  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  34.09 
 
 		 578 aa  311  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>