More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0479 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 305 aa  635    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  86.47 
 
 		 304 aa  554  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  86.47 
 
 		 304 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  83.72 
 
 		 303 aa  543  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  73.49 
 
 		 312 aa  471  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  73.83 
 
 		 312 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  73.49 
 
 		 312 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  71.24 
 
 		 302 aa  460  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  64.09 
 
 		 310 aa  417  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  64.26 
 
 		 328 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  65.02 
 
 		 308 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0760  ornithine carbamoyltransferase  64.57 
 
 		 308 aa  401  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  63.49 
 
 		 314 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  63.37 
 
 		 309 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  62.75 
 
 		 314 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4915  ornithine carbamoyltransferase  63.11 
 
 		 310 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  62.83 
 
 		 316 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  63.04 
 
 		 308 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  60 
 
 		 309 aa  391  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2317  ornithine carbamoyltransferase  63.61 
 
 		 326 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4443  ornithine carbamoyltransferase  61.46 
 
 		 316 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4076  ornithine carbamoyltransferase  61.46 
 
 		 330 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  61.11 
 
 		 319 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  61.69 
 
 		 313 aa  386  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0666  ornithine carbamoyltransferase  62.3 
 
 		 308 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.829817 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4557  ornithine carbamoyltransferase  61.13 
 
 		 316 aa  383  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.343587  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  60.6 
 
 		 308 aa  378  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  59.33 
 
 		 317 aa  378  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0719  ornithine carbamoyltransferase  59.34 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2009  ornithine carbamoyltransferase  59.02 
 
 		 308 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  59.54 
 
 		 313 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0796  ornithine carbamoyltransferase  59.48 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0926644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3106  ornithine carbamoyltransferase  58.5 
 
 		 328 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0562517 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2039  ornithine carbamoyltransferase  58.03 
 
 		 308 aa  360  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0482539 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1023  ornithine carbamoyltransferase  58.82 
 
 		 308 aa  352  5.9999999999999994e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.459772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  56.72 
 
 		 309 aa  350  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  56.03 
 
 		 311 aa  343  2e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2164  ornithine carbamoyltransferase  55.56 
 
 		 331 aa  342  5e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1232  ornithine carbamoyltransferase  54.17 
 
 		 311 aa  333  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  54.85 
 
 		 312 aa  333  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1358  ornithine carbamoyltransferase  56.25 
 
 		 307 aa  333  3e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  54.61 
 
 		 309 aa  325  4.0000000000000003e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  56.31 
 
 		 306 aa  323  3e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  52.96 
 
 		 307 aa  321  8e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  51.97 
 
 		 314 aa  316  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 		 305 aa  315  6e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  52.49 
 
 		 311 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  52.49 
 
 		 311 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  52 
 
 		 315 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 316 aa  308  8e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 		 316 aa  308  9e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 		 316 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  52.2 
 
 		 309 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 		 316 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 		 316 aa  305  7e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 		 300 aa  305  8.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 		 316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 		 312 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  49.18 
 
 		 316 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  49.18 
 
 		 316 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0077  ornithine carbamoyltransferase  48.15 
 
 		 303 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 		 298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 301 aa  302  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 		 302 aa  302  5.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 305 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 		 303 aa  301  7.000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  49.49 
 
 		 303 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  52.04 
 
 		 304 aa  301  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 		 313 aa  300  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 316 aa  301  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 		 304 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 305 aa  300  2e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  48.52 
 
 		 316 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  50.84 
 
 		 300 aa  300  3e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  49.16 
 
 		 303 aa  300  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 		 305 aa  299  5e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 		 323 aa  298  7e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0046  ornithine carbamoyltransferase  47.81 
 
 		 303 aa  298  9e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.425573  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  48.81 
 
 		 301 aa  298  1e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 		 312 aa  298  1e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  47.47 
 
 		 303 aa  296  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  48.2 
 
 		 303 aa  296  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  48.48 
 
 		 305 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  48.48 
 
 		 305 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  47.97 
 
 		 305 aa  295  5e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 		 355 aa  295  5e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 340 aa  295  6e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 303 aa  295  7e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 		 304 aa  295  9e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  45.18 
 
 		 312 aa  294  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  50.34 
 
 		 316 aa  294  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  49.49 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 		 312 aa  293  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  48.87 
 
 		 321 aa  293  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  47.81 
 
 		 303 aa  293  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 307 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  47.56 
 
 		 308 aa  291  9e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 		 302 aa  290  1e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  47.84 
 
 		 306 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>