214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0476 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  100 
 
 		 198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  51.79 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  51.79 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  51.76 
 
 		 204 aa  178  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  41.43 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  43.1 
 
 		 236 aa  148  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  42.17 
 
 		 211 aa  144  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  44.05 
 
 		 222 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  39.44 
 
 		 226 aa  137  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  39.68 
 
 		 211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  40.11 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  40.68 
 
 		 210 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  41.42 
 
 		 211 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  39.32 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  41.42 
 
 		 210 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  41.52 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  35.29 
 
 		 222 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  38.71 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  38.89 
 
 		 233 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  39.66 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  38.24 
 
 		 263 aa  124  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  38.01 
 
 		 252 aa  124  8.000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  38.01 
 
 		 252 aa  124  9e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  35.2 
 
 		 261 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  35.2 
 
 		 261 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  35.78 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.97 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  37.89 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  35.98 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  35.98 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  38.07 
 
 		 255 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  38.64 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  38.64 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  35.45 
 
 		 247 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  35.39 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  33.95 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  34.29 
 
 		 250 aa  105  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  34.27 
 
 		 252 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  32.37 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 		 247 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  39.26 
 
 		 266 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  31.64 
 
 		 265 aa  100  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  34.91 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  34.36 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  38.12 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  32.28 
 
 		 246 aa  98.6  5e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  34.76 
 
 		 260 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 		 254 aa  96.3  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  38.36 
 
 		 245 aa  95.5  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  33.13 
 
 		 255 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 257 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  33.13 
 
 		 255 aa  95.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  32.41 
 
 		 250 aa  94  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  35.26 
 
 		 255 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 		 257 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 		 255 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  34.36 
 
 		 255 aa  92.8  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  32.72 
 
 		 259 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  32.73 
 
 		 259 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  32.73 
 
 		 259 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  27.22 
 
 		 252 aa  89.7  3e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 255 aa  89  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  34.36 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  31.76 
 
 		 252 aa  86.7  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  32.93 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  33.13 
 
 		 254 aa  81.3  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  34.13 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0901  disulfide oxidoreductase  28.65 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00296205  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  29.82 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  29.82 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3906  DSBA oxidoreductase  35.51 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  29.24 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  29.82 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  29.82 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  30.26 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  31.36 
 
 		 248 aa  74.7  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  30.63 
 
 		 253 aa  74.7  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  32.7 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  33.11 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3170  DSBA oxidoreductase  32.48 
 
 		 535 aa  72  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0578033  normal  0.438922 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  28.1 
 
 		 265 aa  72  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  26.79 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  31.52 
 
 		 262 aa  67.8  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 		 276 aa  68.2  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  28.41 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  28.8 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  25.88 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1060  DSBA oxidoreductase  27.7 
 
 		 409 aa  64.7  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.533391  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  25.43 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0030  hypothetical protein  27.22 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.619375  normal  0.116202 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  24.86 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0414  DSBA oxidoreductase  27.03 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0031  hypothetical protein  26.26 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4356  DSBA oxidoreductase  24.86 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  25.14 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  29.94 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>