221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0447 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0447  small heat shock protein  100 
 
 
142 aa  284  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0010  heat shock protein Hsp20  57.45 
 
 
141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000317964 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0049  heat shock protein Hsp20  56.64 
 
 
143 aa  161  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000515794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0010  heat shock protein Hsp20  56.74 
 
 
141 aa  160  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138244  normal  0.090985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3663  heat shock protein Hsp20  54.23 
 
 
141 aa  156  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.728714  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0163  HSP20 family protein  52.11 
 
 
160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0157  HSP20 family protein  52.11 
 
 
160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0188  heat shock protein Hsp20  54.61 
 
 
148 aa  150  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.822794  normal  0.424528 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0174  heat shock protein Hsp20  51.41 
 
 
140 aa  149  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743685  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1902  heat shock protein Hsp20  53.15 
 
 
143 aa  146  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1620  heat shock protein Hsp20  53.15 
 
 
143 aa  146  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0107266 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1616  heat shock protein Hsp20  52.45 
 
 
143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0212201  hitchhiker  0.00491481 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0056  heat shock protein Hsp20  48.59 
 
 
141 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368709  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0115  putative small heat shock protein  49.3 
 
 
141 aa  141  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.652181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4228  heat shock protein Hsp20  50.35 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00904113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3162  heat shock protein Hsp20  50.35 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.866915  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0211  heat shock protein Hsp20  49.3 
 
 
141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0651  heat shock protein Hsp20  46.48 
 
 
141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0518672 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0512  heat shock protein Hsp20  51.75 
 
 
166 aa  136  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0182  heat shock protein Hsp20  45.07 
 
 
141 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4738  heat shock protein Hsp20  50.71 
 
 
144 aa  136  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552071  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0409  heat shock protein Hsp20  45.77 
 
 
141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0167  heat shock protein Hsp20  46.85 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2032  heat shock protein Hsp20  47.48 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3755  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
182 aa  124  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0408  heat shock protein Hsp20  48.18 
 
 
167 aa  120  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0683  heat shock protein  50.75 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0489966  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0341  heat shock protein Hsp20  46.67 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0137519  normal  0.0838875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4963  heat shock protein Hsp20  46.15 
 
 
141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971356  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0610  heat shock protein Hsp20  50.74 
 
 
137 aa  118  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.127052  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2205  heat shock protein Hsp20  45.39 
 
 
136 aa  114  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1572  HSP20 family protein  46.97 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.583414  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0224  heat shock protein Hsp20  46.97 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.953259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3054  heat shock protein Hsp20  47.76 
 
 
155 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3350  heat shock protein Hsp20  48.89 
 
 
172 aa  110  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1372  heat shock protein HSP20  46.83 
 
 
132 aa  104  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2961  small heat shock protein  46.53 
 
 
144 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3892  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 
160 aa  97.1  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1971  heat shock protein Hsp20  44.22 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191166  hitchhiker  0.0000381021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2492  heat shock protein Hsp20  44.22 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00176998  hitchhiker  0.00301221 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2388  heat shock protein Hsp20  44.22 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1909  heat shock protein Hsp20  42.36 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0679931  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2376  heat shock protein Hsp20  44.22 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0181083  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2277  16 kDa heat shock protein A  43.54 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2140  heat shock protein Hsp20  43.54 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1971  heat shock protein Hsp20  43.85 
 
 
154 aa  94.7  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0559  heat shock protein Hsp20  39.85 
 
 
154 aa  95.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1953  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1070  heat shock protein Hsp20  42.34 
 
 
156 aa  94.4  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407066  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1748  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
147 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0323144  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1828  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
147 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122774  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2271  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
147 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0013  heat shock protein IbpA  40.77 
 
 
136 aa  94.7  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0048  heat shock protein IbpA  39.67 
 
 
137 aa  94.4  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.208212 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1564  heat shock protein Hsp20  42.55 
 
 
148 aa  94  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.403756  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2126  heat shock protein Hsp20  41.1 
 
 
150 aa  93.6  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0230885  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0957  heat shock protein Hsp20  45.11 
 
 
158 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.634441  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4140  heat shock protein IbpA  40.52 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4036  heat shock protein IbpA  40.52 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4198  heat shock protein IbpA  40.52 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2668  heat shock protein HSP20  40 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000229058  decreased coverage  0.000680468 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2020  16 kDa heat shock protein A  39.86 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0459252  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2134  heat shock protein Hsp20  40.97 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4091  heat shock protein IbpA  40.52 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4019  heat shock protein IbpA  40.52 
 
 
137 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03570  heat shock chaperone  38.17 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0016  heat shock protein Hsp20  38.17 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4052  heat shock protein IbpA  38.17 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4105  heat shock protein IbpA  43.08 
 
 
137 aa  92.8  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2936  heat shock protein Hsp20  43.75 
 
 
150 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5119  heat shock protein IbpA  38.17 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.188059 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4232  heat shock protein IbpA  38.17 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002003  heat shock protein A  41.04 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03514  hypothetical protein  38.17 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4195  heat shock protein IbpA  38.17 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3899  heat shock protein IbpA  38.17 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0016  heat shock protein IbpA  38.17 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3321  heat shock protein Hsp20  40.6 
 
 
156 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1115  heat shock protein Hsp20  41.35 
 
 
160 aa  92  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3020  heat shock protein Hsp20  49.07 
 
 
165 aa  91.3  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00446  heat shock protein  40.77 
 
 
145 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2837  molecular chaperone (small heat shock protein)  40.77 
 
 
160 aa  90.5  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00175036  normal  0.201531 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3795  heat shock protein IbpA  41.38 
 
 
137 aa  90.5  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4143  heat shock protein IbpA  41.38 
 
 
137 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0011  heat shock protein IbpA  41.38 
 
 
137 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4279  heat shock protein Hsp20  42.22 
 
 
156 aa  90.5  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0051  16 kDa heat shock protein A  41.48 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4533  heat shock protein Hsp20  41.48 
 
 
158 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2746  heat shock protein Hsp20  42.42 
 
 
168 aa  90.1  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.145564  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3620  heat shock protein Hsp20  40.6 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1373  small heat shock protein  42.86 
 
 
159 aa  88.6  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.272184 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3914  heat shock protein IbpA  38.84 
 
 
137 aa  88.6  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1116  heat shock protein Hsp20  44.62 
 
 
152 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109039  normal  0.304461 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2501  16 kDa heat shock protein A  37.86 
 
 
145 aa  88.2  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2891  heat shock protein Hsp20  39.5 
 
 
154 aa  87.8  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.457656  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2952  heat shock protein Hsp20  39.85 
 
 
153 aa  87  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0034  heat shock protein IbpA  38.79 
 
 
137 aa  87  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0039  heat shock protein IbpA  38.79 
 
 
137 aa  87  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1668  small heat shock protein IbpA (16 kDa heat shock protein A)  41.67 
 
 
139 aa  87  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1139  heat shock protein Hsp20  39.26 
 
 
153 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>