More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0441 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0441  hemolysin  100 
 
 		 345 aa  694    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0016  transporter-associated region  63.84 
 
 		 383 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0028  CBS domain containing protein  63.07 
 
 		 377 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490023  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0043  CBS domain-containing protein  61.54 
 
 		 391 aa  381  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0313302  hitchhiker  0.00000000114145 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0755  CBS domain-containing protein  50.14 
 
 		 373 aa  316  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2069  CBS domain-containing protein  52.89 
 
 		 374 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00161693  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2157  CBS domain-containing protein  55.56 
 
 		 342 aa  308  9e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151926  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3922  transporter-associated region  52.31 
 
 		 353 aa  302  5.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1246  magnesium and cobalt efflux protein CorC  49.04 
 
 		 340 aa  295  1e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0232  CBS domain containing protein  48.38 
 
 		 373 aa  279  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1813  CBS domain-containing protein  52.51 
 
 		 324 aa  278  7e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3179  CBS domain-containing protein  46.2 
 
 		 389 aa  276  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0636  CBS domain-containing protein  46.7 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3402  CBS domain containing protein  49.68 
 
 		 384 aa  271  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0049  transporter  49.33 
 
 		 386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0017  ctransporter-associated region  48.68 
 
 		 375 aa  269  4e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0674373 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0471  CBS  43.84 
 
 		 420 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0239  HlyC/CorC family transporters  46.71 
 
 		 375 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3207  CBS domain-containing protein  49.35 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3531  CBS domain containing protein  49.35 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.307837  normal  0.3242 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0024  CBS:transporter-associated  48.84 
 
 		 374 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0593  HlyC/CorC family transporter  45.4 
 
 		 376 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2894  CBS domain containing protein  44.61 
 
 		 357 aa  265  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0449  CBS domain containing protein  46.42 
 
 		 381 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1058  CBS domain-containing protein  45.23 
 
 		 344 aa  260  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279471  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3620  CBS domain-containing protein  47.7 
 
 		 319 aa  230  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3036  CBS domain-containing protein  48.93 
 
 		 296 aa  192  6e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3773  CBS domain-containing protein  40.07 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.163853  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2391  CBS domain-containing protein  45.16 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0704  CBS  46.69 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.345067 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0191  CBS domain-containing protein  44.58 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3597  CorC/Hlyc family protein  40.07 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0738043  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3282  CBS domain-containing protein  39.32 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1014  CBS domain containing protein  40.44 
 
 		 302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0266413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3875  hypothetical protein  41.47 
 
 		 314 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0067  CBS domain containing protein  40.49 
 
 		 324 aa  179  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0024  CBS domain-containing protein  42.54 
 
 		 304 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307011  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2158  CBS domain-containing protein  40.4 
 
 		 314 aa  169  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.583239  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  36.84 
 
 		 273 aa  169  9e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0979  CBS  40.7 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.980181  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1356  CBS domain-containing protein  41.63 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0204179  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  35.28 
 
 		 371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  36.27 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  37.84 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  35.32 
 
 		 284 aa  159  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  35.09 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0031  hemolysin  32.8 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.551744  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  36.15 
 
 		 287 aa  157  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  33.21 
 
 		 292 aa  157  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  35.57 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 		 284 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  36.15 
 
 		 287 aa  156  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1181  CBS domain containing protein  34.53 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  37.4 
 
 		 421 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  32.86 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  33 
 
 		 292 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  33.58 
 
 		 420 aa  153  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0011  CBS/transport-associated domain-containing protein  31.94 
 
 		 295 aa  152  7e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  31.02 
 
 		 286 aa  152  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3694  CBS domain-containing protein  43.53 
 
 		 310 aa  152  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.548204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  33.21 
 
 		 426 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  33.44 
 
 		 291 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1027  CBS domain-containing protein  30.63 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.847231  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  32.34 
 
 		 292 aa  149  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  35.65 
 
 		 425 aa  149  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  32.75 
 
 		 285 aa  149  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  32.47 
 
 		 299 aa  149  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1243  hemolysin C  32.14 
 
 		 258 aa  149  8e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.419025  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  32.67 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  32.67 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  32.67 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  32.34 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  32.34 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  32.67 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  32.55 
 
 		 291 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  32.12 
 
 		 292 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  33.92 
 
 		 285 aa  147  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  32.66 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  33.59 
 
 		 433 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  32.01 
 
 		 291 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  32.11 
 
 		 291 aa  146  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  32.78 
 
 		 291 aa  146  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  34.75 
 
 		 285 aa  145  8.000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  34.1 
 
 		 291 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 		 250 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0599  magnesium and cobalt efflux protein, putative  32.9 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0751  CBS domain containing protein  32.9 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558025 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  31.96 
 
 		 273 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  35.86 
 
 		 464 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 		 439 aa  143  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  33.87 
 
 		 259 aa  144  3e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  37.71 
 
 		 443 aa  143  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  35.46 
 
 		 464 aa  143  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1440  transporter-associated region  38.43 
 
 		 427 aa  142  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.252148 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  34.39 
 
 		 425 aa  142  9e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  33.87 
 
 		 435 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4953  transporter-associated region  34.46 
 
 		 279 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  34.59 
 
 		 284 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  32.02 
 
 		 276 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>