32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0429 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0429  Universal stress protein  100 
 
 		 163 aa  329  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384598  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0035  UspA domain-containing protein  81.6 
 
 		 163 aa  272  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329999  hitchhiker  0.0000151739 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0037  UspA domain protein  87.12 
 
 		 163 aa  271  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0025  UspA domain protein  87.12 
 
 		 163 aa  268  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.83625  normal  0.406465 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4036  hypothetical protein  61.96 
 
 		 163 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0141  hypothetical protein  63.19 
 
 		 162 aa  206  8e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0154  UspA domain-containing protein  65.03 
 
 		 162 aa  189  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0135  hypothetical protein  63.58 
 
 		 179 aa  185  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0216796  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0297  UspA domain-containing protein  55.21 
 
 		 168 aa  176  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.637126  normal  0.0141888 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0008  hypothetical protein  47.56 
 
 		 164 aa  153  9e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  0.18728 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0015  hypothetical protein  48.17 
 
 		 164 aa  151  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0940017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0039  hypothetical protein  48.78 
 
 		 164 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.389129 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3610  UspA domain-containing protein  54.25 
 
 		 168 aa  148  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0867  hypothetical protein  48 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751448 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4427  UspA domain protein  47.53 
 
 		 167 aa  138  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450533  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0460  hypothetical protein  45.73 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0458  UspA  43.9 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0890  UspA domain-containing protein  41.33 
 
 		 151 aa  133  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0248  hypothetical protein  44.51 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2278  UspA domain-containing protein  41.33 
 
 		 151 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377159  normal  0.574601 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2838  hypothetical protein  44 
 
 		 151 aa  130  7.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3395  UspA domain-containing protein  45.06 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.251638 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3730  hypothetical protein  44 
 
 		 151 aa  127  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.808369 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0584  hypothetical protein  45.73 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.355702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0532  UspA domain-containing protein  40.94 
 
 		 151 aa  121  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2501  hypothetical protein  38.82 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2215  hypothetical protein  38.81 
 
 		 134 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3027  hypothetical protein  38.56 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3532  hypothetical protein  40.13 
 
 		 185 aa  110  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.053335  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1947  hypothetical protein  32.43 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.869369  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1368  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131997  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1234  universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  40 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>