More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0337 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  100 
 
 		 144 aa  293  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  68.97 
 
 		 120 aa  176  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4317  rare lipoprotein A  72.41 
 
 		 120 aa  174  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0775  rare lipoprotein A  65.18 
 
 		 118 aa  153  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384839  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2135  rare lipoprotein A family protein  72.53 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2050  rare lipoprotein A family protein  72.53 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0189793  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  63.21 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3531  rare lipoprotein A  69.41 
 
 		 124 aa  134  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  62.37 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  51.67 
 
 		 139 aa  114  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  56.84 
 
 		 119 aa  113  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  56.12 
 
 		 115 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  56.12 
 
 		 115 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  48.87 
 
 		 367 aa  111  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  52.25 
 
 		 371 aa  110  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  61.54 
 
 		 324 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  57.61 
 
 		 360 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  57.61 
 
 		 360 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  47.32 
 
 		 116 aa  110  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  62.22 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  63.41 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  58.7 
 
 		 358 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  53.26 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7192  Lipoprotein-like protein  54.08 
 
 		 257 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0272359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  61.63 
 
 		 121 aa  105  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  50.83 
 
 		 122 aa  105  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  60 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  62.64 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  61.63 
 
 		 242 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  60.92 
 
 		 230 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  61.63 
 
 		 242 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  60.92 
 
 		 230 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  55.56 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  60.92 
 
 		 211 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  60.47 
 
 		 179 aa  104  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  60.92 
 
 		 211 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  50.96 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  60.92 
 
 		 211 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  57.47 
 
 		 140 aa  103  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  62.5 
 
 		 121 aa  103  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  44.06 
 
 		 155 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  58.7 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0676  rare lipoprotein A  48.18 
 
 		 117 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.558128 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  52.17 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  56.04 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  57.3 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  43.51 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  56.52 
 
 		 342 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  43.75 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  59.3 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  58.89 
 
 		 202 aa  101  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  56.04 
 
 		 179 aa  101  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  59.77 
 
 		 211 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  47.41 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  54.84 
 
 		 239 aa  101  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 221 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  47.86 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  57.78 
 
 		 203 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  50.93 
 
 		 198 aa  100  9e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  56.04 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  56.32 
 
 		 163 aa  99.4  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  57.78 
 
 		 213 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  56.04 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  59.3 
 
 		 124 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0087  rare lipoprotein A  48.11 
 
 		 241 aa  98.6  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 142 aa  98.6  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0534  rare lipoprotein A  56.04 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  58.43 
 
 		 213 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  46.92 
 
 		 137 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  59.55 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  56.67 
 
 		 203 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  43.59 
 
 		 145 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  53.93 
 
 		 165 aa  98.6  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0555  rare lipoprotein A  52.88 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  56.67 
 
 		 203 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  54.65 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  60.47 
 
 		 121 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0175  rare lipoprotein A  49.5 
 
 		 156 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  54.35 
 
 		 167 aa  97.4  5e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  52.17 
 
 		 275 aa  97.1  7e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0178  rare lipoprotein A  49.51 
 
 		 159 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  56.52 
 
 		 171 aa  97.1  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  52.17 
 
 		 275 aa  97.1  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 196 aa  97.1  8e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  51.61 
 
 		 238 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  52.17 
 
 		 266 aa  96.7  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0403  hypothetical protein  53.33 
 
 		 182 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.746507  normal  0.06763 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0428  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 168 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.480759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 214 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  50 
 
 		 335 aa  95.9  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0269  rare lipoprotein A  53 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.586864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2902  rare lipoprotein A  45.38 
 
 		 162 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  54.84 
 
 		 270 aa  95.5  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 171 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  46.67 
 
 		 181 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>