More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0278 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0278  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
279 aa  565  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4117  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  83.85 
 
 
282 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914371  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4431  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  81.68 
 
 
284 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319208  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4668  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  76.9 
 
 
300 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  decreased coverage  0.000827837 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3709  phosphonate ABC transporter ATP-binding  59.69 
 
 
272 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.144608 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2187  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  56.44 
 
 
275 aa  299  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3862  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  56.86 
 
 
282 aa  289  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2920  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  58.47 
 
 
272 aa  286  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4201  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  57.45 
 
 
273 aa  279  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171703  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1322  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  60.17 
 
 
269 aa  279  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0768  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  57.08 
 
 
270 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3820  phosphonate ABC transporter ATP-binding  53.53 
 
 
270 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.693168  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5858  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  59.17 
 
 
269 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4432  phosphonate ABC transporter ATP-binding  57.02 
 
 
271 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4084  phosphonate ABC transporter ATP-binding  57.02 
 
 
274 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620388  normal  0.0392209 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4787  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  52.76 
 
 
272 aa  266  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334656  normal  0.0646281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3516  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  51.44 
 
 
261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1594  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  50.62 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2683  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  49.17 
 
 
286 aa  230  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0052985  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1319  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  48.92 
 
 
278 aa  228  9e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2339  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  50.89 
 
 
257 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000337848  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3324  ATPase  49.35 
 
 
275 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2299  ABC phosphate/phosphonate transport system ATPase  49.37 
 
 
259 aa  222  6e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3722  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  50.67 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156195  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1410  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  48.48 
 
 
277 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3391  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 
257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193005  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3745  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 
257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3440  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 
257 aa  219  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0128  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.47 
 
 
257 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3474  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  49.78 
 
 
257 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2878  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  47.62 
 
 
278 aa  217  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0133  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.47 
 
 
257 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1345  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  47.62 
 
 
278 aa  217  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0502345 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3749  phosphonate ABC transporter ATP-binding  49.78 
 
 
257 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2799  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  47.62 
 
 
278 aa  217  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0894  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  47.19 
 
 
275 aa  217  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.658454  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3703  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  49.78 
 
 
257 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000015251 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2285  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.64 
 
 
257 aa  217  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000778372  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0225  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.49 
 
 
310 aa  217  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3256  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.51 
 
 
266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.485781  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3963  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  47.26 
 
 
284 aa  214  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.704771 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0335  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  45.95 
 
 
246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29130  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  48.74 
 
 
267 aa  212  5.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3372  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  51.12 
 
 
257 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014777  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0928  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.49 
 
 
256 aa  209  3e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00101449  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6364  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 
275 aa  209  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0620834  normal  0.857375 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3794  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  51.18 
 
 
225 aa  208  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.551084  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0130  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  42.06 
 
 
261 aa  208  8e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000163104  hitchhiker  0.00000028065 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1521  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 
248 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  normal  0.0212059 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5619  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  46.89 
 
 
262 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3921  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  46.89 
 
 
262 aa  205  7e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03977  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  46.89 
 
 
262 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4571  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  46.89 
 
 
262 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03938  hypothetical protein  46.89 
 
 
262 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2677  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  49.16 
 
 
260 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0553597 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1449  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.05 
 
 
254 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00372903  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3859  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.31 
 
 
267 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3908  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.31 
 
 
267 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.480865 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1927  phosphonate ABC transporter ATP-binding  43.51 
 
 
287 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.75646  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3264  hypothetical protein  46.91 
 
 
273 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.634787 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4346  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  46.47 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4659  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  46.47 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0181  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.58 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3886  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.69 
 
 
262 aa  199  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2890  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.5 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0336941  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3258  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.77 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617138  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2964  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.62 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245669  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0829  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.84 
 
 
280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0393  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.99 
 
 
264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3865  phosphonate ABC transporter ATP-binding  44.03 
 
 
272 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2916  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.87 
 
 
284 aa  195  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1000  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.36 
 
 
261 aa  195  7e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0309  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  45.04 
 
 
262 aa  195  7e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.053951 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2247  ABC transporter  46.37 
 
 
277 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2409  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.57 
 
 
292 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2203  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  45.05 
 
 
252 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1420  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.35 
 
 
273 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1097  ATPase  42.98 
 
 
254 aa  193  3e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3234  phosphonate ABC transporter ATP-binding  43.57 
 
 
257 aa  193  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4994  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.35 
 
 
260 aa  193  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463894  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0259  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.72 
 
 
270 aa  193  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2555  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  44.76 
 
 
277 aa  191  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205375  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0857  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 
264 aa  191  8e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0840663  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1745  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  45.93 
 
 
278 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12501  hypothetical protein  42.56 
 
 
261 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6091  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.82 
 
 
288 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl572  phosphonate ABC transporter ATP-binding component  40.43 
 
 
249 aa  190  2e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0597  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.98 
 
 
270 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00266956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4575  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.06 
 
 
281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1231  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.23 
 
 
265 aa  188  7e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.353455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20300  ATP-binding component of ABC phosphonate transporter  45.16 
 
 
278 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.540657  normal  0.410183 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0775  phosphonate ABC transporter ATP-binding  43.43 
 
 
309 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  0.944742 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11301  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  44.54 
 
 
257 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0500512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5876  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 
267 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6355  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.25 
 
 
264 aa  185  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.424299  normal  0.5531 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4177  ATPase  42.91 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0826  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 
250 aa  183  3e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.954796  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2995  phosphonate ABC transporter ATP-binding  38.71 
 
 
279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2676  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.71 
 
 
279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1321  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.17 
 
 
271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.918864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>