135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0199 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  549  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  68.9 
 
 		 274 aa  351  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  68.75 
 
 		 277 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  65.04 
 
 		 272 aa  341  9e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  62.34 
 
 		 647 aa  311  4.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  62.76 
 
 		 259 aa  310  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  62.76 
 
 		 263 aa  308  4e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  63.91 
 
 		 257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  52.17 
 
 		 259 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  53.2 
 
 		 265 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  53.82 
 
 		 255 aa  249  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  53.75 
 
 		 261 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  55.16 
 
 		 257 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  53.01 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  52.61 
 
 		 257 aa  238  8e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  54.22 
 
 		 264 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  50.19 
 
 		 265 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  50.4 
 
 		 252 aa  229  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  52 
 
 		 252 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  50.41 
 
 		 258 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  50.2 
 
 		 271 aa  221  8e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  50 
 
 		 283 aa  221  9e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  47.84 
 
 		 272 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  50.67 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  51.3 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  45.6 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  46.86 
 
 		 252 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  39.66 
 
 		 256 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  44.16 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  42.42 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  43.72 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  41.05 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  44.13 
 
 		 251 aa  168  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  42.34 
 
 		 247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  35.58 
 
 		 279 aa  159  5e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  34.2 
 
 		 253 aa  155  7e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  42.61 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  40.44 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  40.93 
 
 		 244 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  32.64 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  32.43 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  40.83 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  30.37 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  30.37 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  29.19 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  27.39 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  37.82 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  36.94 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  27.75 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  30.53 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  24.77 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  29.41 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  25.52 
 
 		 258 aa  52.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  29.06 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  28.92 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.49 
 
 		 261 aa  52  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  26.05 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  28.57 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.22 
 
 		 372 aa  50.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  25.77 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.82 
 
 		 367 aa  49.3  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  31.97 
 
 		 274 aa  49.3  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  28.44 
 
 		 270 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  28.44 
 
 		 270 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  33.6 
 
 		 269 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1559  alpha/beta hydrolase fold protein  34.01 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0478161  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2219  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.08 
 
 		 626 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.194335 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2542  hydrolase, alpha/beta fold family  25.71 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07233  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06650)  24.35 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0390188  normal  0.0838788 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.57 
 
 		 370 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  20.9 
 
 		 255 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  25.89 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.65 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  24.38 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.11 
 
 		 370 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2750  hydrolase, alpha/beta fold family  26.86 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 250 aa  47  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.62 
 
 		 368 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0498  hypothetical protein  32.81 
 
 		 291 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.78 
 
 		 368 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  34.12 
 
 		 308 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.78 
 
 		 368 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 		 257 aa  46.2  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  33.94 
 
 		 293 aa  45.8  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  30.06 
 
 		 276 aa  45.8  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3329  hypothetical protein  27.78 
 
 		 362 aa  45.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.95 
 
 		 370 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  32.54 
 
 		 282 aa  45.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2473  carboxylesterase  25.21 
 
 		 287 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.283047  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.23 
 
 		 371 aa  45.4  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0541  hypothetical protein  31.5 
 
 		 281 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  0.956767 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  36.26 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  40.79 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1498  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 324 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.03 
 
 		 371 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42666  predicted protein  28.24 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.18 
 
 		 372 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>