More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0193 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0193  cytidylate kinase  100 
 
 		 217 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4031  cytidylate kinase  79.44 
 
 		 215 aa  349  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4361  cytidylate kinase  78.97 
 
 		 215 aa  345  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0102365 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3457  cytidylate kinase  80.48 
 
 		 212 aa  341  5e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0025  cytidylate kinase  69.59 
 
 		 219 aa  304  7e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0026  cytidylate kinase  71.29 
 
 		 219 aa  301  6.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3607  cytidylate kinase  71.92 
 
 		 218 aa  284  5.999999999999999e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0733159  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0030  cytidylate kinase  70.33 
 
 		 214 aa  281  6.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1304  cytidylate kinase  60.77 
 
 		 215 aa  238  5e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00011985  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  54.41 
 
 		 212 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0104  cytidylate kinase  52.45 
 
 		 212 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0614  cytidylate kinase  53.66 
 
 		 216 aa  205  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00523823 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0102  cytidylate kinase  51.22 
 
 		 216 aa  198  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0398  cytidylate kinase  50.98 
 
 		 212 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0641  cytidylate kinase  52.94 
 
 		 212 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.112665 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1023  cytidylate kinase  51.71 
 
 		 212 aa  191  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283753  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2938  cytidylate kinase  52.22 
 
 		 211 aa  188  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0191  cytidylate kinase  51.47 
 
 		 212 aa  187  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0197  cytidylate kinase  55.39 
 
 		 203 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1111  cytidylate kinase  52.45 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0208  cytidylate kinase  51.47 
 
 		 212 aa  184  6e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.300993  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0164  cytidylate kinase  50.98 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3881  cytidylate kinase  51.52 
 
 		 211 aa  174  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0150  cytidylate kinase  53.59 
 
 		 217 aa  175  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2086  cytidylate kinase  51.72 
 
 		 222 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3276  cytidylate kinase  52.22 
 
 		 211 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.811486  normal  0.522336 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3591  cytidylate kinase  52.22 
 
 		 206 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.39582  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2129  cytidylate kinase  53.97 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.29015 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  51.79 
 
 		 194 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2406  cytidylate kinase  53.97 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7108  cytidylate kinase  52.13 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978606  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0715  cytidylate kinase  55.96 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5617  cytidylate kinase  51.72 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.314381  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1332  cytidylate kinase  47.52 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000433479  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  48.54 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1026  cytidylate kinase  43.96 
 
 		 226 aa  161  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000434199  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2457  cytidylate kinase  46.57 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6548  cytidylate kinase  55.03 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219054  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  44.08 
 
 		 229 aa  157  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  44.08 
 
 		 229 aa  157  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0955  cytidylate kinase  44.95 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000242866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  46.08 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  41.83 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2243  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  42.2 
 
 		 674 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0099  cytidylate kinase  46.32 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.906806 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0294  cytidylate kinase  47.09 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  40.97 
 
 		 230 aa  155  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  41.46 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  38.6 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2795  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  43.93 
 
 		 667 aa  151  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233138 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  41.71 
 
 		 226 aa  151  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  38.71 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  38.03 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  39.74 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0641  cytidylate kinase  40.76 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272482  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1536  cytidylate kinase  40.76 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000588366  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  39.57 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2570  cytidylate kinase  44.33 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138254  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0963  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  42.79 
 
 		 699 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0721  cytidylate kinase  44.83 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0824528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0254  cytidylate kinase  39.34 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.13077  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  39.17 
 
 		 227 aa  147  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  42.38 
 
 		 225 aa  147  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1494  cytidylate kinase  46.15 
 
 		 209 aa  147  9e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.373102 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  39.74 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  39.74 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  39.74 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0902  cytidylate kinase  39.46 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.210574  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  39.65 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1024  cytidylate kinase  39.46 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000194676  unclonable  0.0000000000298139 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  39.74 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  40.71 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0745  cytidylate kinase  43.98 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.804624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0778  cytidylate kinase  43.28 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00825892 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0544  cytidylate kinase  36.36 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.773366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0849  cytidylate kinase  43.28 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.744629  normal  0.265979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4723  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  42.93 
 
 		 675 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  39.3 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  42.29 
 
 		 237 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0908  cytidylate kinase  43.28 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  41.78 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  38.43 
 
 		 230 aa  145  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2070  cytidylate kinase  40.89 
 
 		 229 aa  145  6e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000348998  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1790  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  43.48 
 
 		 668 aa  144  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149687 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 228 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  38.33 
 
 		 230 aa  144  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  38.18 
 
 		 226 aa  144  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1375  cytidylate kinase  40.54 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1371  cytidylate kinase  40.54 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  41.92 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  40.19 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  40.85 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  39.81 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1324  cytidylate kinase  44.61 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  42.59 
 
 		 251 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  40.81 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>