More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0158 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  59.4 
 
 
1390 aa  877    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  100 
 
 
1145 aa  2067    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  38.07 
 
 
1884 aa  429  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  35.99 
 
 
1628 aa  411  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  36.75 
 
 
1582 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  37.61 
 
 
1213 aa  395  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  41.31 
 
 
833 aa  385  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  36.09 
 
 
4800 aa  347  1e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  33.98 
 
 
2467 aa  329  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  32.5 
 
 
2097 aa  310  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  33.63 
 
 
3954 aa  297  6e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  33.41 
 
 
1544 aa  286  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  35.18 
 
 
4334 aa  280  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.62 
 
 
1415 aa  276  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  32.31 
 
 
1072 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  35.99 
 
 
2911 aa  274  8.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  33 
 
 
1855 aa  266  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  33.55 
 
 
1079 aa  259  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  30.7 
 
 
2836 aa  252  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  31.27 
 
 
1156 aa  225  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  32.73 
 
 
1400 aa  217  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  34.78 
 
 
2807 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  36.09 
 
 
946 aa  205  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  29.84 
 
 
2954 aa  192  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  28.99 
 
 
1895 aa  191  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  32.9 
 
 
1286 aa  191  9e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  34.05 
 
 
1279 aa  190  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0556  proprotein convertase P  31.33 
 
 
764 aa  190  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392755  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  36.13 
 
 
2133 aa  187  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  30.92 
 
 
1499 aa  186  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  32.62 
 
 
1363 aa  186  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  32.56 
 
 
1764 aa  180  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  40.78 
 
 
745 aa  177  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  32.5 
 
 
2950 aa  175  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  33.21 
 
 
1134 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  32.37 
 
 
860 aa  172  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  29.65 
 
 
1534 aa  164  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  42.22 
 
 
3619 aa  160  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  40.65 
 
 
3619 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  34.51 
 
 
1421 aa  160  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  38.94 
 
 
3608 aa  156  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  34.78 
 
 
965 aa  154  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  30.35 
 
 
3026 aa  154  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.31 
 
 
2678 aa  154  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  33.51 
 
 
556 aa  153  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  31.25 
 
 
2689 aa  147  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  40.15 
 
 
2198 aa  145  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  32.66 
 
 
824 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  39.51 
 
 
1424 aa  142  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  33.56 
 
 
1112 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  29.2 
 
 
1133 aa  140  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  37.46 
 
 
648 aa  137  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  32.8 
 
 
820 aa  137  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  36.7 
 
 
3209 aa  137  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  28.43 
 
 
1532 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  28.05 
 
 
1814 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  30.43 
 
 
1112 aa  134  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  36.36 
 
 
1197 aa  134  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  27.94 
 
 
4798 aa  132  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  30.06 
 
 
1164 aa  131  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.77 
 
 
1236 aa  129  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  38.89 
 
 
2105 aa  128  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  28.85 
 
 
2107 aa  127  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  35.68 
 
 
2775 aa  126  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  27.04 
 
 
2245 aa  123  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  36.18 
 
 
833 aa  122  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.79 
 
 
1795 aa  121  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  27.74 
 
 
1306 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  30.43 
 
 
795 aa  119  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  33.67 
 
 
595 aa  119  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  36.22 
 
 
759 aa  119  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  32.82 
 
 
907 aa  117  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  31.8 
 
 
851 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1200  hemolysin-type calcium-binding region  29.96 
 
 
1864 aa  115  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0007986  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  37.88 
 
 
4687 aa  115  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  30 
 
 
1217 aa  115  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  33.25 
 
 
1610 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.71 
 
 
3427 aa  114  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  25.42 
 
 
3598 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.97 
 
 
1180 aa  111  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 
677 aa  111  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  28.41 
 
 
855 aa  111  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  47.47 
 
 
2667 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  33.15 
 
 
393 aa  110  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  36.67 
 
 
518 aa  108  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  32.67 
 
 
574 aa  107  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  43.85 
 
 
1712 aa  107  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1355  hemolysin-type calcium-binding region  31.74 
 
 
623 aa  106  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.530325  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  28.61 
 
 
1383 aa  107  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  37.05 
 
 
1610 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2596  Hemolysin-type calcium-binding region  43.38 
 
 
1971 aa  106  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  37.84 
 
 
329 aa  104  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  37.84 
 
 
329 aa  104  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  31.84 
 
 
769 aa  104  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  31.94 
 
 
998 aa  103  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  33.65 
 
 
9867 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  31.41 
 
 
959 aa  102  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  29.84 
 
 
932 aa  102  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  33.24 
 
 
387 aa  101  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  40.5 
 
 
1557 aa  101  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>