247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0032 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0032  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 		 186 aa  377  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  86.96 
 
 		 185 aa  334  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  90.06 
 
 		 175 aa  318  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  85.8 
 
 		 182 aa  311  4.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4309  ATP-dependent protease peptidase subunit  91.28 
 
 		 175 aa  307  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.98 
 
 		 184 aa  306  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.43 
 
 		 184 aa  303  7e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.89 
 
 		 184 aa  302  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.48 
 
 		 186 aa  280  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.18 
 
 		 190 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.43 
 
 		 184 aa  278  3e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.71 
 
 		 184 aa  277  6e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1261  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.14 
 
 		 193 aa  277  6e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.86 
 
 		 186 aa  269  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.14 
 
 		 206 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.97 
 
 		 193 aa  267  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.86 
 
 		 186 aa  267  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4376  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.81 
 
 		 183 aa  266  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.16 
 
 		 176 aa  266  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0404  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.44 
 
 		 187 aa  265  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.37323  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.16 
 
 		 176 aa  264  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2987  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.99 
 
 		 189 aa  260  6.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0310  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.16 
 
 		 189 aa  259  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.58 
 
 		 182 aa  259  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3082  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.49 
 
 		 199 aa  258  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1239  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.86 
 
 		 182 aa  258  5.0000000000000005e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426925 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1594  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.25 
 
 		 188 aa  255  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.403262  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2295  ATP-dependent protease peptidase subunit  70 
 
 		 182 aa  254  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1531  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.91 
 
 		 185 aa  253  9e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1189  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.39 
 
 		 184 aa  252  2.0000000000000002e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.353132  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0181  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.35 
 
 		 185 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2949  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.27 
 
 		 185 aa  251  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.156382  normal  0.168533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5054  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.38 
 
 		 187 aa  251  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.35 
 
 		 187 aa  250  7e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3080  ATP-dependent protease peptidase subunit  72 
 
 		 191 aa  249  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3440  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.82 
 
 		 185 aa  249  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.952306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2791  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.02 
 
 		 184 aa  248  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0185  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.45 
 
 		 185 aa  248  5e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0804  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.03 
 
 		 189 aa  247  6e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.169738  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0250  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.02 
 
 		 197 aa  247  6e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.505749  normal  0.814167 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0996  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.03 
 
 		 189 aa  246  1e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2849  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.96 
 
 		 185 aa  244  4.9999999999999997e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.303381 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2635  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.84 
 
 		 185 aa  243  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318301  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.08 
 
 		 183 aa  234  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.09 
 
 		 182 aa  234  8e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.52 
 
 		 182 aa  233  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.84 
 
 		 176 aa  232  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 		 183 aa  231  6e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03517  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.7 
 
 		 174 aa  230  8.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839153  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2558  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.39 
 
 		 188 aa  230  9e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51701 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1210  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.64 
 
 		 178 aa  230  1e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.12 
 
 		 174 aa  229  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 176 aa  230  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.58 
 
 		 187 aa  228  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.12 
 
 		 185 aa  228  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.7 
 
 		 174 aa  227  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.99 
 
 		 204 aa  227  8e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.5 
 
 		 181 aa  225  3e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.04 
 
 		 181 aa  224  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 172 aa  224  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0176  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.67 
 
 		 188 aa  224  5.0000000000000005e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.79 
 
 		 177 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.92 
 
 		 178 aa  224  7e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0531  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 174 aa  223  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00786303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 174 aa  223  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5790  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.29 
 
 		 182 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66770  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.29 
 
 		 177 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 174 aa  222  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  60.8 
 
 		 180 aa  221  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 		 184 aa  221  4.9999999999999996e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4429  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.16 
 
 		 174 aa  221  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.15 
 
 		 181 aa  219  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3361  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.95 
 
 		 174 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 172 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.95 
 
 		 175 aa  219  1.9999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.92 
 
 		 183 aa  218  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.89 
 
 		 194 aa  218  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.85 
 
 		 179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 		 176 aa  218  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 176 aa  218  5e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  63.74 
 
 		 176 aa  218  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03766  hypothetical protein  63.74 
 
 		 176 aa  218  5e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 176 aa  218  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.07 
 
 		 179 aa  218  5e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 176 aa  218  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 176 aa  218  5e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 176 aa  218  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 176 aa  218  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 176 aa  218  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3837  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 178 aa  218  6e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.552553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.01 
 
 		 176 aa  217  7e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.77 
 
 		 196 aa  216  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2367  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121979  hitchhiker  0.00000525467 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4162  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.16 
 
 		 174 aa  216  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.63 
 
 		 174 aa  215  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0463  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.16 
 
 		 174 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2747  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 173 aa  216  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0473  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.16 
 
 		 174 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3699  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.16 
 
 		 174 aa  216  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.085186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3867  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.16 
 
 		 174 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>