265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0018 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  68.11 
 
 		 252 aa  359  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  65.75 
 
 		 252 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  61.34 
 
 		 251 aa  311  5.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  52.8 
 
 		 251 aa  263  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  53.51 
 
 		 255 aa  251  6e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  53.51 
 
 		 253 aa  251  7e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  53.07 
 
 		 253 aa  241  7e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  44.13 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  45.99 
 
 		 243 aa  204  1e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  42.86 
 
 		 241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  43.29 
 
 		 241 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  42.86 
 
 		 260 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  45.41 
 
 		 247 aa  192  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  39.83 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  44.39 
 
 		 278 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  44.17 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  44.66 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  45.41 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  39.66 
 
 		 279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  43.41 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  43.92 
 
 		 198 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  43.2 
 
 		 249 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  42.01 
 
 		 263 aa  174  9e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1260  hypothetical protein  39.3 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.017504 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  38.5 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  38.27 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  36.86 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  37.5 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  37.05 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  32.78 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  34.06 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  32.91 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  37.83 
 
 		 227 aa  139  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0094  hypothetical protein  38.5 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  35.47 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  34.98 
 
 		 240 aa  135  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2855  hypothetical protein  33.86 
 
 		 252 aa  129  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  37.88 
 
 		 241 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  33.2 
 
 		 286 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  33.74 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4654  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.791009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  31.51 
 
 		 295 aa  116  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  32.77 
 
 		 292 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  32.77 
 
 		 292 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  32.77 
 
 		 292 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  32.77 
 
 		 292 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  32.77 
 
 		 292 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  32.77 
 
 		 292 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  33.64 
 
 		 292 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  32.73 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  31.51 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  33.63 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  33.64 
 
 		 285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  34.25 
 
 		 301 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  35.45 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2977  hypothetical protein  34.22 
 
 		 227 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0331949 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  35 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  32.89 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  35 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  35 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  34.55 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  35 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  29.15 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  29.57 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  31.72 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  40.34 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  30.24 
 
 		 292 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  30.24 
 
 		 292 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  30.32 
 
 		 237 aa  105  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  29.63 
 
 		 288 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  28.07 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  27.16 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  29.49 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  31.11 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  28.11 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  28.38 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  27.05 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1535  hypothetical protein  30.43 
 
 		 238 aa  98.6  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.714061 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  26.81 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2818  hypothetical protein  32.3 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  25.41 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  29.03 
 
 		 234 aa  95.9  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  27.35 
 
 		 243 aa  95.5  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  25.32 
 
 		 238 aa  95.1  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  32.87 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  28.12 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  42.39 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  26.61 
 
 		 245 aa  92.8  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  30.34 
 
 		 249 aa  92.8  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  41.3 
 
 		 227 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  26.99 
 
 		 320 aa  92.8  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  28.99 
 
 		 227 aa  92.4  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  44.32 
 
 		 221 aa  91.7  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  36.84 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  28.77 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  22.86 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  28 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  28.88 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  26.01 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>