54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_R0045 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_R0045  tRNA-Ser  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0142063  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0017  tRNA-Ser  96.47 
 
 
85 bp  145  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.54444  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  54  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.317107  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_627  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.796085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0001  tRNA-Ser  90 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0040  tRNA-Ser  90 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0004  tRNA-Ser  93.55 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0004  tRNA-Ser  93.55 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0006  tRNA-Ser  93.55 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0906398  normal  0.0288361 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0052  tRNA-Ser  93.55 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0007  tRNA-Ser  96.3 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0030  tRNA-Ser  96.3 
 
 
91 bp  46.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.596087  normal  0.116932 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0005  tRNA-Ser  96.15 
 
 
95 bp  44.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0034  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.355586  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0030  tRNA-Ser  96.15 
 
 
91 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0032  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2165  tRNA-Ser  96.15 
 
 
92 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00542927  normal  0.154256 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2218  tRNA-Ser  96.15 
 
 
92 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00379666  normal  0.543792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2161  tRNA-Ser  96.15 
 
 
92 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000713726  normal  0.978327 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2065  tRNA-Ser  96.15 
 
 
92 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000178932  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2818  tRNA-Ser  96.15 
 
 
92 bp  44.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000985587  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0038  tRNA-Ser  96.15 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0043  tRNA-Ser  96.15 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86437  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0012  tRNA-Ser  96.15 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03580  tRNA-Ser  96.15 
 
 
92 bp  44.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.731888  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0057  tRNA-Ser  96.15 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0041  tRNA-Ser  96.15 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0031  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  44.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.602902 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0026  tRNA-Ser  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0052  tRNA-Ser  96.15 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.360325 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0051  tRNA-Ser  96.15 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5040  tRNA-Ser  96.15 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000068764  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0043  tRNA-Ser  96.15 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0020807  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0020  tRNA-Ser  96.15 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.417129  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0042  tRNA-Ser  96.15 
 
 
93 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00852582  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0062  tRNA-Ser  96.15 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52560  tRNA-Ser  96.15 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00373165  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0013  tRNA-Ser  96.15 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0031  tRNA-Ser  96.15 
 
 
91 bp  44.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0145328  normal  0.103161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4609  tRNA-Ser  96.15 
 
 
93 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0001  tRNA-Ser  96.15 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4672  tRNA-Ser  96.15 
 
 
92 bp  44.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000507057  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna38  tRNA-Ser  96.15 
 
 
91 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0066  tRNA-Ser  96.15 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal  0.681656 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0010  tRNA-Ser  96.15 
 
 
92 bp  44.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000388656  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0048  tRNA-Ser  96.15 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171886  normal  0.292826 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1149  tRNA-Ser  96.15 
 
 
92 bp  44.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000101348  hitchhiker  0.0000000000000214207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0060  tRNA-Ser  96.15 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.943942 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00032  tRNA-Ser  96.15 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000331013  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0001  tRNA-Ser  96.15 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0969  tRNA-Ser  96.15 
 
 
92 bp  44.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000352025  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna37  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>