297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_R0020 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_R0020  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0126987  normal  0.390721 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0054  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000046509  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0018  tRNA-Met  95.24 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000793329  hitchhiker  0.000000622773 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0003  tRNA-Met  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0032  tRNA-Met  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.094935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0019  tRNA-Met  95.24 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0042  tRNA-Met  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.309663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0029  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0016  tRNA-Met  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0018    93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0050  tRNA-Met  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0015  tRNA-Met  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329575  decreased coverage  0.00000481165 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0011  tRNA-Met  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0065  tRNA-Met  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0018  tRNA-Met  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0063  tRNA-Met  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0006  tRNA-Met  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371714  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA14  tRNA-Met  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0035  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0024  tRNA-Met  95.24 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000288853 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0039  tRNA-Met  88.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0010  tRNA-Ile  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0369476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0040  tRNA-Ile  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000178667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0006  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0047  tRNA-Met  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0017  tRNA-Met  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0019  tRNA-Met  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0023  tRNA-Met  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2335  tRNA-Met  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0034  tRNA-Met  88.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.62589  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0033  tRNA-Met  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0263488  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0037  tRNA-Met  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0012  tRNA-Met  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.178155  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0025  tRNA-Met  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0304  tRNA-Met  96.88 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.150543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0033  tRNA-Met  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000189228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t22  tRNA-Met  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0026  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000000595128  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0092  tRNA-Met  96.88 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0035  tRNA-Met  96.88 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0032  tRNA-Met  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0084  tRNA-Met  96.88 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438711  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0018  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000031299  normal  0.0565346 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0052  tRNA-Met  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0246441 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0005  tRNA-Met  96.88 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0052  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.526652  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4209  tRNA-Met  96.88 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00407294  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0038  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0167531  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0020  tRNA-Met  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235412  normal  0.107763 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0026  tRNA-Met  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000286775 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0028  tRNA-Met  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.822352  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0156  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000253856  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0125  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000214753  hitchhiker  0.00047099 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0159  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000201379  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0129  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000830942  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t108  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000118343  hitchhiker  0.00000000052642 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t014  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t018  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00070  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000758823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0017  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0050  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.325417  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4303  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0015  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0036  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.756842  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0013  tRNA-Ile  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.059772  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0153  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000229594  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t013  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114065  hitchhiker  0.000000000483497 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0030  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000378723  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0091  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.62007  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2045  tRNA-Met  93.94 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2942  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265359  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2945  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.393325  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2948  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282487  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2625  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2628  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2631  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.830892  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13990  tRNA-Met  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.314954  normal  0.930343 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0032  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000017089  normal  0.142093 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0036  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000524362  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28350  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.145936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0033  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000181749  normal  0.113479 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0037  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000667787  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0001  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567837 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0038  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000161182  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0031  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000967357  normal  0.0254093 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0035  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000026454  normal  0.0264572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0102  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000510016  normal  0.102262 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0106  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000245591  normal  0.103844 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0036  tRNA-Met  86.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.572801  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0029  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.856201  normal  0.110623 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0047  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0108  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000000925479  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0112  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000385548  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0096  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000771704  normal  0.141608 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0100  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000240677  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0033  tRNA-Met  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.311584 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0061  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0074  tRNA-Met  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0120  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000849976  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0116  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>