158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_R0019 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_R0034  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  147  4e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.870471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0019  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  147  4e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  1.00673e-14  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0016  tRNA-Pro  97.3 
 
 
74 bp  131  2e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0015  tRNA-Pro  97.3 
 
 
74 bp  131  2e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0316324  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0033  tRNA-Pro  97.3 
 
 
74 bp  131  2e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00710383  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0044  tRNA-Pro  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0033  tRNA-Pro  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.216286  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0034  tRNA-Pro  94.59 
 
 
74 bp  115  1e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.199678  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0047  tRNA-Pro  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0020  tRNA-Pro  93.24 
 
 
77 bp  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0004  tRNA-Pro  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.14749  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAProVIMSS1309076  tRNA-Pro  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAProVIMSS1309152  tRNA-Pro  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAProVIMSS1309349  tRNA-Pro  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAProVIMSS1309142  tRNA-Pro  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.165714  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAProVIMSS1309195  tRNA-Pro  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0101473 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAProVIMSS1309295  tRNA-Pro  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0017  tRNA-Pro  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0005  tRNA-Pro  88.57 
 
 
77 bp  75.8  1e-12  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0042  tRNA-Pro  88.06 
 
 
74 bp  69.9  8e-11  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0029  tRNA-Pro  86.67 
 
 
78 bp  61.9  2e-08  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36270  tRNA-Pro  86.57 
 
 
74 bp  61.9  2e-08  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.973598 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0053  tRNA-Pro  85.14 
 
 
77 bp  60  7e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.94568e-11  unclonable  8.89969e-24 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0086  tRNA-Asn  100 
 
 
84 bp  58  3e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0087  tRNA-Pro  100 
 
 
78 bp  58  3e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0019  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  58  3e-07  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1637  tRNA-Pro  86.89 
 
 
74 bp  58  3e-07  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.590858  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0036  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  58  3e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0057  tRNA-Pro  86.89 
 
 
74 bp  58  3e-07  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2326  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  58  3e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.261307  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0076  tRNA-Pro  100 
 
 
78 bp  58  3e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77205  normal  0.0987165 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0011  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  58  3e-07  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11857  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0774  tRNA-Pro  100 
 
 
79 bp  58  3e-07  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA40  tRNA-Pro  100 
 
 
78 bp  58  3e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0135525  normal  0.0275356 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0048  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  58  3e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255642  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t10  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  58  3e-07  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0829003  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0025  tRNA-Pro  87.5 
 
 
77 bp  56  1e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692455  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0030    87.5 
 
 
77 bp  56  1e-06  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0163482  normal  0.16826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA20  tRNA-Pro  87.5 
 
 
77 bp  56  1e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0493048 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0033  tRNA-Pro  87.5 
 
 
77 bp  56  1e-06  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.923916  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0040  tRNA-Pro  87.5 
 
 
77 bp  56  1e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0052  tRNA-Pro  85.07 
 
 
74 bp  54  5e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330689  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0007  tRNA-Pro  85.07 
 
 
77 bp  54  5e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0050  tRNA-Pro  85.07 
 
 
74 bp  54  5e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.134805  hitchhiker  0.00793111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0054  tRNA-Pro  85.07 
 
 
74 bp  54  5e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190136  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0061  tRNA-Pro  85.07 
 
 
77 bp  54  5e-06  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273453  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t42  tRNA-Pro  86.44 
 
 
74 bp  54  5e-06  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  7.50468e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0051  tRNA-Pro  85.07 
 
 
74 bp  54  5e-06  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0010  tRNA-Pro  85.07 
 
 
74 bp  54  5e-06  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0049  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  52  2e-05  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106855  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0023  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  52  2e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  0.736236 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0005  tRNA-Pro  84.85 
 
 
77 bp  52  2e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0037  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  52  2e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217744 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0032  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  52  2e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025005  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0025  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  52  2e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102908  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0049  tRNA-Pro  96.55 
 
 
74 bp  50.1  7e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.757916 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0030  tRNA-Pro  96.55 
 
 
78 bp  50.1  7e-05  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0641219  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0051  tRNA-Pro  96.55 
 
 
74 bp  50.1  7e-05  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0030  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  2.33844e-05  normal  0.0418304 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0009  tRNA-Pro  96.55 
 
 
78 bp  50.1  7e-05  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0615  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.394292  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0051  tRNA-Pro  96.55 
 
 
74 bp  50.1  7e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0057  tRNA-Pro  96.55 
 
 
78 bp  50.1  7e-05  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.600099  normal  0.289188 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0049  tRNA-Pro  96.55 
 
 
74 bp  50.1  7e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.197597  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0040  tRNA-Pro  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t27  tRNA-Pro  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0120151  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0011  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0269347  normal  0.199214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0039  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0057  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0023  tRNA-Pro  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  4.46356e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6032  tRNA-Pro  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00194019  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2126  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0340  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0010  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0036  tRNA-Pro  85.71 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.103691  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t01  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60110  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0031  tRNA-Pro  84.13 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0075  tRNA-Pro  83.58 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0018  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0036  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0033  tRNA-Pro  84 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0028  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0073  tRNA-Pro  83.58 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0030  tRNA-Pro  84.13 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAProVIMSS1309294  tRNA-Pro  96.3 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.928684 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAProVIMSS1309169  tRNA-Pro  96.3 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0026  tRNA-Pro  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0008  tRNA-Pro  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0045  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0056  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000452415  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAProVIMSS1309094  tRNA-Pro  96.3 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.220954  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAProVIMSS1309194  tRNA-Pro  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAProVIMSS1309128  tRNA-Pro  96.3 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309070  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0008  tRNA-Pro  100 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24870  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0005  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.964403 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03410  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.39149e-07  hitchhiker  1.96604e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>