More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_D0015 on replicon NC_014000
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014000  Ava_D0015  Histone-like DNA-binding protein  100 
 
 
97 aa  194  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2937  histone family protein DNA-binding protein  69.23 
 
 
95 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3159  histone family protein DNA-binding protein  69.23 
 
 
95 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.124819  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2489  histone family protein DNA-binding protein  68.54 
 
 
95 aa  123  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0318  histone family protein DNA-binding protein  68.54 
 
 
94 aa  123  7e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1767  nucleoid protein Hbs  67.42 
 
 
94 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1108  nucleoid protein Hbs  63.33 
 
 
91 aa  117  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0932961  normal  0.770831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0721  histone family protein DNA-binding protein  61.11 
 
 
91 aa  115  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1610  nucleoid protein Hbs  62.79 
 
 
95 aa  113  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148246  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0956  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 
98 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0983  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 
98 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0475372 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2802  DNA-binding protein HU  54.95 
 
 
91 aa  103  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000141643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2488  DNA-binding protein HU  54.95 
 
 
91 aa  103  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000405619  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2248  nucleoid protein Hbs  51.69 
 
 
91 aa  97.8  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0990789 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 
91 aa  97.8  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 
92 aa  97.8  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  53.49 
 
 
91 aa  96.7  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 
90 aa  96.7  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17471  histone-like DNA-binding protein  50.56 
 
 
91 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.631409  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0892  histone-like DNA-binding protein  50.56 
 
 
91 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.879625  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  54.26 
 
 
95 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0579  histone-like DNA-binding protein  50.56 
 
 
91 aa  95.5  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.410031  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2092  nucleoid protein Hbs  50.56 
 
 
91 aa  95.5  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13741  histone-like DNA-binding protein  50.55 
 
 
92 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 
90 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15071  histone-like DNA-binding protein  51.69 
 
 
91 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 
90 aa  94  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15201  histone-like DNA-binding protein  51.69 
 
 
91 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.581406  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05711  histone-like DNA-binding protein  49.44 
 
 
91 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 
91 aa  94  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14821  histone-like DNA-binding protein  50.56 
 
 
91 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1419  histone-like DNA-binding protein  50.56 
 
 
91 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 
91 aa  92.8  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 
91 aa  92  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 
90 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0648  non-specific DNA-binding protein HBsu  49.41 
 
 
110 aa  91.3  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.271458  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 
90 aa  90.5  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 
90 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 
90 aa  90.5  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 
90 aa  90.5  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 
90 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 
90 aa  90.5  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3398  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 
92 aa  90.5  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000223697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 
90 aa  90.5  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 
90 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 
90 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 
90 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 
90 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 
90 aa  90.1  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 
91 aa  89.4  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0083  DNA-binding protein HU (DNA-binding protein II)  52.33 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 
91 aa  90.1  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000108882  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0470  histone family protein DNA-binding protein  47.83 
 
 
94 aa  88.6  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 
90 aa  89.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000000481156  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 
90 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0532  histone-like protein  46.74 
 
 
94 aa  87.8  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  48.86 
 
 
91 aa  87.8  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 
90 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 
90 aa  87.4  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 
90 aa  87.4  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 
90 aa  87.4  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  46.51 
 
 
90 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 
90 aa  87  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 
90 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 
90 aa  87  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 
90 aa  87  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 
90 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 
90 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 
90 aa  87  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 
90 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2752  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 
91 aa  87  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 
90 aa  87  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0550  DNA-binding protein HU-beta  49.44 
 
 
92 aa  86.7  9e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 
91 aa  86.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2800  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 
91 aa  86.3  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.314241 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1227  HU family DNA-binding protein  44.94 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000165625  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1364  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  46.07 
 
 
90 aa  85.9  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  45.35 
 
 
90 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  47.19 
 
 
90 aa  85.5  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0964  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 
92 aa  85.5  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000994236  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  49.44 
 
 
92 aa  85.5  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 
95 aa  85.1  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  50 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  49.44 
 
 
90 aa  84.7  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  49.44 
 
 
91 aa  84.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1551  histone-like DNA-binding protein  48.31 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00525571  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0184  DNA-binding protein HU 1  49.44 
 
 
90 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  47.73 
 
 
91 aa  84  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  44.19 
 
 
91 aa  84  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>