14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0053 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007412  Ava_C0053  hypothetical protein  100 
 
 
750 aa  1536    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0689055  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3878  sensor protein  38.19 
 
 
782 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00432264  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5312  Appr-1-p processing domain protein  34.81 
 
 
694 aa  156  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5318  hypothetical protein  29.82 
 
 
550 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120389  normal  0.353542 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  32.24 
 
 
1073 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2131  Extracellular ligand-binding receptor  32.78 
 
 
813 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.651568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4219  heterocyst differentiation protein  26.34 
 
 
806 aa  64.3  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.638928 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3255  FHA domain containing protein  25.98 
 
 
569 aa  54.7  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3407  FHA domain containing protein  26.44 
 
 
562 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2709  FHA domain containing protein  26.44 
 
 
562 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0305  FHA domain-containing protein  23.92 
 
 
525 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0033  heterocyst differentiation protein HetF  28.19 
 
 
823 aa  48.1  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1337  FHA domain-containing protein  25.43 
 
 
559 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.04 
 
 
943 aa  46.2  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>