More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0024 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  100 
 
 
383 aa  747    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  48.77 
 
 
403 aa  335  7.999999999999999e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
403 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  46.17 
 
 
390 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  47.49 
 
 
407 aa  299  6e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  40.64 
 
 
394 aa  299  6e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  47.03 
 
 
404 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2920  major facilitator superfamily MFS_1  46.17 
 
 
389 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  46.43 
 
 
399 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  47.8 
 
 
400 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  45.67 
 
 
399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  47.4 
 
 
415 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  46.09 
 
 
429 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  46.09 
 
 
429 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  46.09 
 
 
398 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  46.09 
 
 
398 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  46.09 
 
 
398 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  46.09 
 
 
398 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  46.09 
 
 
398 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  46.43 
 
 
405 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  43.13 
 
 
399 aa  272  9e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  43.57 
 
 
395 aa  271  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  42.86 
 
 
399 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  44.83 
 
 
397 aa  268  8e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  41.38 
 
 
399 aa  268  8e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  43.41 
 
 
385 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2143  major facilitator transporter  48.06 
 
 
402 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  41.11 
 
 
399 aa  266  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  41.11 
 
 
399 aa  266  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  42.01 
 
 
399 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  42.74 
 
 
399 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  48.06 
 
 
402 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00295222  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  44.57 
 
 
399 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  44.09 
 
 
399 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  45.01 
 
 
399 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  43.57 
 
 
399 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  43.57 
 
 
399 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  44.74 
 
 
399 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1738  major facilitator superfamily MFS_1  47.78 
 
 
402 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.567776  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  45.72 
 
 
394 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  45.63 
 
 
394 aa  257  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  41.69 
 
 
394 aa  256  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  40.7 
 
 
406 aa  256  6e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  40.97 
 
 
406 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  40.72 
 
 
413 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  45.63 
 
 
394 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  40.38 
 
 
387 aa  252  7e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  41.21 
 
 
394 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  42.35 
 
 
391 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  41.21 
 
 
394 aa  251  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  41.21 
 
 
394 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  41.21 
 
 
394 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  41.21 
 
 
394 aa  250  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  42.42 
 
 
389 aa  250  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  42.52 
 
 
405 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  42.52 
 
 
405 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2837  major facilitator family transporter  45.01 
 
 
398 aa  246  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  40.22 
 
 
389 aa  245  9e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  40.22 
 
 
389 aa  245  9e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  43.13 
 
 
399 aa  245  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  41.21 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  43.72 
 
 
389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  39.79 
 
 
391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  40.93 
 
 
394 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  40.93 
 
 
394 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  40.93 
 
 
394 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  42.18 
 
 
399 aa  241  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  40.93 
 
 
394 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 
410 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  40.99 
 
 
405 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  40.99 
 
 
405 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  40.99 
 
 
405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  43.58 
 
 
403 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  42.78 
 
 
415 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3465  major facilitator superfamily MFS_1  39.06 
 
 
389 aa  239  9e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  41.98 
 
 
399 aa  237  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  42.25 
 
 
403 aa  237  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  37.33 
 
 
415 aa  237  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  40.66 
 
 
394 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  43.18 
 
 
413 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  40.78 
 
 
405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  44.47 
 
 
399 aa  233  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  38.15 
 
 
393 aa  229  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  37.23 
 
 
411 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  39.95 
 
 
426 aa  226  8e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  47.12 
 
 
423 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  42.82 
 
 
405 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  43.09 
 
 
399 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  41.03 
 
 
400 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  41.29 
 
 
401 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  40.87 
 
 
400 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  41.03 
 
 
400 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  42.55 
 
 
399 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  42.82 
 
 
399 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7258  major facilitator superfamily MFS_1  41.9 
 
 
407 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173664  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  42.82 
 
 
399 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  42.82 
 
 
399 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  42.82 
 
 
399 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  37.7 
 
 
401 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  42.47 
 
 
396 aa  220  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>