26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0265 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007410  Ava_B0265  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  381  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1127  WGR domain-containing protein  57.69 
 
 
56 aa  68.2  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0578376  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  44.64 
 
 
1314 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  43.86 
 
 
1822 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  38.6 
 
 
1422 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  28.89 
 
 
1264 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  30.11 
 
 
1262 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0857  WGR domain family  37.88 
 
 
194 aa  48.9  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4350  WGR domain protein  37.7 
 
 
1440 aa  47.8  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0376935 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  44.07 
 
 
1329 aa  47.8  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  30 
 
 
1264 aa  47  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  30 
 
 
1264 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  30 
 
 
1264 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  42.86 
 
 
1291 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1569  WGR domain protein  37.88 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.380213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  41.07 
 
 
1838 aa  45.1  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4733  WGR domain-containing protein  32.86 
 
 
1030 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02320  hypothetical protein  32.31 
 
 
244 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.277615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02281  hypothetical protein  32.31 
 
 
244 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2555  WGR domain-containing protein  32.81 
 
 
244 aa  42.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0359836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1241  WGR domain protein  32.81 
 
 
244 aa  42.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411357  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  38.18 
 
 
1297 aa  42.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5519  WGR domain protein  30 
 
 
88 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468487  hitchhiker  0.00260514 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1411  molybdate metabolism regulator  31.34 
 
 
251 aa  41.2  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4763  WGR domain-containing protein  34.09 
 
 
184 aa  40.8  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000263254  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  34.33 
 
 
1822 aa  40.8  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>