110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0239 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  100 
 
 
563 aa  1141    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  49.1 
 
 
533 aa  451  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  48.59 
 
 
531 aa  450  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  48.5 
 
 
574 aa  432  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  44.07 
 
 
581 aa  422  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  47.53 
 
 
561 aa  420  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  45.37 
 
 
639 aa  410  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  45.32 
 
 
529 aa  407  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  45.49 
 
 
624 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  43.91 
 
 
491 aa  387  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  41.67 
 
 
542 aa  377  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  43.33 
 
 
539 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  41.19 
 
 
550 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  43.01 
 
 
604 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  42.58 
 
 
571 aa  360  6e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  41.74 
 
 
530 aa  358  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  41.51 
 
 
572 aa  349  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  40.15 
 
 
600 aa  346  6e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  42.2 
 
 
658 aa  346  7e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  41.87 
 
 
622 aa  346  8e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  38.04 
 
 
551 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  38.74 
 
 
641 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  37.81 
 
 
550 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  34.68 
 
 
508 aa  300  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  36.48 
 
 
606 aa  299  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  36.93 
 
 
666 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  36.93 
 
 
666 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  37.97 
 
 
643 aa  289  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  36.04 
 
 
591 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  34.97 
 
 
586 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  34.97 
 
 
586 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  34.74 
 
 
581 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  34.74 
 
 
581 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  34.99 
 
 
593 aa  260  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  35.73 
 
 
543 aa  255  1.0000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  35.95 
 
 
531 aa  256  1.0000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  31.73 
 
 
589 aa  254  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  37.14 
 
 
518 aa  254  4.0000000000000004e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  37.8 
 
 
548 aa  253  6e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  37.44 
 
 
645 aa  253  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  37.65 
 
 
632 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  35.63 
 
 
629 aa  229  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  33.89 
 
 
510 aa  218  2e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  34.22 
 
 
578 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  32.35 
 
 
513 aa  207  4e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  33.33 
 
 
500 aa  206  9e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  31.51 
 
 
543 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  33.28 
 
 
561 aa  196  8.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  32.15 
 
 
568 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  31.81 
 
 
528 aa  194  3e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  33.51 
 
 
518 aa  192  1e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  31.37 
 
 
555 aa  192  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  33.69 
 
 
531 aa  192  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  29.93 
 
 
514 aa  188  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  55.68 
 
 
524 aa  184  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  40.82 
 
 
475 aa  172  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  30.74 
 
 
527 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  28.75 
 
 
544 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  59.35 
 
 
188 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  36.56 
 
 
515 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  32.07 
 
 
450 aa  100  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  36.02 
 
 
515 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  51.28 
 
 
261 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  51.43 
 
 
262 aa  91.3  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  51.43 
 
 
262 aa  91.3  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  21.46 
 
 
437 aa  73.9  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  29.15 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  27.97 
 
 
449 aa  66.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  30.61 
 
 
485 aa  65.9  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  22.51 
 
 
414 aa  64.7  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  22.64 
 
 
432 aa  64.3  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  27.91 
 
 
946 aa  63.5  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  34.29 
 
 
932 aa  61.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  31.58 
 
 
426 aa  60.8  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  35.24 
 
 
416 aa  59.3  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  36.19 
 
 
919 aa  58.2  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  34.17 
 
 
673 aa  57.8  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  26.78 
 
 
432 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  27.4 
 
 
415 aa  55.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  22.89 
 
 
383 aa  54.3  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  31.48 
 
 
361 aa  53.5  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  29.91 
 
 
330 aa  53.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  31.18 
 
 
255 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  44.44 
 
 
1036 aa  52.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  28.33 
 
 
343 aa  51.6  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  25.67 
 
 
784 aa  51.6  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  35.78 
 
 
408 aa  50.4  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  30.53 
 
 
186 aa  50.4  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  32.73 
 
 
424 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2220  hypothetical protein  26.56 
 
 
536 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000188992  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  35.48 
 
 
441 aa  48.9  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  41.82 
 
 
413 aa  49.7  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  41.07 
 
 
1821 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  41.94 
 
 
575 aa  48.5  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  41.54 
 
 
506 aa  48.9  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  40.91 
 
 
414 aa  48.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  41.38 
 
 
558 aa  47  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  36.36 
 
 
400 aa  47  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  38.89 
 
 
400 aa  46.2  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  42.22 
 
 
468 aa  45.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>