More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0162 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007410  Ava_B0162  transport system permease protein  100 
 
 		 359 aa  692    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3088  transport system permease protein  62.85 
 
 		 371 aa  359  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2250  transport system permease protein  62.85 
 
 		 374 aa  323  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0288275 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1298  transport system permease protein  52.83 
 
 		 362 aa  318  1e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0278  transport system permease protein  50.63 
 
 		 360 aa  318  1e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0561654  normal  0.124671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3337  transport system permease protein  52.78 
 
 		 340 aa  306  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1004  transport system permease protein  53.46 
 
 		 364 aa  300  3e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00447808  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12518  iron(III) ABC transporter, permease protein, putative  47.81 
 
 		 340 aa  298  9e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0082  transport system permease protein  47.34 
 
 		 322 aa  290  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.85435  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2111  transport system permease protein  45.37 
 
 		 391 aa  282  7.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.453774  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0343  transport system permease protein  46.23 
 
 		 355 aa  269  5e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0671  iron compound ABC transporter, permease protein  45.57 
 
 		 356 aa  266  4e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.170455 
 
 
-
 
NC_002950  PG0647  iron compound ABC transporter, permease protein  45.23 
 
 		 344 aa  261  2e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.499721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3542  transport system permease protein  47.92 
 
 		 364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5231  transport system permease protein  45.62 
 
 		 346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1257  transport system permease protein  42.14 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0747  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  36.53 
 
 		 343 aa  224  3e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3497  transport system permease protein  48.45 
 
 		 355 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0278  transport system permease protein  43.07 
 
 		 334 aa  195  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364579  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24450  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  35.17 
 
 		 350 aa  187  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0114  transport system permease protein  33.13 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  33.43 
 
 		 354 aa  176  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  36.36 
 
 		 363 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  35.54 
 
 		 371 aa  172  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  34.74 
 
 		 370 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  30.97 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  34.48 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  29.66 
 
 		 356 aa  160  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  31.87 
 
 		 359 aa  160  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  35.35 
 
 		 357 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  31.08 
 
 		 366 aa  159  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  31.66 
 
 		 334 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  32.62 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  31.66 
 
 		 334 aa  158  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  34.39 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  31.66 
 
 		 334 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  34.3 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  34.49 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  34.31 
 
 		 340 aa  157  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  32.65 
 
 		 340 aa  156  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  34.66 
 
 		 358 aa  155  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  32.61 
 
 		 343 aa  155  9e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  32.36 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4407  transport system permease protein  34.65 
 
 		 376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0130  transport system permease protein  30.99 
 
 		 348 aa  153  4e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.17857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  31.46 
 
 		 343 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  32.33 
 
 		 330 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  32.33 
 
 		 360 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2233  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  31.64 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0722413  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  29.38 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  33.23 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  32.04 
 
 		 355 aa  150  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  32.35 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  34.89 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1468  vtamin B12-transporter permease  36.59 
 
 		 326 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1435  vtamin B12-transporter permease  36.59 
 
 		 326 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0354813 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  32.93 
 
 		 337 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1833  vtamin B12-transporter permease  36.59 
 
 		 326 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.342268  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2005  vtamin B12-transporter permease  36.59 
 
 		 326 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.509358 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  32.74 
 
 		 338 aa  150  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  29.03 
 
 		 348 aa  150  5e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1451  vtamin B12-transporter permease  36.59 
 
 		 326 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2321  transport system permease protein  32.11 
 
 		 346 aa  149  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  28.74 
 
 		 348 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2734  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  31.1 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000167037  hitchhiker  0.000165993 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  33.73 
 
 		 365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  32.91 
 
 		 357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01680  vtamin B12-transporter permease  36.24 
 
 		 326 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1931  transport system permease protein  36.24 
 
 		 326 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00205827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1930  vtamin B12-transporter permease  36.24 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00226641  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1479  vtamin B12-transporter permease  36.24 
 
 		 326 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.950653 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  32.93 
 
 		 363 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  34.27 
 
 		 354 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01669  hypothetical protein  36.24 
 
 		 326 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.028051  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1915  vtamin B12-transporter permease  36.24 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1920  vtamin B12-transporter permease  36.24 
 
 		 326 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.482495 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  31.64 
 
 		 329 aa  148  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1443  transport system permease protein  35.6 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0618013  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1791  vtamin B12-transporter permease  36.24 
 
 		 326 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.979653  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  31.25 
 
 		 356 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  31.71 
 
 		 352 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  32.89 
 
 		 345 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  34.01 
 
 		 369 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2151  vtamin B12-transporter permease  32.56 
 
 		 335 aa  146  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  32.51 
 
 		 363 aa  146  6e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  29.14 
 
 		 362 aa  146  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  32.94 
 
 		 344 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  31.12 
 
 		 350 aa  146  6e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003687  vitamin B12 ABC transporter permease component BtuC  31.63 
 
 		 337 aa  146  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  34.53 
 
 		 356 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  34.06 
 
 		 354 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  30.61 
 
 		 331 aa  145  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  29.21 
 
 		 348 aa  145  9e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  29.41 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2429  vtamin B12-transporter permease  35.89 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  31.34 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2441  transport system permease protein  33.64 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00106696  normal  0.535476 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  28.7 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  30.65 
 
 		 347 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  30.27 
 
 		 370 aa  144  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>