88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_5056 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_5056  Phage integrase  100 
 
 		 473 aa  979    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3092  Phage integrase  29.79 
 
 		 386 aa  143  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000712508  normal  0.602347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  28.31 
 
 		 395 aa  120  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3161  integrase family protein  25.06 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0697  integrase family protein  25.53 
 
 		 387 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  26.03 
 
 		 396 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  29.41 
 
 		 363 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1704  integrase family protein  26.06 
 
 		 391 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01743  normal  0.0235893 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2575  Phage integrase  33.33 
 
 		 147 aa  75.1  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  25.11 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  27.64 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  27.27 
 
 		 356 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  24.44 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  29.76 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1986  phage integrase family site specific recombinase  27.64 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  25.59 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  25.61 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  25.81 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2621  integrase family protein  22.82 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  25.94 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  29.05 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0607  integrase  27.52 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  26.4 
 
 		 386 aa  55.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2577  integrase  27.08 
 
 		 216 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.922481 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  24.46 
 
 		 392 aa  54.3  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  24.69 
 
 		 276 aa  54.3  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1932  integrase/recombinase, phage associated  23.01 
 
 		 379 aa  53.5  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.706433  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  23.77 
 
 		 414 aa  53.5  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  23.55 
 
 		 379 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  23.55 
 
 		 379 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  22.07 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  25.39 
 
 		 400 aa  51.2  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.35 
 
 		 376 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.35 
 
 		 376 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  25.14 
 
 		 374 aa  50.8  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  26.71 
 
 		 384 aa  50.4  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.81 
 
 		 345 aa  50.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  27.22 
 
 		 308 aa  50.4  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  21.61 
 
 		 403 aa  50.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  25.68 
 
 		 293 aa  50.4  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  22.71 
 
 		 300 aa  50.1  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  26.07 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3541  phage integrase family protein  23.53 
 
 		 452 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  22.92 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  26.04 
 
 		 376 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  23.27 
 
 		 275 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  26.37 
 
 		 370 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  24.12 
 
 		 423 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  22.42 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  27.42 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  24.35 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0524  integrase family protein  21.01 
 
 		 407 aa  48.5  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  28.22 
 
 		 388 aa  48.5  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  22.58 
 
 		 356 aa  48.5  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  21.29 
 
 		 396 aa  48.1  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  21.35 
 
 		 378 aa  47.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  22.22 
 
 		 190 aa  47.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  25 
 
 		 308 aa  48.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  23.74 
 
 		 357 aa  47.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  21.48 
 
 		 403 aa  47.4  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  25 
 
 		 422 aa  47  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  26.46 
 
 		 412 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  37.04 
 
 		 367 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  23.53 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0949  phage integrase family protein  25 
 
 		 275 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.427827  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  30.43 
 
 		 309 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3145  integrase family protein  33.33 
 
 		 438 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00138908  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  22.35 
 
 		 292 aa  46.6  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.81 
 
 		 301 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  21.89 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3198  phage integrase family protein  22.83 
 
 		 481 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00055916  hitchhiker  0.0000000690762 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  29.35 
 
 		 303 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00310  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.6 
 
 		 429 aa  45.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  21.38 
 
 		 430 aa  45.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1993  phage integrase family site specific recombinase  23.5 
 
 		 373 aa  45.1  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3866  phage integrase family site specific recombinase  23.18 
 
 		 368 aa  45.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.06 
 
 		 318 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  36.84 
 
 		 435 aa  44.3  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  25.68 
 
 		 401 aa  44.7  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.06 
 
 		 318 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  25.82 
 
 		 301 aa  44.3  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  31.03 
 
 		 308 aa  43.9  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  24.32 
 
 		 359 aa  43.9  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  21.2 
 
 		 375 aa  43.9  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  24.67 
 
 		 297 aa  43.5  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.67 
 
 		 297 aa  43.5  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2427  phage integrase family protein  25.29 
 
 		 414 aa  43.5  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  26.24 
 
 		 407 aa  43.1  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>