21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_5048 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_5048  hypothetical protein  100 
 
 
570 aa  1126    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.237947  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2582  hypothetical protein  36.3 
 
 
626 aa  323  5e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.296353  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  45.3 
 
 
552 aa  267  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  44.44 
 
 
546 aa  247  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  44.91 
 
 
624 aa  246  6e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  38.85 
 
 
693 aa  210  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0548  hypothetical protein  26.05 
 
 
400 aa  92  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3317  hypothetical protein  50 
 
 
106 aa  72.8  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2520  hypothetical protein  35.71 
 
 
585 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  25.28 
 
 
422 aa  55.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  23.14 
 
 
428 aa  53.5  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1947  Sporulation domain protein  37.68 
 
 
362 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1974  Sporulation domain protein  37.68 
 
 
362 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.160258  normal  0.0302087 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0039  hypothetical protein  39.06 
 
 
389 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  22.61 
 
 
445 aa  45.8  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0434  Serine/threonine protein kinase  24.78 
 
 
674 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000341904  normal  0.409693 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0467  ATPase central domain-containing protein  29.23 
 
 
564 aa  44.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.12935 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  21.1 
 
 
423 aa  44.3  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  21.1 
 
 
423 aa  44.3  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  27.63 
 
 
528 aa  44.3  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  25.11 
 
 
635 aa  43.9  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>