More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4952 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  100 
 
 
454 aa  935    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  85.31 
 
 
430 aa  764    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  83.75 
 
 
437 aa  761    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  87.59 
 
 
441 aa  768    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  84.1 
 
 
432 aa  758    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  84.67 
 
 
437 aa  770    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  84.1 
 
 
432 aa  758    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  90.78 
 
 
434 aa  825    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  65.92 
 
 
408 aa  538  9.999999999999999e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  62.44 
 
 
412 aa  535  1e-151  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  59.4 
 
 
414 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  61.54 
 
 
411 aa  474  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  55.4 
 
 
425 aa  458  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  56.03 
 
 
419 aa  455  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  56.12 
 
 
425 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  54.79 
 
 
429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  54.09 
 
 
428 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  54.81 
 
 
416 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  54.98 
 
 
424 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  55.61 
 
 
413 aa  432  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  55.17 
 
 
416 aa  430  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  53.5 
 
 
429 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  53.83 
 
 
439 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  52.71 
 
 
421 aa  427  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  55.72 
 
 
428 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  53.3 
 
 
418 aa  421  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  55.21 
 
 
418 aa  421  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  55.72 
 
 
428 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  54.91 
 
 
426 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  54.21 
 
 
420 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  54.04 
 
 
424 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  45.25 
 
 
404 aa  363  4e-99  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  40 
 
 
404 aa  296  6e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  40 
 
 
404 aa  296  7e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  40.1 
 
 
404 aa  293  5e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  39.6 
 
 
403 aa  291  1e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  38.88 
 
 
421 aa  286  4e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  39.04 
 
 
404 aa  286  7e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  38.71 
 
 
405 aa  276  4e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  38.26 
 
 
414 aa  273  4.0000000000000004e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  38.21 
 
 
401 aa  259  6e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  37.59 
 
 
399 aa  257  3e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  37.38 
 
 
402 aa  253  6e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  36.79 
 
 
401 aa  246  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  37.87 
 
 
401 aa  246  6e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  37.41 
 
 
419 aa  239  6.999999999999999e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  36.48 
 
 
416 aa  237  2e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  36.86 
 
 
402 aa  224  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  31.93 
 
 
441 aa  213  7e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  33.85 
 
 
405 aa  210  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  33.25 
 
 
403 aa  209  6e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  31.7 
 
 
403 aa  207  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  38.33 
 
 
345 aa  202  9e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  37.22 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  35.39 
 
 
351 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  32.15 
 
 
423 aa  199  6e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  36.93 
 
 
346 aa  199  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  38.55 
 
 
348 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  32.59 
 
 
427 aa  197  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  34.24 
 
 
422 aa  196  8.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4507  threonine synthase  35.13 
 
 
357 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.871265  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  33.16 
 
 
432 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0596  threonine synthase  35.11 
 
 
380 aa  190  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  35.98 
 
 
348 aa  189  7e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1324  threonine synthase  32.64 
 
 
402 aa  189  8e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  36.62 
 
 
356 aa  189  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  31.23 
 
 
422 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  31.79 
 
 
396 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  32.75 
 
 
419 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  35.69 
 
 
348 aa  188  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2612  threonine synthase  37.28 
 
 
366 aa  187  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0979527 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  37.54 
 
 
368 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3123  L-threonine synthase  38.02 
 
 
355 aa  186  8e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  37.11 
 
 
351 aa  186  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  35.9 
 
 
351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  36.44 
 
 
348 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4152  threonine synthase  36.52 
 
 
361 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.231513  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  32.93 
 
 
459 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  34.46 
 
 
394 aa  183  5.0000000000000004e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1253  threonine synthase  36.73 
 
 
363 aa  183  6e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  37.92 
 
 
352 aa  183  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1205  threonine synthase  36.16 
 
 
348 aa  182  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2927  threonine synthase  33.33 
 
 
397 aa  182  8.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  37.61 
 
 
352 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  37.61 
 
 
352 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  36.34 
 
 
349 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  37.12 
 
 
352 aa  182  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1006  threonine synthase  36.46 
 
 
374 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  34.01 
 
 
396 aa  181  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  37.61 
 
 
352 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  37.61 
 
 
352 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2423  threonine synthase  37.46 
 
 
354 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3117  threonine synthase  36.52 
 
 
363 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  34.75 
 
 
371 aa  182  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  35.78 
 
 
353 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  37.92 
 
 
352 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  37.61 
 
 
352 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  35.78 
 
 
353 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  35.45 
 
 
354 aa  181  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0634  threonine synthase  35.01 
 
 
373 aa  180  4e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>