60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4869 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4869  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 
148 aa  302  9e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536474  unclonable  9.99645e-08 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4159  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.66 
 
 
115 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1228  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  53.33 
 
 
114 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1199  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  53.33 
 
 
114 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2539  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  54.35 
 
 
111 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1021  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.72 
 
 
115 aa  101  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  3.10459e-05  unclonable  3.57935e-09 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0265  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.74 
 
 
111 aa  93.2  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0429  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.34 
 
 
116 aa  90.1  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1107  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.01 
 
 
113 aa  86.3  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2067  toxin ChpA  45.65 
 
 
108 aa  85.1  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2490  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.39 
 
 
109 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3898  toxin ChpA  34.51 
 
 
110 aa  84.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363948  normal  0.172464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1099  ChpA protein  44.57 
 
 
113 aa  82  2e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0963556  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01482  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.22 
 
 
112 aa  80.1  1e-14  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1937  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.46 
 
 
110 aa  78.2  3e-14  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02589  hypothetical protein  39.56 
 
 
111 aa  76.3  2e-13  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  5.6084e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0930  toxin ChpA  39.56 
 
 
103 aa  75.9  2e-13  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000206991  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4042  toxin ChpA  39.56 
 
 
111 aa  76.3  2e-13  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  3.88483e-07  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1017  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.48 
 
 
109 aa  75.5  2e-13  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3086  toxin ChpA  39.56 
 
 
111 aa  75.9  2e-13  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.09045e-10  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02627  toxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system, endoribonuclease  39.56 
 
 
111 aa  76.3  2e-13  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  3.70759e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2920  toxin ChpA  39.56 
 
 
111 aa  75.9  2e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000686349  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2926  toxin ChpA  39.56 
 
 
111 aa  76.3  2e-13  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.98718e-14  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.56 
 
 
111 aa  76.3  2e-13  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.83509e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3091  toxin ChpA  39.56 
 
 
111 aa  74.7  3e-13  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00144272  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3061  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.68 
 
 
124 aa  74.3  5e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4624  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.48 
 
 
116 aa  72  2e-12  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5124  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.39 
 
 
108 aa  71.2  5e-12  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0890  toxin ChpB  44.68 
 
 
115 aa  70.5  8e-12  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3250  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.97 
 
 
123 aa  70.1  9e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.493991  normal  0.819791 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3503  plasmid stable inheritance protein K  38.95 
 
 
103 aa  67  8e-11  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3598  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.13 
 
 
108 aa  66.6  1e-10  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0164  stable plasmid inheritance protein PemK  38.3 
 
 
121 aa  65.5  2e-10  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.68925e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4224  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.07 
 
 
120 aa  63.5  8e-10  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5698  toxin ChpB  33.94 
 
 
116 aa  63.5  1e-09  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.783517  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3376  toxin ChpB  38.95 
 
 
116 aa  61.6  3e-09  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00160549  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5408  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.87 
 
 
119 aa  60.8  6e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414606  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4418  toxin ChpB  41.49 
 
 
115 aa  60.5  8e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0771  toxin ChpB  39.36 
 
 
115 aa  58.5  3e-08  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0041  mRNA endonuclease-like protein PemK  38.1 
 
 
105 aa  51.6  4e-06  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4478  toxin ChpB  33.68 
 
 
116 aa  50.4  7e-06  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5742  toxin ChpB  33.68 
 
 
116 aa  50.4  7e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4794  toxin ChpB  33.68 
 
 
116 aa  50.4  7e-06  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3768  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.68 
 
 
104 aa  50.4  9e-06  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4703  toxin ChpB  33.68 
 
 
116 aa  49.3  2e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1479  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.46 
 
 
133 aa  48.9  2e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.937669  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2866  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.48 
 
 
120 aa  47.8  5e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.134272  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2885  PemK family protein  31 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.670266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1971  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.42 
 
 
114 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0024  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.73 
 
 
107 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0745  growth inhibitor, PemK-like protein  36 
 
 
110 aa  44.7  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12680  growth inhibitor  30 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1568  PemK-like protein  29.79 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2505  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.77 
 
 
102 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2924  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.61 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.13253  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2470  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.97 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3432  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.18 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.328509  normal  0.0986406 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3743  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.11 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.96135e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2503  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.66 
 
 
109 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118079  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0402  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.71 
 
 
107 aa  40  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>