More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4866 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  100 
 
 
401 aa  830  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  1.72014e-07 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  57.77 
 
 
392 aa  481  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  55.16 
 
 
415 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  53.96 
 
 
395 aa  465  1e-130  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  53.96 
 
 
395 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  53.18 
 
 
404 aa  454  1e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  50.39 
 
 
387 aa  402  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1586  putative L-cysteine/cystine lyase  41.15 
 
 
400 aa  303  3e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21101  putative L-cysteine/cystine lyase  39.39 
 
 
428 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  37.97 
 
 
400 aa  279  6e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1748  putative L-cysteine/cystine lyase  37.82 
 
 
400 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.701457  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04121  putative L-cysteine/cystine lyase  39.12 
 
 
391 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0272358  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0791  putative L-cysteine/cystine lyase  39.12 
 
 
388 aa  276  4e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51384  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0410  putative L-cysteine/cystine lyase  34.2 
 
 
391 aa  252  9e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.33409  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04341  putative L-cysteine/cystine lyase  34.19 
 
 
390 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.12464  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04761  putative L-cysteine/cystine lyase  35.49 
 
 
391 aa  250  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  34.46 
 
 
391 aa  242  7e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.283231  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  34.33 
 
 
287 aa  170  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  30.67 
 
 
372 aa  167  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  29.69 
 
 
367 aa  156  5e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  30.61 
 
 
374 aa  155  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  28.83 
 
 
403 aa  154  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  28.72 
 
 
379 aa  150  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  27.39 
 
 
407 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  34.56 
 
 
363 aa  146  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  29.25 
 
 
411 aa  145  8e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  27.72 
 
 
368 aa  145  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  28.18 
 
 
401 aa  142  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  26.18 
 
 
381 aa  142  1e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  30.1 
 
 
394 aa  141  2e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  30.81 
 
 
380 aa  139  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.3 
 
 
412 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  28.42 
 
 
377 aa  137  3e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  2.23228e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  26.99 
 
 
377 aa  134  4e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  25.77 
 
 
376 aa  132  9e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  27.43 
 
 
414 aa  132  1e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  28.21 
 
 
387 aa  130  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  26.94 
 
 
414 aa  129  1e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  28.64 
 
 
430 aa  128  2e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.59 
 
 
414 aa  127  2e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  27.55 
 
 
394 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  26.23 
 
 
381 aa  127  4e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  32.04 
 
 
380 aa  127  4e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  27.27 
 
 
393 aa  126  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  30.75 
 
 
383 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  27.39 
 
 
378 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  29.88 
 
 
382 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.8217e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  27.48 
 
 
393 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  27.72 
 
 
394 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  32.4 
 
 
399 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  24.94 
 
 
395 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  2.19699e-09 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  27.36 
 
 
393 aa  122  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  26.77 
 
 
392 aa  122  1e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  27.86 
 
 
391 aa  122  2e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  24.93 
 
 
393 aa  121  2e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.38 
 
 
413 aa  122  2e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  25.26 
 
 
377 aa  120  4e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  29.4 
 
 
404 aa  120  5e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  27.94 
 
 
381 aa  120  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  25.63 
 
 
386 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  25.63 
 
 
386 aa  119  8e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  30.08 
 
 
376 aa  117  2e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  29.62 
 
 
380 aa  118  2e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  29.35 
 
 
385 aa  118  2e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  28.14 
 
 
401 aa  118  2e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  27.97 
 
 
379 aa  117  2e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  27.07 
 
 
399 aa  117  4e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  29.88 
 
 
381 aa  117  4e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  25.19 
 
 
414 aa  117  4e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  25.33 
 
 
377 aa  116  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  25.31 
 
 
413 aa  116  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  28.7 
 
 
393 aa  116  7e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  29.14 
 
 
417 aa  115  1e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  27.95 
 
 
395 aa  115  1e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  24.02 
 
 
377 aa  115  1e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0199  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.27 
 
 
403 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  27.17 
 
 
394 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  27.67 
 
 
437 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  30.22 
 
 
400 aa  114  4e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  29.18 
 
 
381 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  2.09414e-05 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  33.33 
 
 
414 aa  113  7e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  5.61511e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  32.06 
 
 
385 aa  112  8e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  34.47 
 
 
392 aa  112  1e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  26.67 
 
 
391 aa  112  1e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.52 
 
 
403 aa  112  1e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.71 
 
 
433 aa  112  1e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  28.61 
 
 
378 aa  112  1e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  24.48 
 
 
438 aa  112  1e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  25.63 
 
 
880 aa  111  2e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  29.13 
 
 
381 aa  111  2e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  31.58 
 
 
382 aa  112  2e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  25.93 
 
 
416 aa  111  2e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  27.92 
 
 
425 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00821  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  28.77 
 
 
417 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.67 
 
 
426 aa  111  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  28.15 
 
 
382 aa  111  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0840  SufS subfamily cysteine desulfurase  28 
 
 
437 aa  111  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.550163  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  26.43 
 
 
430 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2777  aminotransferase, class V  26.47 
 
 
409 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0743  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.29 
 
 
445 aa  110  4e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>