More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4861 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  70.27 
 
 
483 aa  712  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  68.54 
 
 
481 aa  701  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  80.21 
 
 
481 aa  811  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  4.48328e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  69.52 
 
 
482 aa  698  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  70.48 
 
 
483 aa  712  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
481 aa  992  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  7.02508e-12  unclonable  1.80865e-07 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  67.98 
 
 
481 aa  662  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  67.01 
 
 
881 aa  692  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06791  glutamyl-tRNA synthetase  61.04 
 
 
476 aa  596  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0641  glutamyl-tRNA synthetase  58.66 
 
 
477 aa  570  1e-161  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1806  glutamyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 
476 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05291  glutamyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 
492 aa  561  1e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0717874 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1719  glutamyl-tRNA synthetase  56.37 
 
 
477 aa  559  1e-158  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 
492 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0473  glutamyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 
479 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.138189  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05371  glutamyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 
493 aa  493  1e-138  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04981  glutamyl-tRNA synthetase  50 
 
 
476 aa  494  1e-138  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.475242  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05281  glutamyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
476 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 
482 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
485 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.94011e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
491 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
485 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  4.30888e-08  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
477 aa  391  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
479 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 
488 aa  387  1e-106  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
485 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.49346e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
490 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.92193e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
494 aa  382  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
488 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.04549e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
486 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  5.07745e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
467 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
467 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  5.0225e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  41 
 
 
466 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
490 aa  368  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
491 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
485 aa  363  4e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  5.2897e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 
498 aa  362  8e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
480 aa  361  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
491 aa  362  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.69227e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 
484 aa  361  2e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
471 aa  360  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  9.08657e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
471 aa  361  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
471 aa  361  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  8.38412e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
471 aa  360  3e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.12104e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
471 aa  359  5e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.72763e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
471 aa  359  5e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  5.85345e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
485 aa  359  5e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  7.68632e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  42.32 
 
 
471 aa  359  5e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  2.11719e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
471 aa  359  5e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
471 aa  360  5e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
471 aa  359  5e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.63468e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
485 aa  360  5e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.36948e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
485 aa  359  5e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  4.57939e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
485 aa  359  5e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.72568e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
485 aa  359  5e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  9.37191e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
485 aa  359  5e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.96162e-10  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
471 aa  359  5e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.07097e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
471 aa  359  8e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  3.52174e-07  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
478 aa  358  1e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
466 aa  358  1e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
491 aa  358  1e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.14653e-06  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 
484 aa  357  2e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
471 aa  358  2e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.64093e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
465 aa  358  2e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
466 aa  357  3e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
466 aa  357  3e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
470 aa  356  5e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
464 aa  355  8e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
467 aa  355  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
471 aa  355  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 
483 aa  354  2e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 
471 aa  354  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 
471 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  6.33167e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 
471 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3417  glutamyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 
469 aa  351  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  6.34908e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 
471 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 
471 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.65684e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
465 aa  352  1e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 
470 aa  351  1e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  5.00466e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
485 aa  350  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.67432e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 
501 aa  351  2e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
466 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
472 aa  350  3e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 
469 aa  350  3e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
471 aa  350  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
509 aa  348  1e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
484 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
484 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
464 aa  348  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
491 aa  346  4e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.57278e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
469 aa  347  4e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  1.59151e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
481 aa  346  6e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 
469 aa  346  7e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
470 aa  345  7e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 
470 aa  345  7e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 
467 aa  345  8e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  2.81277e-07 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
493 aa  345  1e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
499 aa  344  2e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.20471e-10  hitchhiker  3.82568e-09 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2931  glutamyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
471 aa  344  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  4.00457e-07  normal  0.117314 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 
469 aa  344  2e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>