More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4849 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
973 aa  1993    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  45.22 
 
 
1033 aa  794    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  46.77 
 
 
576 aa  231  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0537  pentapeptide repeat-containing protein  26.62 
 
 
959 aa  212  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.884465  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  65.29 
 
 
277 aa  132  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  25.94 
 
 
900 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 
299 aa  109  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  50.77 
 
 
260 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  50.78 
 
 
745 aa  100  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  51.15 
 
 
517 aa  100  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  44.37 
 
 
263 aa  98.2  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  49.24 
 
 
203 aa  96.3  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  46.45 
 
 
309 aa  95.5  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  53.28 
 
 
184 aa  95.1  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  46.1 
 
 
199 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  45.86 
 
 
294 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  44.44 
 
 
250 aa  92  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  52 
 
 
213 aa  91.3  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  50.42 
 
 
241 aa  91.3  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  50.81 
 
 
222 aa  91.3  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  44.72 
 
 
521 aa  91.3  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  46.1 
 
 
199 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  51.09 
 
 
343 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  51.09 
 
 
343 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  38.39 
 
 
333 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  48.33 
 
 
567 aa  88.6  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  48.82 
 
 
433 aa  87.8  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  47.1 
 
 
286 aa  87.4  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  48.31 
 
 
447 aa  87.8  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  38.73 
 
 
256 aa  86.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  44.83 
 
 
278 aa  86.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  45.6 
 
 
243 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  38.79 
 
 
279 aa  85.9  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  38.79 
 
 
279 aa  85.9  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  50.41 
 
 
449 aa  85.9  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  48.28 
 
 
214 aa  86.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  45.52 
 
 
489 aa  85.5  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  43.36 
 
 
386 aa  85.5  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  50 
 
 
216 aa  85.1  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
206 aa  85.5  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  48.41 
 
 
222 aa  85.5  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  42.5 
 
 
180 aa  85.1  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  50.39 
 
 
441 aa  85.1  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  47.93 
 
 
215 aa  85.1  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  47.22 
 
 
267 aa  84.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  48.18 
 
 
311 aa  84.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  46.72 
 
 
234 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  43.07 
 
 
204 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2635  hypothetical protein  42.96 
 
 
245 aa  83.2  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224677  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  44.29 
 
 
493 aa  83.6  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  46.72 
 
 
234 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  45.52 
 
 
320 aa  82.8  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  49.07 
 
 
168 aa  82.8  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  48.51 
 
 
824 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  63.29 
 
 
206 aa  82.8  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  45.1 
 
 
225 aa  82.8  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  47.83 
 
 
389 aa  82.8  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  63.29 
 
 
206 aa  82.8  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  51.04 
 
 
156 aa  82  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  50 
 
 
142 aa  82.4  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  47.75 
 
 
1831 aa  82.4  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2150  hypothetical protein  43.51 
 
 
313 aa  82.4  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  40.68 
 
 
312 aa  82.4  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  55.56 
 
 
266 aa  82.4  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  48.28 
 
 
340 aa  82.4  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  47.62 
 
 
222 aa  82  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  58.14 
 
 
273 aa  82  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  44.7 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  45.31 
 
 
234 aa  81.6  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  51.85 
 
 
176 aa  81.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  51.85 
 
 
176 aa  81.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  42.75 
 
 
432 aa  80.5  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 
182 aa  80.9  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  44.25 
 
 
267 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  43.44 
 
 
440 aa  80.9  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  40.67 
 
 
315 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  46.77 
 
 
332 aa  80.9  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  35.45 
 
 
862 aa  80.9  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  37.65 
 
 
189 aa  80.1  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0521  hypothetical protein  46.34 
 
 
195 aa  80.5  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  46.81 
 
 
267 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  47.41 
 
 
351 aa  80.1  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  44.87 
 
 
204 aa  80.1  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24671  hypothetical protein  50 
 
 
102 aa  79.7  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  38.79 
 
 
219 aa  79.7  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3546  pentapeptide repeat-containing protein  46.36 
 
 
293 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000394958  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  48.67 
 
 
416 aa  79  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  39.25 
 
 
356 aa  79.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1882  hypothetical protein  45.6 
 
 
234 aa  79  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  39.25 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2141  pentapeptide repeat-containing protein  38.84 
 
 
222 aa  78.6  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  41.5 
 
 
456 aa  78.6  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  48.48 
 
 
147 aa  78.6  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  46.49 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  40.67 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  42.37 
 
 
450 aa  77.8  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  39.13 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  43.8 
 
 
245 aa  77.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  40.28 
 
 
260 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  44.35 
 
 
420 aa  77.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>