More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4824 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 
558 aa  1097  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  54.59 
 
 
431 aa  223  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  49.17 
 
 
414 aa  221  4e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  57.75 
 
 
413 aa  211  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  49.77 
 
 
413 aa  210  5e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  54.31 
 
 
552 aa  210  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  55.26 
 
 
546 aa  202  2e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  45.55 
 
 
624 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4792  hypothetical protein  57.34 
 
 
286 aa  175  2e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000777493  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  47.21 
 
 
669 aa  173  7e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4827  S-layer domain-containing protein  43.52 
 
 
521 aa  167  6e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  41.26 
 
 
693 aa  165  2e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2872  hypothetical protein  54.55 
 
 
236 aa  165  2e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174152  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1054  S-layer-like region  40 
 
 
422 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  51.05 
 
 
220 aa  151  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  50 
 
 
162 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3932  WD-40 repeat-containing protein  41.05 
 
 
914 aa  144  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237365  unclonable  6.34097e-05 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  46.31 
 
 
187 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  45.64 
 
 
187 aa  143  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  4.78309e-07 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  43.75 
 
 
279 aa  135  2e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  52.7 
 
 
238 aa  135  2e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  46.76 
 
 
261 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  44.52 
 
 
166 aa  134  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  48.95 
 
 
194 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  46.38 
 
 
194 aa  126  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  43.8 
 
 
160 aa  125  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  45.59 
 
 
187 aa  124  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  46.32 
 
 
163 aa  124  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  34.98 
 
 
1821 aa  121  4e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  43.48 
 
 
186 aa  120  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  45.26 
 
 
157 aa  117  4e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  44.37 
 
 
195 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  43.97 
 
 
178 aa  116  9e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  45.52 
 
 
156 aa  116  1e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  45.52 
 
 
156 aa  116  1e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  33.51 
 
 
920 aa  116  1e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  45.19 
 
 
190 aa  116  1e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  45.99 
 
 
165 aa  115  2e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  43.66 
 
 
194 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  40.94 
 
 
194 aa  114  7e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  40.94 
 
 
194 aa  114  7e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  43.28 
 
 
208 aa  113  8e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  42.36 
 
 
192 aa  113  8e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  41.84 
 
 
193 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  45.59 
 
 
161 aa  112  1e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  45.52 
 
 
133 aa  113  1e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  43.62 
 
 
184 aa  112  2e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  39.39 
 
 
202 aa  112  2e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  41.79 
 
 
166 aa  111  4e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  42.86 
 
 
184 aa  110  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  42.67 
 
 
161 aa  110  7e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  40.82 
 
 
185 aa  110  7e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  39.86 
 
 
186 aa  110  9e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  44.03 
 
 
133 aa  110  9e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  42.25 
 
 
191 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  30.96 
 
 
710 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  4.86639e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  31.69 
 
 
288 aa  109  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  34.44 
 
 
506 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  31.67 
 
 
531 aa  107  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  42.95 
 
 
190 aa  107  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  42.95 
 
 
190 aa  107  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  41.77 
 
 
308 aa  107  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  42.28 
 
 
184 aa  106  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  43.28 
 
 
133 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  34.57 
 
 
223 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  43.8 
 
 
141 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  44.19 
 
 
160 aa  105  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  31.66 
 
 
1321 aa  103  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  33.33 
 
 
189 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  35.05 
 
 
518 aa  103  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  39.08 
 
 
184 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  43.28 
 
 
133 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  43.28 
 
 
133 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  44.03 
 
 
157 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  41.83 
 
 
201 aa  102  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07881  hypothetical protein  37.24 
 
 
210 aa  101  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  41.1 
 
 
160 aa  101  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  34.78 
 
 
926 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3843  S-layer domain protein  34.54 
 
 
375 aa  101  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.21 
 
 
1328 aa  100  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  31.52 
 
 
693 aa  100  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  46.38 
 
 
168 aa  100  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.42 
 
 
1661 aa  100  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  37.41 
 
 
187 aa  99.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  35.14 
 
 
575 aa  99.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  40.74 
 
 
151 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  32.8 
 
 
1847 aa  99.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  39.19 
 
 
186 aa  99.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  42.21 
 
 
596 aa  98.2  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  36.73 
 
 
183 aa  97.8  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  43.55 
 
 
160 aa  98.2  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  43.07 
 
 
134 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5332  S-layer domain protein  37.7 
 
 
203 aa  96.3  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.645039  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 
191 aa  96.7  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  31.15 
 
 
1710 aa  95.9  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  31.88 
 
 
1226 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  3.13752e-05 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  37.96 
 
 
163 aa  94.7  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  37.96 
 
 
163 aa  94.7  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1723  beta-Ig-H3/fasciclin  37.68 
 
 
141 aa  94  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  40.29 
 
 
215 aa  93.6  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>