More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4714 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4714  thiosulphate-binding protein  100 
 
 
381 aa  772    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.217544  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3629  sulfate ABC transporter periplasmic sulfate-binding protein  74.21 
 
 
363 aa  569  1e-161  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2764  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  67.87 
 
 
361 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8377  normal  0.37323 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0044  thiosulphate-binding protein  61.9 
 
 
385 aa  442  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3454  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  62.32 
 
 
346 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3492  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  63 
 
 
377 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3352  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.3 
 
 
348 aa  421  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.59657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2750  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.43 
 
 
338 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4715  thiosulphate-binding protein  62.75 
 
 
378 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.250615  normal  0.353735 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1681  thiosulphate-binding protein  58 
 
 
350 aa  404  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235432  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1722  thiosulphate-binding protein  55.49 
 
 
361 aa  372  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1686  thiosulphate-binding protein  47.44 
 
 
341 aa  291  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.863569  normal  0.139145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1906  thiosulphate-binding protein  47.92 
 
 
337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896115  hitchhiker  0.00000000124986 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2105  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.58 
 
 
341 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1346  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.6 
 
 
337 aa  270  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0194  thiosulphate-binding protein  47.59 
 
 
337 aa  270  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648325  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4410  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.3 
 
 
342 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2196  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.93 
 
 
345 aa  268  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.559252  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5231  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.77 
 
 
335 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297946  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0291  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.77 
 
 
335 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483831 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5078  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.45 
 
 
335 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151813  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0308  sulfate-binding protein  48.56 
 
 
338 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1336  sulfate-binding precursor signal peptide protein  46.89 
 
 
336 aa  265  8e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.533362  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4118  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.66 
 
 
359 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000140992  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1211  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  42.3 
 
 
339 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0110956  normal  0.0538246 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1274  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  42.3 
 
 
339 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6755  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.41 
 
 
341 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0084  extracellular solute-binding protein  47.27 
 
 
336 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5843  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.73 
 
 
341 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.302205  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2345  thiosulphate-binding protein  42.58 
 
 
342 aa  262  6.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6842  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2470  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic ligand binding protein, CysP  46.33 
 
 
346 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0297151  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5171  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.81 
 
 
342 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138843  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03700  sulfate-binding protein precursor  44.34 
 
 
332 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000120397 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0967  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.51 
 
 
337 aa  259  7e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2531  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  42.22 
 
 
356 aa  258  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000783626  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0259  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  42.44 
 
 
345 aa  257  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.904874  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0628  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.31 
 
 
335 aa  257  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3894  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.53 
 
 
337 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0402445  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3315  hypothetical protein  44.3 
 
 
328 aa  256  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.227914  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0374  sulfate-binding protein precursor  44.44 
 
 
332 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1125  sulfate-binding protein  45.4 
 
 
351 aa  256  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1723  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.3 
 
 
329 aa  256  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000440935  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1011  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.97 
 
 
351 aa  256  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0563  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.31 
 
 
341 aa  256  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201199  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4345  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.57 
 
 
332 aa  256  6e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1781  thiosulphate-binding protein  45.95 
 
 
344 aa  255  8e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1196  sulfate ABC transporter, sulfate/thiosulfate-binding protein  45.69 
 
 
351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3560  thiosulphate-binding protein  43.91 
 
 
329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1572  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.02 
 
 
344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220413  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4652  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.95 
 
 
337 aa  253  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1045  thiosulphate-binding protein  43.27 
 
 
327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3400  thiosulphate-binding protein  44.27 
 
 
354 aa  253  6e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0940818  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31720  Sulfate-binding precursor protein  45.57 
 
 
332 aa  252  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0821  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.05 
 
 
329 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0561556  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4010  thiosulphate-binding protein  44.73 
 
 
329 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.311837 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1450  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  42.01 
 
 
343 aa  252  8.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.601582  normal  0.754893 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1552  thiosulphate-binding protein  44.7 
 
 
335 aa  252  1e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1799  sulfate adenylyltransferase, large subunit  46.05 
 
 
807 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1369  thiosulphate-binding protein  47.13 
 
 
335 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327074  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3804  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.41 
 
 
337 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0733  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.12 
 
 
337 aa  250  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3186  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate- binding protein  39.67 
 
 
352 aa  249  4e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0691326  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1638  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.71 
 
 
345 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.749782  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1978  thiosulphate-binding protein  47.27 
 
 
335 aa  249  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2422  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  42.42 
 
 
343 aa  249  8e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0618  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  41.61 
 
 
339 aa  248  1e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0236749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02518  ABC transporter sulfate binding protein  41.98 
 
 
365 aa  247  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.607163  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5393  ABC transporter substrate binding protein (sulfate)  42.25 
 
 
338 aa  248  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0845321  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5479  sulfate adenylyltransferase, large subunit  45.07 
 
 
798 aa  247  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0197363  decreased coverage  0.00943774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1773  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.51 
 
 
346 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.540986  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0698  ABC transporter sulfate binding protein  41.29 
 
 
339 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1156  thiosulphate-binding protein  43.59 
 
 
329 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6977  sulfate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  44.62 
 
 
329 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1517  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.2 
 
 
345 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1497  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.2 
 
 
345 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0507  thiosulphate-binding protein  43.28 
 
 
330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.347365  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2246  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  42.72 
 
 
349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1826  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  40.23 
 
 
340 aa  242  7.999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4739  thiosulphate-binding protein  45.87 
 
 
345 aa  242  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0623695  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1636  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.87 
 
 
345 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.778191  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1629  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.03 
 
 
347 aa  242  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482062  normal  0.69185 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03802  sulfate transporter subunit  42.12 
 
 
329 aa  240  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4068  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  42.12 
 
 
329 aa  240  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4148  sulfate transporter subunit  42.12 
 
 
329 aa  240  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2134  thiosulphate-binding protein  42.95 
 
 
331 aa  241  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-21  decreased coverage  0.000103932 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0123  thiosulfate binding protein  42.72 
 
 
337 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000442607 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4397  sulfate transporter subunit  42.12 
 
 
329 aa  241  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4101  sulfate transporter subunit  42.12 
 
 
329 aa  240  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2077  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.71 
 
 
341 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000402733  hitchhiker  0.00000000000000351214 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5372  sulfate transporter subunit  42.12 
 
 
329 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03751  hypothetical protein  42.12 
 
 
329 aa  240  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1394  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.6 
 
 
338 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4451  sulfate transporter subunit  42.12 
 
 
329 aa  240  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4357  sulfate transporter subunit  42.12 
 
 
329 aa  240  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1578  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.54 
 
 
345 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1121  thiosulphate-binding protein  45.54 
 
 
345 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1601  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.54 
 
 
345 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0122  thiosulfate binding protein  46.15 
 
 
337 aa  240  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964738  decreased coverage  0.00000712106 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0556  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  41.9 
 
 
349 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4544  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.23 
 
 
341 aa  239  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284119  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>