217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4600 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4600  nitrogen-fixing NifU-like  100 
 
 		 158 aa  320  7e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  69.8 
 
 		 289 aa  209  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  69.8 
 
 		 289 aa  209  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  60.76 
 
 		 270 aa  206  9e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  63.29 
 
 		 309 aa  205  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3360  nitrogen-fixing NifU-like  64.52 
 
 		 173 aa  204  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.595792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  48.1 
 
 		 289 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  49.37 
 
 		 290 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  44.16 
 
 		 296 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.16 
 
 		 301 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  41.14 
 
 		 311 aa  89.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  35.9 
 
 		 291 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.7 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.05 
 
 		 86 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.29 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2142  nitrogen-fixing NifU-like protein  38.52 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2188  NifU domain-containing protein  38.52 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2129  NifU domain-containing protein  36.97 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0750308  normal  0.014165 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2542  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.67 
 
 		 306 aa  70.9  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  52.05 
 
 		 84 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.65 
 
 		 86 aa  70.1  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2358  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.05 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0398  NifU protein, putative  52.05 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.939749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  47.89 
 
 		 73 aa  68.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2015  NifU domain-containing protein  52.05 
 
 		 86 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213209  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3815  hypothetical protein  32.3 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473897  normal  0.0339082 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.95 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.84 
 
 		 73 aa  67.4  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.84 
 
 		 73 aa  67  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00755  NifU protein, putative  45.07 
 
 		 80 aa  66.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0945933  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.22 
 
 		 79 aa  67  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0419  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.68 
 
 		 86 aa  67  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0336152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.89 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.55 
 
 		 285 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  39.19 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.47 
 
 		 73 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.84 
 
 		 72 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0925  hypothetical protein  43.24 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0198354 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1326  NifU domain-containing protein  42.47 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  37.84 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  29.38 
 
 		 289 aa  61.6  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.47 
 
 		 73 aa  61.2  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  36.99 
 
 		 73 aa  60.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  43.66 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  43.66 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  43.66 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  43.66 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0047  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.54 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1525  HesB/YadR/YfhF-family protein  45.83 
 
 		 195 aa  60.5  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  40.85 
 
 		 81 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  35.8 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  40.85 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  42.86 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  40.85 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0076  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.47 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  42.03 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  41.67 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  43.66 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  43.94 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  40.28 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  43.08 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2324  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.35 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.575512  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.42 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.42 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.07 
 
 		 77 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1109  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.84 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.67 
 
 		 81 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  36.76 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.18 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  39.44 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  41.18 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.42 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2413  NifU domain-containing protein  36.57 
 
 		 297 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0708227  normal  0.256977 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  40.28 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0695  NifU domain-containing protein  44.29 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  35.21 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  38.57 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  35.62 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  40.3 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2009  hypothetical protein  43.33 
 
 		 203 aa  52.4  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  38.36 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.03 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.99 
 
 		 200 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_002936  DET1632  NifU-like protein  40.28 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000186996  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.81 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2861  nitrogen-fixing NifU-like protein  32.91 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1888  HesB/YadR/YfhF  36.11 
 
 		 196 aa  50.8  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  36.99 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4477  HesB/YadR/YfhF  38.75 
 
 		 206 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0747916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40630  hypothetical protein  36.11 
 
 		 194 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3445  hypothetical protein  36.11 
 
 		 194 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  36.99 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  36.99 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  36.99 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  36.99 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  36.99 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  36.99 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0402  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.07 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.280391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  36.99 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  36.99 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>