More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4572 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  65.56 
 
 
575 aa  723    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  83.88 
 
 
578 aa  934    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  67.16 
 
 
580 aa  721    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  100 
 
 
546 aa  1104    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  67.16 
 
 
580 aa  720    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  63.86 
 
 
582 aa  704    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  60.29 
 
 
578 aa  640    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  63.16 
 
 
550 aa  709    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09021  ABC transporter  44.75 
 
 
548 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13891  ABC transporter  47.25 
 
 
592 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1823  ATPase  45.04 
 
 
581 aa  460  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0832  ATPase  44.67 
 
 
552 aa  457  1e-127  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.423533  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10431  ABC transporter  42.54 
 
 
547 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503648  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09401  ABC transporter  42.83 
 
 
580 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107359 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  44.78 
 
 
556 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0384  multidrug ABC transporter  42.91 
 
 
578 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10661  ABC transporter  43.17 
 
 
578 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.480699  normal  0.0347251 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10431  ABC transporter  42.91 
 
 
548 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  45.02 
 
 
598 aa  441  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  44.13 
 
 
601 aa  437  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0973  multidrug ABC transporter  42.73 
 
 
568 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  45.98 
 
 
575 aa  437  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  44 
 
 
598 aa  420  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  42.8 
 
 
577 aa  420  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  42.13 
 
 
572 aa  398  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  39.64 
 
 
597 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  41.22 
 
 
598 aa  392  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  41.72 
 
 
585 aa  392  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  42.08 
 
 
582 aa  391  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  41.06 
 
 
613 aa  385  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  40.94 
 
 
597 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  39.12 
 
 
575 aa  389  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  41.17 
 
 
578 aa  383  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  39.41 
 
 
606 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  42.74 
 
 
617 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  39.7 
 
 
571 aa  382  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  42.75 
 
 
641 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  39.22 
 
 
601 aa  379  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  40 
 
 
585 aa  377  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  38.52 
 
 
584 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  38.27 
 
 
582 aa  372  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.57 
 
 
579 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  40.32 
 
 
614 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  40.28 
 
 
618 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40.27 
 
 
580 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  39.35 
 
 
587 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.8 
 
 
587 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40.55 
 
 
580 aa  369  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  37.72 
 
 
571 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  37.72 
 
 
571 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  37.52 
 
 
571 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.72 
 
 
571 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  38.95 
 
 
571 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.53 
 
 
602 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.72 
 
 
571 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  40.12 
 
 
608 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  40.75 
 
 
612 aa  366  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.72 
 
 
571 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.72 
 
 
571 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  36.68 
 
 
572 aa  365  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  36.68 
 
 
572 aa  365  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.86 
 
 
596 aa  364  2e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  40.38 
 
 
620 aa  364  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  38.83 
 
 
584 aa  365  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  40.95 
 
 
594 aa  363  4e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.52 
 
 
571 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  35.09 
 
 
594 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  37.52 
 
 
571 aa  363  6e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.52 
 
 
571 aa  363  6e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3474  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.53 
 
 
596 aa  362  7.0000000000000005e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.34 
 
 
583 aa  362  7.0000000000000005e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1782  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  37.96 
 
 
588 aa  362  8e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1783  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  37.57 
 
 
588 aa  362  1e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  40.34 
 
 
588 aa  362  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  38.03 
 
 
576 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  39.58 
 
 
567 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  39.27 
 
 
567 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  39.96 
 
 
589 aa  360  4e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.49 
 
 
572 aa  359  6e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  37.89 
 
 
636 aa  359  6e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  38.83 
 
 
597 aa  359  7e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  41.2 
 
 
582 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  37.98 
 
 
623 aa  357  2.9999999999999997e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  37.52 
 
 
617 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  38.83 
 
 
588 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  37.55 
 
 
597 aa  357  2.9999999999999997e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  35.81 
 
 
671 aa  357  3.9999999999999996e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.34 
 
 
583 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.121229  normal  0.848171 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  38.81 
 
 
578 aa  357  3.9999999999999996e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  38.81 
 
 
578 aa  357  3.9999999999999996e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  36.28 
 
 
572 aa  356  5e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  37.03 
 
 
580 aa  354  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  37.36 
 
 
644 aa  354  2e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  37.83 
 
 
607 aa  354  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.87 
 
 
600 aa  354  2e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.14 
 
 
637 aa  353  4e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  37.24 
 
 
586 aa  353  4e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.24 
 
 
586 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3781  ABC transporter, ATPase subunit  47.74 
 
 
626 aa  353  4e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.43 
 
 
586 aa  353  5e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>