287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4561 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  100 
 
 
81 aa  170  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  60 
 
 
81 aa  112  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4626  HNH endonuclease  71.01 
 
 
69 aa  110  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  62.03 
 
 
80 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  62.03 
 
 
80 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  43.94 
 
 
189 aa  62.8  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  47.83 
 
 
174 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  42.25 
 
 
174 aa  62  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  45.59 
 
 
174 aa  61.6  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  44.12 
 
 
174 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  48.15 
 
 
174 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  43.06 
 
 
167 aa  60.8  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5292  hypothetical protein  44.44 
 
 
178 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.151965 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  50 
 
 
216 aa  60.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0876  HNH nuclease  48.28 
 
 
218 aa  60.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  50 
 
 
185 aa  60.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  45.59 
 
 
186 aa  60.5  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  49.12 
 
 
171 aa  60.5  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0189  hypothetical protein  43.66 
 
 
585 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0774  normal  0.215146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  42.03 
 
 
168 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  43.86 
 
 
174 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  46.55 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  43.33 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  47.37 
 
 
168 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  42.03 
 
 
197 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  45.59 
 
 
167 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  45.61 
 
 
171 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  42.86 
 
 
172 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  41.18 
 
 
174 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  46.88 
 
 
185 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  42.42 
 
 
169 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  50 
 
 
170 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  43.86 
 
 
170 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  46.88 
 
 
185 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  40.54 
 
 
220 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  43.86 
 
 
173 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  39.68 
 
 
183 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  41.89 
 
 
179 aa  57.4  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  42.03 
 
 
189 aa  57.4  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  39.68 
 
 
183 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0844  HNH endonuclease  47.46 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  40.28 
 
 
193 aa  57  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  48.15 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  43.33 
 
 
165 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  43.28 
 
 
185 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  41.3 
 
 
198 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  46.55 
 
 
188 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  45.31 
 
 
196 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  41.67 
 
 
459 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  41.27 
 
 
181 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  45.31 
 
 
189 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  41.27 
 
 
321 aa  55.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  43.86 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  46.67 
 
 
185 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  42.86 
 
 
240 aa  56.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  37.68 
 
 
205 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  39.71 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  39.68 
 
 
177 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  39.71 
 
 
168 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  46.3 
 
 
194 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  44.44 
 
 
187 aa  55.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  38.57 
 
 
222 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  40 
 
 
169 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  42.19 
 
 
186 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  38.57 
 
 
222 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  42.65 
 
 
189 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  46.3 
 
 
194 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  38.57 
 
 
222 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  46.67 
 
 
185 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  41.18 
 
 
165 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  43.75 
 
 
186 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  38.1 
 
 
182 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3949  HNH endonuclease  45.45 
 
 
198 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  37.84 
 
 
221 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  39.34 
 
 
194 aa  54.7  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0295  hypothetical protein  40.98 
 
 
187 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0984641 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  43.86 
 
 
187 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  45 
 
 
190 aa  54.3  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  42.86 
 
 
176 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  38.1 
 
 
182 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  38.1 
 
 
182 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  45 
 
 
185 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  45 
 
 
190 aa  54.3  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  42.42 
 
 
169 aa  54.3  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  45.45 
 
 
184 aa  54.3  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  42.19 
 
 
177 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  50 
 
 
191 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  40 
 
 
459 aa  53.9  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  45.61 
 
 
169 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  38.1 
 
 
182 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  41.54 
 
 
184 aa  53.9  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  41.54 
 
 
184 aa  53.9  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  42.86 
 
 
177 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  39.71 
 
 
165 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  36.67 
 
 
552 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  37.88 
 
 
199 aa  53.5  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  37.84 
 
 
220 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  45 
 
 
185 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  44.44 
 
 
194 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  44.07 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>