More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4460 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  100 
 
 
181 aa  375  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  58.19 
 
 
169 aa  223  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  63.47 
 
 
177 aa  220  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4877  HNH endonuclease domain-containing protein  49.69 
 
 
165 aa  168  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  49.66 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  48.84 
 
 
168 aa  135  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  48.84 
 
 
197 aa  135  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  48.72 
 
 
189 aa  133  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  46.63 
 
 
168 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  42.51 
 
 
165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  43.9 
 
 
165 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  43.9 
 
 
165 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  41.76 
 
 
174 aa  123  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  38.92 
 
 
170 aa  122  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  42.18 
 
 
174 aa  120  8e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  42.07 
 
 
173 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  44.17 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  42.07 
 
 
171 aa  119  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  46.58 
 
 
170 aa  119  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  43.56 
 
 
165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  46.21 
 
 
171 aa  117  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  41.46 
 
 
174 aa  117  7.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  44.44 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  44.44 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  44.83 
 
 
173 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  42.94 
 
 
165 aa  114  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  42.95 
 
 
177 aa  115  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  44.08 
 
 
177 aa  115  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  43.54 
 
 
183 aa  114  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  43.29 
 
 
167 aa  114  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  41.96 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  42.66 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  42.76 
 
 
196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  44.06 
 
 
168 aa  111  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  42.11 
 
 
184 aa  111  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  39.39 
 
 
174 aa  111  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  37.75 
 
 
171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  45 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  40.28 
 
 
168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  41.84 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  42.07 
 
 
174 aa  108  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  41.5 
 
 
213 aa  108  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  43.45 
 
 
176 aa  107  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  40.54 
 
 
169 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  42.76 
 
 
177 aa  107  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  42.25 
 
 
220 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  41.94 
 
 
177 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  38.51 
 
 
169 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  43.54 
 
 
166 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  41.26 
 
 
187 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  35.47 
 
 
166 aa  106  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  40.26 
 
 
189 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  41.94 
 
 
177 aa  105  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  41.22 
 
 
169 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  35.91 
 
 
179 aa  105  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  42.48 
 
 
178 aa  105  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  40.28 
 
 
222 aa  104  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  40.14 
 
 
185 aa  104  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1825  HNH endonuclease  37.57 
 
 
200 aa  104  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00061732  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3551  HNH endonuclease  38.82 
 
 
166 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00264695  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  42.07 
 
 
146 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  41.55 
 
 
222 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  41.55 
 
 
222 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  41.55 
 
 
221 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  42.07 
 
 
176 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  41.55 
 
 
222 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  36.9 
 
 
174 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  40.67 
 
 
180 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  40.14 
 
 
185 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  37.36 
 
 
205 aa  102  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  45.11 
 
 
182 aa  102  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  42.36 
 
 
169 aa  102  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  38.31 
 
 
220 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  35.1 
 
 
170 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  38.73 
 
 
185 aa  101  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  37.5 
 
 
204 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  40.44 
 
 
188 aa  100  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  41.26 
 
 
160 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  40.14 
 
 
199 aa  100  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  36.88 
 
 
172 aa  99  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  39.33 
 
 
185 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  38.1 
 
 
185 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  41.3 
 
 
196 aa  98.6  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  36.36 
 
 
167 aa  99  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  41.18 
 
 
189 aa  97.8  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  38.18 
 
 
198 aa  97.8  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  38.18 
 
 
198 aa  97.8  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  49.04 
 
 
186 aa  97.1  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  39.01 
 
 
189 aa  97.1  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  37.78 
 
 
198 aa  96.7  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  39.73 
 
 
164 aa  95.5  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  38.67 
 
 
185 aa  95.1  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  38.67 
 
 
191 aa  94.7  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  41.73 
 
 
182 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  41.73 
 
 
182 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  50.56 
 
 
194 aa  94.7  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3989  HNH endonuclease  36.94 
 
 
152 aa  94.4  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.519886 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  39.29 
 
 
216 aa  94.4  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  40.71 
 
 
182 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  36.05 
 
 
185 aa  94.4  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>