More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4401 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4401  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  100 
 
 
641 aa  1332    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000108821  hitchhiker  0.00000304156 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  63.84 
 
 
594 aa  388  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0413  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  39.97 
 
 
715 aa  375  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  51.33 
 
 
1901 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  51.26 
 
 
1780 aa  363  6e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  48.08 
 
 
1850 aa  354  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  59.86 
 
 
971 aa  352  8e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.79 
 
 
494 aa  349  8e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.63 
 
 
585 aa  345  2e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  55.33 
 
 
1036 aa  343  4e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4433  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  39.4 
 
 
680 aa  343  5e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  54.63 
 
 
468 aa  342  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  54 
 
 
928 aa  338  9.999999999999999e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.31 
 
 
537 aa  337  3.9999999999999995e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.559504  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.9 
 
 
699 aa  335  1e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  47.25 
 
 
1811 aa  335  2e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  48.19 
 
 
1808 aa  333  5e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2093  histidine kinase  55.45 
 
 
468 aa  332  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0055  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  41.98 
 
 
591 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.291296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3526  histidine kinase  55.33 
 
 
458 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2466  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  50.88 
 
 
688 aa  326  6e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3721  histidine kinase  49.18 
 
 
468 aa  325  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.620219  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1669  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  55.44 
 
 
675 aa  324  3e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.532604  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.22 
 
 
1123 aa  323  5e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  55.63 
 
 
407 aa  316  7e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  52.67 
 
 
440 aa  315  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.92 
 
 
439 aa  313  5.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4267  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  56.21 
 
 
920 aa  310  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.427851  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  52.36 
 
 
1072 aa  306  8.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0124  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  49.69 
 
 
470 aa  301  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  50.17 
 
 
443 aa  299  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  49.01 
 
 
437 aa  299  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  45.35 
 
 
1741 aa  295  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3976  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  49.83 
 
 
431 aa  290  4e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0119459  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2176  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  52.94 
 
 
551 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  49.13 
 
 
1795 aa  282  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0024  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  49.02 
 
 
390 aa  281  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.114696  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  40.83 
 
 
1797 aa  280  5e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2152  histidine kinase  45.43 
 
 
342 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  41.45 
 
 
1794 aa  273  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  47.59 
 
 
1804 aa  272  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  49.45 
 
 
1934 aa  261  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  38.65 
 
 
1805 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.94 
 
 
1942 aa  256  7e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.85 
 
 
437 aa  256  7e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  48.47 
 
 
2017 aa  253  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4136  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 
440 aa  248  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000660181  hitchhiker  0.00876613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  42.63 
 
 
708 aa  243  7e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  39.32 
 
 
730 aa  228  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 
1021 aa  221  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 
589 aa  217  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  38.35 
 
 
726 aa  217  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.04 
 
 
1465 aa  217  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
611 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
611 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  37.32 
 
 
724 aa  216  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  35.94 
 
 
611 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 
602 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
594 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 
470 aa  213  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 
392 aa  209  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1074  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 
433 aa  208  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.708962  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  35.31 
 
 
626 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  39.16 
 
 
681 aa  205  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 
553 aa  204  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  39.26 
 
 
445 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  37.62 
 
 
358 aa  203  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  37.58 
 
 
715 aa  203  6e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 
1146 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5447  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 
448 aa  203  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.151261 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1911  histidine kinase  38.54 
 
 
406 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.267492 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  38.33 
 
 
408 aa  201  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  38.33 
 
 
408 aa  201  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  39.72 
 
 
1187 aa  201  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  37.75 
 
 
305 aa  201  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  34.69 
 
 
627 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  34.69 
 
 
627 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  34.69 
 
 
627 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  34.69 
 
 
627 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2312  Signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 
389 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  34.69 
 
 
627 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  34.69 
 
 
627 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0709  sensory box sensor histidine kinase  37.62 
 
 
358 aa  198  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0743  sensor histidine kinase  34.69 
 
 
627 aa  198  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2229  sensor histidine kinase  37.62 
 
 
389 aa  198  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0601  sensor histidine kinase  37.9 
 
 
389 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1660  sensory box sensor histidine kinase  37.9 
 
 
358 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1718  sensor histidine kinase  37.9 
 
 
389 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1925  sensor histidine kinase  37.9 
 
 
389 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574394  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
679 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3207  histidine kinase  36.89 
 
 
452 aa  197  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  39.36 
 
 
524 aa  195  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3474  histidine kinase  34.69 
 
 
449 aa  194  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2272  putative two-component sensor  36.21 
 
 
433 aa  191  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26810  putative two-component sensor  35.55 
 
 
371 aa  188  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1253  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 
673 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 
467 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
678 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3803  histone-like DNA-binding protein  39.61 
 
 
308 aa  184  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
467 aa  183  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>