144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4394 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
384 aa  799    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  70.3 
 
 
369 aa  545  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  62.6 
 
 
367 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  61.37 
 
 
376 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  57.3 
 
 
378 aa  424  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  30.81 
 
 
454 aa  168  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40135  predicted protein  27.48 
 
 
461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03325  saccharopine dehydrogenase  25.77 
 
 
457 aa  98.2  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2343  saccharopine dehydrogenase  23.4 
 
 
376 aa  86.3  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36377  predicted protein  24.56 
 
 
413 aa  85.5  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  24.52 
 
 
415 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1038  saccharopine dehydrogenase  27.8 
 
 
325 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.264702 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  23.99 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1148  saccharopine dehydrogenase  25.56 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  25.25 
 
 
397 aa  80.9  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  23.74 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  25 
 
 
398 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4779  saccharopine dehydrogenase  22.65 
 
 
553 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  25 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  22.73 
 
 
413 aa  73.2  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3682  hypothetical protein  30.97 
 
 
375 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4536  saccharopine dehydrogenase  23.14 
 
 
557 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.802227  normal  0.151907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5049  Saccharopine dehydrogenase  21.51 
 
 
554 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  24.18 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4996  Saccharopine dehydrogenase  22.92 
 
 
554 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  23.48 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  20.99 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1797  hypothetical protein  30.57 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0455083  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  20.58 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  22.78 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  22.59 
 
 
409 aa  67.4  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  22.79 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1138  putative transmembrane protein  22.84 
 
 
375 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  23.44 
 
 
400 aa  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  23.01 
 
 
399 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  22.19 
 
 
398 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  22.83 
 
 
399 aa  65.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1973  Saccharopine dehydrogenase  27.43 
 
 
304 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000865351  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  22.96 
 
 
401 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2221  saccharopine dehydrogenase  31.21 
 
 
375 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139161  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  24.12 
 
 
385 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  22.54 
 
 
392 aa  63.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  23.01 
 
 
398 aa  63.5  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  23.62 
 
 
405 aa  63.2  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  23.64 
 
 
403 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  24.39 
 
 
395 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  23.61 
 
 
403 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  23.7 
 
 
351 aa  62  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54900  hypothetical protein  20.16 
 
 
384 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000637066  unclonable  7.39539e-22 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  27.81 
 
 
360 aa  60.1  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0669  Saccharopine dehydrogenase  23.1 
 
 
577 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986243  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  23.2 
 
 
396 aa  59.7  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  23.08 
 
 
384 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56730  hypothetical protein  25 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  27.6 
 
 
412 aa  59.3  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3620  saccharopine dehydrogenase  25 
 
 
527 aa  57  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00695172 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  22.16 
 
 
403 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4933  hypothetical protein  25 
 
 
352 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_7  hypothetical protein  20.37 
 
 
387 aa  56.6  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2645  saccharopine dehydrogenase  21.69 
 
 
368 aa  56.2  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00207911  normal  0.116194 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  26.49 
 
 
392 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16272  predicted protein  29.01 
 
 
498 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2081  saccharopine dehydrogenase  22.83 
 
 
371 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.484567  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  22.56 
 
 
401 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  23.06 
 
 
405 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  22.39 
 
 
398 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  22.47 
 
 
426 aa  54.7  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3058  saccharopine dehydrogenase  26.94 
 
 
348 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0007  hypothetical protein  20.05 
 
 
387 aa  53.9  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.870936  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  22.57 
 
 
413 aa  53.9  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2993  saccharopine dehydrogenase  23.11 
 
 
354 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  20.88 
 
 
399 aa  53.5  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3964  Saccharopine dehydrogenase  25.17 
 
 
360 aa  53.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  22.57 
 
 
413 aa  53.1  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0108  saccharopine dehydrogenase  20.89 
 
 
550 aa  53.1  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.566304  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  22.31 
 
 
414 aa  53.1  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54890  hypothetical protein  22.76 
 
 
634 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000285931  unclonable  1.9973799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  28.19 
 
 
413 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  27.66 
 
 
414 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  24.54 
 
 
365 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  27.66 
 
 
414 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0007  saccharopine dehydrogenase  24.18 
 
 
387 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  23.81 
 
 
367 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  22.53 
 
 
414 aa  51.6  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1643  saccharopine dehydrogenase  22.54 
 
 
382 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  22.22 
 
 
355 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7476  putative saccharopine dehydrogenase  26.79 
 
 
414 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  26.32 
 
 
367 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4764  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  27.13 
 
 
410 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0528  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  25.21 
 
 
414 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  23.42 
 
 
408 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  25.69 
 
 
407 aa  50.4  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  22.06 
 
 
417 aa  50.1  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  20.75 
 
 
401 aa  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5681  saccharopine dehydrogenase  25.89 
 
 
416 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6045  saccharopine dehydrogenase  25.89 
 
 
416 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.233405 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  25.45 
 
 
413 aa  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  22.61 
 
 
399 aa  49.7  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0541  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  21.31 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0723  Saccharopine dehydrogenase  20.86 
 
 
574 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554623  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>