More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4369 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  91.18 
 
 		 205 aa  389  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  75.9 
 
 		 196 aa  300  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  72.45 
 
 		 212 aa  290  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  72.45 
 
 		 212 aa  290  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 197 aa  89  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2103  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  25.52 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  31.66 
 
 		 421 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  63.83 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000716  transcriptional regulator  60.78 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.421465  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  25.74 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 232 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 219 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 219 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 219 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  55.77 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  59.57 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  59.57 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0016  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  56.25 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  56.25 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  31.3 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0829  transcriptional regulator, TetR family  21.13 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  54 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1430  regulatory protein TetR  58.93 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  52 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0258  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.569121  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  24.5 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 332 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>